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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1fxi | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF THE [2FE-2S] FERREDOXIN I FROM THE BLUE-GREEN ALGA APHANOTHECE SACRUM AT 2.2 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
要素 | FERREDOXIN Iフェレドキシン | ||||||
キーワード | ELECTRON TRANSFER (IRON-SULFUR PROTEIN) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Aphanothece sacrum (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.2 Å | ||||||
データ登録者 | Tsukihara, T. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1990 タイトル: Structure of the [2Fe-2S] ferredoxin I from the blue-green alga Aphanothece sacrum at 2.2 A resolution. 著者: Tsukihara, T. / Fukuyama, K. / Mizushima, M. / Harioka, T. / Kusunoki, M. / Katsube, Y. / Hase, T. / Matsubara, H. #1: ジャーナル: J.Biochem.(Tokyo) / 年: 1983 タイトル: Main Chain Fold of a [2Fe-2S] Ferredoxin I from Aphanothece Sacrum at 2.5 Angstroms Resolution 著者: Tsutsui, T. / Tsukihara, T. / Fukuyama, K. / Katsube, Y. / Hase, T. / Matsubara, H. / Nishikawa, Y. / Tanaka, N. #2: ジャーナル: J.Biochem.(Tokyo) / 年: 1978 タイトル: Crystallization and a 5 Angstroms X-Ray Diffraction Study of Aphanothece Sacrum Ferredoxin 著者: Kunita, A. / Koshibe, M. / Nishikawa, Y. / Fukuyama, K. / Tsukihara, T. / Katsube, Y. / Matsuura, Y. / Tanaka, N. / Kakudo, M. / Hase, T. / Matsubara, H. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1fxi.cif.gz | 91.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1fxi.ent.gz | 64.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1fxi.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fx/1fxi ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fx/1fxi | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10314.291 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Aphanothece sacrum (バクテリア) / 参照: UniProt: P00250 #2: 化合物 | ChemComp-FES / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.45 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.81 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / 手法: microdialysis / 詳細: Kunita, A., (1978) J.Biochem.(Tokyo), 84, 989. | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS Num. obs: 21790 / Num. measured all: 42249 |
-解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.2→6 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→6 Å
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拘束条件 |
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