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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 10000000000 | ||||||
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タイトル | [2Fe-2S]-Ferredoxin from Halobacterium salinarum | ||||||
要素 | FERREDOXINフェレドキシン | ||||||
キーワード | IRON-SULFUR PROTEIN (鉄硫黄タンパク質) / FERREDOXIN (フェレドキシン) / HALOBACTERIUM SALINARUM / HALOPHILIC | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | HALOBACTERIUM HALOBIUM (好塩性) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Marg, B.-L. / Schweimer, K. / Oesterhelt, D. / Roesch, P. / Sticht, H. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2005 タイトル: A Two-Alpha-Helix Extra Domain Mediates the Halophilic Character of a Plant-Type Ferredoxin from Halophilic Archaea. 著者: Marg, B. / Schweimer, K. / Sticht, H. / Oesterhelt, D. #1: ジャーナル: J.Biomol.NMR / 年: 2000 タイトル: Sequence-Specific 1H, 13C and 15N Resonance Assignments and Secondary Structure of [2Fe-2S] Ferredoxin from Halobacterium Salinarum 著者: Schweimer, K. / Marg, B.-L. / Oesterhelt, D. / Roesch, P. / Sticht, H. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1e10.cif.gz | 756.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1e10.ent.gz | 654 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1e10.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/e1/1e10 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/e1/1e10 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14295.544 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) HALOBACTERIUM HALOBIUM (好塩性) / 参照: UniProt: P00216 |
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#2: 化合物 | ChemComp-ACE / |
#3: 化合物 | ChemComp-FES / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING HETERONUCLEAR MULTIDIMENSIONAL NMR USING 15N- AND 13C,15N LABELED FERREDOXIN SAMPLES |
-試料調製
詳細 | 内容: 10% WATER/90% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 500 mM / pH: 6.4 / 圧: 1 atm / 温度: 288 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. FOR RESIDUES 60-71, 87, AND 100-104 NO NMR DISTANCE RESTRAINTS WERE OBTAINED BECAUSE OF THE PROXIMITY TO THE PARAMAGNETIC IRON- ...詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. FOR RESIDUES 60-71, 87, AND 100-104 NO NMR DISTANCE RESTRAINTS WERE OBTAINED BECAUSE OF THE PROXIMITY TO THE PARAMAGNETIC IRON-SULFUR CLUSTER. THE CORRESPONDING RESIDUES WERE NOT RESTRAINED DURING THE STRUCTURE CALCULATION AND ARE THEREFORE ILL-DEFINED. | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST RESTRAINT VIOLATION, LOWEST ENERGY 計算したコンフォーマーの数: 60 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |