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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1tum | ||||||
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タイトル | MUTT PYROPHOSPHOHYDROLASE-METAL-NUCLEOTIDE-METAL COMPLEX, NMR, 16 STRUCTURES | ||||||
要素 | MUTATOR MUTT PROTEIN | ||||||
キーワード | MUTATOR PROTEIN / QUATERNARY COMPLEX (第四紀) / NUCLEOSIDE TRIPHOSPHATE PYROPHOSPHOHYDROLASE / MUTT PYROPHOSPHOHYDROLASE-METAL-SUBSTRATE ANALOG COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 dGDP catabolic process / 8-oxo-dGTP diphosphatase / 8-oxo-GDP phosphatase activity / 8-oxo-dGDP phosphatase activity / dGTP catabolic process / 8-oxo-7,8-dihydrodeoxyguanosine triphosphate pyrophosphatase activity / 8-oxo-7,8-dihydroguanosine triphosphate pyrophosphatase activity / nucleotide-excision repair / manganese ion binding / DNA複製 ...dGDP catabolic process / 8-oxo-dGTP diphosphatase / 8-oxo-GDP phosphatase activity / 8-oxo-dGDP phosphatase activity / dGTP catabolic process / 8-oxo-7,8-dihydrodeoxyguanosine triphosphate pyrophosphatase activity / 8-oxo-7,8-dihydroguanosine triphosphate pyrophosphatase activity / nucleotide-excision repair / manganese ion binding / DNA複製 / DNA修復 / magnesium ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Lin, J. / Abeygunawardana, C. / Frick, D.N. / Bessman, M.J. / Mildvan, A.S. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1997 タイトル: Solution structure of the quaternary MutT-M2+-AMPCPP-M2+ complex and mechanism of its pyrophosphohydrolase action. 著者: Lin, J. / Abeygunawardana, C. / Frick, D.N. / Bessman, M.J. / Mildvan, A.S. #1: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1995 タイトル: NMR Studies of the Conformations and Location of Nucleotides Bound to the E.Coli Mutt Enzyme 著者: Frick, D.N. / Weber, D.J. / Abeygunawardana, C. / Gittis, A.G. / Bessman, M.J. / Mildvan, A.S. #2: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1995 タイトル: Solution Structure of the Mutt Enzyme, a Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase 著者: Abeygunawardana, C. / Weber, D.J. / Gittis, A.G. / Frick, D.N. / Lin, J. / Miller, A.F. / Bessman, M.J. / Mildvan, A.S. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1tum.cif.gz | 679.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1tum.ent.gz | 582.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1tum.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tu/1tum ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tu/1tum | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14945.029 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: MUTT-MG(2+)-AMPCPP-MG(2+) COMPLEX / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 株: K12-I7023 / プラスミド: PET MUTT, T7 PROMOTER / 遺伝子 (発現宿主): MUTT / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): HMS174 (DE3) 参照: UniProt: P08337, 加水分解酵素; 酸無水物に作用; リン含有酸無水物に作用 |
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#2: 化合物 | ChemComp-MG / |
#3: 化合物 | ChemComp-APC / |
#4: 化合物 | ChemComp-CON / |
#5: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
試料状態 | pH: 7.6 / 温度: 305 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-解析
ソフトウェア |
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NMR software | 名称: X-PLOR / バージョン: 3.1 / 開発者: BRUNGER / 分類: 精密化 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 16 |