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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1epl | ||||||
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タイトル | A STRUCTURAL COMPARISON OF 21 INHIBITOR COMPLEXES OF THE ASPARTIC PROTEINASE FROM ENDOTHIA PARASITICA | ||||||
要素 |
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キーワード | HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / ACID PROTEINASE (プロテアーゼ) / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Cryphonectria parasitica (クリ胴枯病) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2 Å | ||||||
データ登録者 | Al-Karadaghi, S. / Cooper, J.B. / Strop, P. / Blundell, T.L. | ||||||
引用 | ジャーナル: Protein Sci. / 年: 1994 タイトル: A structural comparison of 21 inhibitor complexes of the aspartic proteinase from Endothia parasitica. 著者: Bailey, D. / Cooper, J.B. #1: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1990 タイトル: The 3D Structure at 2 Angstroms Resolution of Endothiapepsin 著者: Blundell, T.L. / Jenkins, J. / Sewell, B.T. / Pearl, L.H. / Cooper, J.B. / Tickle, I.J. / Veerapandian, B. / Wood, S.P. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1epl.cif.gz | 74.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1epl.ent.gz | 57.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1epl.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ep/1epl ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ep/1epl | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO E 23 / 2: CIS PROLINE - PRO E 133 3: THR E 318 - THR E 319 OMEGA = 149.01 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 33813.855 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Cryphonectria parasitica (クリ胴枯病) 参照: UniProt: P11838, エンドチアペプシン |
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#2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 818.980 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
非ポリマーの詳細 | RESIDUE I 4 IS A STANDARD PRO. RESIDUE I 3 IS A STANDARD LEU. RESIDUE I 2 IS A STANDARD GLU. ...RESIDUE I 4 IS A STANDARD PRO. RESIDUE I 3 IS A STANDARD LEU. RESIDUE I 2 IS A STANDARD GLU. RESIDUE I 1 (PSA) IS A PHENYLSTAT |
配列の詳細 | RESIDUES 63A, 80A, 134A, 184A, 203A, 204A, 238A, 282A, 282B, AND 319A IN CHAIN E ARE INSERTIONS ...RESIDUES 63A, 80A, 134A, 184A, 203A, 204A, 238A, 282A, 282B, AND 319A IN CHAIN E ARE INSERTIONS |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.47 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.25 % |
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結晶化 | *PLUS 手法: unknown |
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
-解析
ソフトウェア | 名称: RESTRAIN / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2→8 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→8 Å
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拘束条件 |
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