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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ula | |||||||||
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タイトル | APPLICATION OF CRYSTALLOGRAPHIC AND MODELING METHODS IN THE DESIGN OF PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE INHIBITORS | |||||||||
要素 | PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE | |||||||||
キーワード | PENTOSYLTRANSFERASE | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 nicotinamide riboside catabolic process / Defective PNP disrupts phosphorolysis of (deoxy)guanosine and (deoxy)inosine / purine-containing compound salvage / deoxyinosine catabolic process / purine nucleobase binding / inosine catabolic process / deoxyadenosine catabolic process / dAMP catabolic process / nucleotide biosynthetic process / urate biosynthetic process ...nicotinamide riboside catabolic process / Defective PNP disrupts phosphorolysis of (deoxy)guanosine and (deoxy)inosine / purine-containing compound salvage / deoxyinosine catabolic process / purine nucleobase binding / inosine catabolic process / deoxyadenosine catabolic process / dAMP catabolic process / nucleotide biosynthetic process / urate biosynthetic process / Ribavirin ADME / IMP catabolic process / nucleoside binding / guanosine phosphorylase activity / Purine catabolism / allantoin metabolic process / Purine salvage / purine-nucleoside phosphorylase / purine-nucleoside phosphorylase activity / nucleobase-containing compound metabolic process / purine ribonucleoside salvage / positive regulation of alpha-beta T cell differentiation / phosphate ion binding / positive regulation of T cell proliferation / positive regulation of interleukin-2 production / secretory granule lumen / ficolin-1-rich granule lumen / 免疫応答 / response to xenobiotic stimulus / Neutrophil degranulation / extracellular exosome / extracellular region / identical protein binding / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | |||||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.75 Å | |||||||||
データ登録者 | Ealick, S.E. / Rule, S.A. / Carter, D.C. / Greenhough, T.J. / Babu, Y.S. / Cook, W.J. / Habash, J. / Helliwell, J.R. / Stoeckler, J.D. / Parksjunior, R.E. ...Ealick, S.E. / Rule, S.A. / Carter, D.C. / Greenhough, T.J. / Babu, Y.S. / Cook, W.J. / Habash, J. / Helliwell, J.R. / Stoeckler, J.D. / Parksjunior, R.E. / Chen, S.-F. / Bugg, C.E. | |||||||||
引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 1991 タイトル: Application of crystallographic and modeling methods in the design of purine nucleoside phosphorylase inhibitors. 著者: Ealick, S.E. / Babu, Y.S. / Bugg, C.E. / Erion, M.D. / Guida, W.C. / Montgomery, J.A. / Secrist 3rd., J.A. #1: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1990 タイトル: Three-Dimensional Structure of Human Erythrocytic Purine Nucleoside Phosphorylase at 3.2 Angstroms Resolution 著者: Ealick, S.E. / Rule, S.A. / Carter, D.C. / Greenhough, T.J. / Babu, Y.S. / Cook, W.J. / Habash, J. / Helliwell, J.R. / Stoeckler, J.D. / Parksjunior, R.E. / Chen, S.-F. / Bugg, C.E. #2: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1981 タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Investigation of Human Erythrocyte Purine Nucleoside Phosphorylase 著者: Cook, W.J. / Ealick, S.E. / Bugg, C.E. / Stoeckler, J.D. / Parksjunior, R.E. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1ula.cif.gz | 67.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1ula.ent.gz | 51 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1ula.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ul/1ula ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ul/1ula | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 32184.877 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P00491, purine-nucleoside phosphorylase |
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#2: 化合物 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 5.04 Å3/Da / 溶媒含有率: 75.61 % |
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結晶化 | *PLUS 手法: unknown |
-解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | Rfactor obs: 0.202 / 最高解像度: 2.75 Å | ||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.75 Å
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拘束条件 |
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