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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2iux | ||||||
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タイトル | Human tACE mutant g1234 | ||||||
要素 | ANGIOTENSIN-CONVERTING ENZYMEアンジオテンシン変換酵素 | ||||||
キーワード | HYDROLASE (加水分解酵素) / GLYCOSIDASE / POLYMORPHISM / GLYCOPROTEIN (糖タンパク質) / METAL-BINDING / ALTERNATIVE SPLICING (選択的スプライシング) / METALLOPROTEASE (金属プロテアーゼ) / PHOSPHORYLATION (リン酸化) / AC / ZINC (亜鉛) / MEMBRANE (生体膜) / CHLORIDE (塩化物) / PROTEASE (プロテアーゼ) / TYPE-I MEMBRANE-ANCHORED PROTEIN / CARBOXYPEPTIDASE / PEPTIDYL DIPEPTIDASE (アンジオテンシン変換酵素) / TRANSMEMBRANE (膜貫通型タンパク質) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 mononuclear cell proliferation / cell proliferation in bone marrow / tripeptidyl-peptidase activity / bradykinin receptor binding / regulation of angiotensin metabolic process / exopeptidase activity / substance P catabolic process / response to laminar fluid shear stress / アンジオテンシン変換酵素 / regulation of renal output by angiotensin ...mononuclear cell proliferation / cell proliferation in bone marrow / tripeptidyl-peptidase activity / bradykinin receptor binding / regulation of angiotensin metabolic process / exopeptidase activity / substance P catabolic process / response to laminar fluid shear stress / アンジオテンシン変換酵素 / regulation of renal output by angiotensin / negative regulation of calcium ion import / positive regulation of peptidyl-cysteine S-nitrosylation / positive regulation of systemic arterial blood pressure / negative regulation of gap junction assembly / metallodipeptidase activity / cellular response to aldosterone / hormone catabolic process / bradykinin catabolic process / angiogenesis involved in coronary vascular morphogenesis / response to thyroid hormone / negative regulation of glucose import / 血管収縮 / neutrophil mediated immunity / hormone metabolic process / regulation of hematopoietic stem cell proliferation / regulation of smooth muscle cell migration / antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I / mitogen-activated protein kinase binding / embryo development ending in birth or egg hatching / positive regulation of neurogenesis / chloride ion binding / mitogen-activated protein kinase kinase binding / eating behavior / arachidonic acid secretion / post-transcriptional regulation of gene expression / lung alveolus development / peptide catabolic process / heterocyclic compound binding / heart contraction / response to dexamethasone / regulation of heart rate by cardiac conduction / regulation of systemic arterial blood pressure by renin-angiotensin / regulation of vasoconstriction / peptidyl-dipeptidase activity / angiotensin maturation / hematopoietic stem cell differentiation / blood vessel remodeling / Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins / animal organ regeneration / amyloid-beta metabolic process / carboxypeptidase activity / positive regulation of vasoconstriction / sperm midpiece / blood vessel diameter maintenance / response to nutrient levels / basal plasma membrane / kidney development / female pregnancy / angiotensin-activated signaling pathway / cellular response to glucose stimulus / brush border membrane / regulation of synaptic plasticity / metalloendopeptidase activity / 血圧 / male gonad development / metallopeptidase activity / actin binding / peptidase activity / 精子形成 / endopeptidase activity / response to lipopolysaccharide / リソソーム / response to hypoxia / calmodulin binding / エンドソーム / response to xenobiotic stimulus / positive regulation of apoptotic process / external side of plasma membrane / negative regulation of gene expression / タンパク質分解 / extracellular space / extracellular exosome / zinc ion binding / extracellular region / 細胞膜 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | HOMO SAPIENS (ヒト) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / その他 / 解像度: 2.8 Å | ||||||
データ登録者 | Watermeyer, J.M. / Swell, B.T. / Natesh, R. / Corradi, H.R. / Acharya, K.R. / Sturrock, E.D. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2006 タイトル: Structure of Testis Ace Glycosylation Mutants and Evidence for Conserved Domain Movement. 著者: Watermeyer, J.M. / Sewell, B.T. / Schwager, S.L. / Natesh, R. / Corradi, H.R. / Acharya, K.R. / Sturrock, E.D. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2iux.cif.gz | 124.3 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2iux.ent.gz | 99.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2iux.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/iu/2iux ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/iu/2iux | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
-タンパク質 / 糖 , 2種, 3分子 A
#1: タンパク質 | 分子量: 68325.242 Da / 分子数: 1 / 断片: RESIDUES 68-658 / 変異: YES / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) HOMO SAPIENS (ヒト) / 細胞株 (発現宿主): CHINESE HAMSTER OVARY CELLS 発現宿主: CRICETULUS GRISEUS (モンゴルキヌゲネズミ) 参照: UniProt: P22966, UniProt: P12821*PLUS, 加水分解酵素; 糖加水分解酵素; 配糖体結合加水分解酵素または糖加水分解酵素, アンジオテンシン変換酵素 |
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#2: 糖 |
-非ポリマー , 5種, 38分子
#3: 化合物 | ChemComp-ACT / | ||||
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#4: 化合物 | ChemComp-ZN / | ||||
#5: 化合物 | #6: 化合物 | ChemComp-NXA / | #7: 水 | ChemComp-HOH / | |
-詳細
構成要素の詳細 | ENGINEERED |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.4 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.32 % |
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結晶化 | pH: 4.7 詳細: 0.1M SODIUM ACETATE PH4.7 15% PEG 4000, 10UM ZINC SULPHATE, pH 4.70 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: シンクロトロン / サイト: SRS / ビームライン: PX14.1 / 波長: 1.488 |
検出器 | タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.488 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.8→50 Å / Num. obs: 13572 / % possible obs: 83.6 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 39 % / Rmerge(I) obs: 0.11 / Net I/σ(I): 7.7 |
反射 シェル | 解像度: 2.8→2.9 Å / Rmerge(I) obs: 0.34 / Mean I/σ(I) obs: 2.8 / % possible all: 80.4 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: その他 / 解像度: 2.8→50 Å / Data cutoff high absF: 10000 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: MLF
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溶媒の処理 | Bsol: 14.8386 Å2 / ksol: 0.361842 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 20 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.8→50 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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