+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1b9r | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | TERPREDOXIN FROM PSEUDOMONAS SP. | ||||||
要素 | PROTEIN (TERPREDOXIN) | ||||||
キーワード | FERREDOXIN / STRUCTURE FROM MOLMOL | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Pseudomonas sp. (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / distance geometry | ||||||
データ登録者 | Mo, H. / Pochapsky, S.S. / Pochapsky, T.C. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1999 タイトル: A model for the solution structure of oxidized terpredoxin, a Fe2S2 ferredoxin from Pseudomonas. 著者: Mo, H. / Pochapsky, S.S. / Pochapsky, T.C. #1: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1992 タイトル: Cytochrome P-450terp. Isolation and Purification of the Protein and Cloning and Sequencing of its Operon. 著者: Peterson, J.A. / Lu, J.Y. / Geisselsoder, J. / Graham-Lorence, S. / Carmona, C. / Witney, F. / Lorence, M.C. | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1b9r.cif.gz | 449.3 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb1b9r.ent.gz | 370.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1b9r.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1b9r_validation.pdf.gz | 364 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | 1b9r_full_validation.pdf.gz | 531.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1b9r_validation.xml.gz | 66.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1b9r_validation.cif.gz | 88.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b9/1b9r ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b9/1b9r | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11101.370 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Pseudomonas sp. (バクテリア) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) PLYSS / 参照: UniProt: P33007 |
---|---|
#2: 化合物 | ChemComp-FES / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
| ||||||||||||||||
NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING DOUBLE-RESONANCE NMR SPECTROSCOPY ON 15N- LABELED TERPREDOXIN |
-試料調製
試料状態 | pH: 7.4 / 圧: 1 atm / 温度: 290 K |
---|---|
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AMX500 / 製造業者: Bruker / モデル: AMX500 / 磁場強度: 500 MHz |
---|
-解析
NMR software |
| ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: distance geometry / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST RESTRAINT VIOLATION 計算したコンフォーマーの数: 150 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |