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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1cqu | ||||||
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タイトル | SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF RIBOSOMAL PROTEIN L9 | ||||||
要素 | 50S RIBOSOMAL PROTEIN L9 | ||||||
キーワード | RIBOSOME (リボソーム) / PROTEIN L9 | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 rRNA binding / リボソーム / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / 翻訳 (生物学) 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) | ||||||
手法 | 溶液NMR / DISTANCE GEOMETRY SIMULATED ANNEALING | ||||||
データ登録者 | Hua, Y. / Kuhlman, B. / Hoffman, D. / Raleigh, D.P. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1999 タイトル: Effects of varying the local propensity to form secondary structure on the stability and folding kinetics of a rapid folding mixed alpha/beta protein: characterization of a truncation ...タイトル: Effects of varying the local propensity to form secondary structure on the stability and folding kinetics of a rapid folding mixed alpha/beta protein: characterization of a truncation mutant of the N-terminal domain of the ribosomal protein L9. 著者: Luisi, D.L. / Kuhlman, B. / Sideras, K. / Evans, P.A. / Raleigh, D.P. #1: ジャーナル: Eur.J.Biochem. / 年: 1994 タイトル: Crystal Structure of Prokaryotic Ribosomal Protein L9: A Bi-Lobed RNA-Binding Protein 著者: Hoffman, D.W. / Cameron, C. / Davies, C. / Gerchman, S.E. / Kycia, J.H. / Porter, S. / Ramakrishnan, V. / White, S.W. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1cqu.cif.gz | 315.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1cqu.ent.gz | 273.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1cqu.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cq/1cqu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cq/1cqu | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6231.309 Da / 分子数: 1 / 断片: N-TERMINAL DOMAIN / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) 参照: UniProt: P02417 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | タイプ: 2D NOESY |
-試料調製
試料状態 | pH: 5.0 / 圧: AMBIENT / 温度: 298 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: DISTANCE GEOMETRY SIMULATED ANNEALING / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 18 |