+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1b4o | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | NMR STUDY OF SSO7D MUTANT (F31A) MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE | ||||||
要素 | ENDORIBONUCLEASE P2 | ||||||
キーワード | DNA BINDING PROTEIN (DNA結合タンパク質) / RNASE AND DNA-BINDING PROTEIN / THERMOSTABLE RIBONUCLEASE / SULFOLOBUS SOLFATARICUS / DNA-BINDING PROTEIN (DNA結合タンパク質) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Sulfolobus solfataricus (古細菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Consonni, R. / Santomo, L. / Zetta, L. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1999 タイトル: A single-point mutation in the extreme heat- and pressure-resistant sso7d protein from sulfolobus solfataricus leads to a major rearrangement of the hydrophobic core. 著者: Consonni, R. / Santomo, L. / Fusi, P. / Tortora, P. / Zetta, L. #1: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1998 タイトル: Differential Scanning Calorimetry Study of the Thermodynamic Stability of Some Mutants of Sso7D from Sulfolobus Solfataricus 著者: Catanzano, F. / Graziano, G. / Fusi, P. / Tortora, P. / Barone, G. #2: ジャーナル: Proteins / 年: 1997 タイトル: Extreme Heat-and Pressure-Resistant 7-kDa Protein P2 from the Archaeon Sulfolobus Solfataricus is Dramatically Destabilized by a Single-Point Amino Acid Substitution 著者: Fusi, P. / Goossens, K. / Consonni, R. / Grisa, M. / Puricelli, P. / Vecchio, G. / Vanoni, M. / Zetta, L. / Heremans, K. / Tortora, P. | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1b4o.cif.gz | 26.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb1b4o.ent.gz | 20.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1b4o.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b4/1b4o ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b4/1b4o | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6958.127 Da / 分子数: 1 / 変異: F31A / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sulfolobus solfataricus (古細菌) / プラスミド: PT7-7 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 (DE3) PLYSE 参照: UniProt: P61991, 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 3'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
| ||||||||||||||||
NMR実験の詳細 | Text: THE MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE WAS DETERMINED USING 22 SELECTED CONFORMERS |
-試料調製
詳細 | 内容: H2O |
---|---|
試料状態 | pH: 4.5 / 温度: 300 K |
結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DMX / 製造業者: Bruker / モデル: DMX / 磁場強度: 500 MHz |
---|
-解析
NMR software |
| ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LOWEST ENERGY TERM / 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |