登録情報 | データベース: PDB / ID: 2dp6 |
---|
タイトル | Crystal structure of uracil-DNA glycosylase in complex with AP:C containing DNA |
---|
要素 | - 5'-D(*AP*TP*GP*TP*TP*GP*CP*(D1P)P*TP*TP*AP*GP*TP*CP*C)-3'
- 5'-D(*GP*GP*AP*CP*TP*AP*AP*CP*GP*CP*AP*AP*CP*A)-3'
- uracil-DNA glycosylase
|
---|
キーワード | HYDROLASE/DNA / base excision repair (塩基除去修復) / uracil-DNA glycosylase / Iron/Sulfer cluster / DNA complex (デオキシリボ核酸) / Thermophile (好熱菌) / Structural Genomics (構造ゲノミクス) / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI / HYDROLASE-DNA COMPLEX |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報 |
---|
生物種 | Thermus thermophilus (サーマス・サーモフィルス) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.8 Å |
---|
データ登録者 | Kosaka, H. / Nakagawa, N. / Masui, R. / Kuramitsu, S. / Hoseki, J. / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) |
---|
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Structure of Family 5 Uracil-DNA Glycosylase Bound to DNA Reveals Insights into the Mechanism for Substrate Recognition and Catalysis 著者: Kosaka, H. / Nakagawa, N. / Masui, R. / Kuramitsu, S. |
---|
履歴 | 登録 | 2006年5月7日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
---|
改定 1.0 | 2007年5月22日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
---|
改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Source and taxonomy / Version format compliance |
---|
改定 1.3 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_conn_type / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
---|
|
---|