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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDBE7 |
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試料 | ESX-5 type VII secretion system protein EccC5
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 |
生物種 | Mycobacterium xenopi RIVM700367 (バクテリア) |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #823 | タイプ: mix / ソフトウェア: EOM (2.1) / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / コメント: Ensemble member of EOM selected / カイ2乗値: 1.010 / P-value: 0.900000 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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モデル #824 | タイプ: mix / ソフトウェア: EOM (2.1) / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: p1 / コメント: Ensemble member of EOM selected / カイ2乗値: 1.010 / P-value: 0.900000 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #825 | タイプ: mix / ソフトウェア: EOM (2.1) / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: p1 / コメント: Ensemble member of EOM selected / カイ2乗値: 1.010 / P-value: 0.900000 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #826 | タイプ: mix / ソフトウェア: EOM (2.1) / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: p1 / コメント: Ensemble member of EOM selected / カイ2乗値: 1.010 / P-value: 0.900000 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #827 | タイプ: mix / ソフトウェア: EOM (2.1) / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / コメント: Ensemble member of EOM selected / カイ2乗値: 1.010 / P-value: 0.900000 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #828 | タイプ: mix / ソフトウェア: EOM (2.1) / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / コメント: Ensemble member of EOM selected / カイ2乗値: 1.010 / P-value: 0.900000 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #829 | タイプ: mix / ソフトウェア: EOM (2.1) / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / コメント: Ensemble member of EOM selected / カイ2乗値: 1.010 / P-value: 0.900000 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #822 | タイプ: dummy / ソフトウェア: DAMMIF/DAMMIN / ダミー原子の半径: 5.00 A / 対称性: P1 / コメント: refined model in dammin / カイ2乗値: 0.946 / P-value: 0.240000 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: ESX-5 type VII secretion system protein EccC5 / 試料濃度: 0.39-0.39 |
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バッファ | 名称: 20 mM Tris 200 mM NaCl 5%(v/v) Glycerol / pH: 8 |
要素 #460 | 名称: EccC5 / タイプ: protein / 記述: ESX-5 type VII secretion system protein EccC5 / 分子量: 142.453 / 分子数: 1 / 由来: Mycobacterium xenopi RIVM700367 / 参照: UniProt: I0RZI0 配列: KLDAMRAQFM LMLDMLRETA QESADSMDAN YRWFHPAPTT LAAAVGSSRM WERQPDGKDL NFGVVRVGVG MTRPEVTWGE PQNMPTDIEL EPVTGKALQE FGRYQSVVYN LPKMVSLLVE PWYSLVGERE QVLGLTRAII CQLAFSHGPD HVQMIVVTSD PDRWDWVKWI ...配列: KLDAMRAQFM LMLDMLRETA QESADSMDAN YRWFHPAPTT LAAAVGSSRM WERQPDGKDL NFGVVRVGVG MTRPEVTWGE PQNMPTDIEL EPVTGKALQE FGRYQSVVYN LPKMVSLLVE PWYSLVGERE QVLGLTRAII CQLAFSHGPD HVQMIVVTSD PDRWDWVKWI PHFGDPRRRD AAGNARMVYT SVREFATEQA ELFAGRGSFT PRHASSSAET PTPHHVIISD IEDPQWEYVI SSEGVDGVTF FDLTGSPLWT GAPQRVLRFT DSAGVIETLP RDRDTWMVID DNAWFFALAD QMSEADAEQF AHQMAHWRLA EAYEEIGQRV VQLGARDILS YYGIDDAGEI DFNTLWSGSG RRDLLSRSRL RIPFGNRADN GELLFLDMKS LDEGGDGPHG VMSGTTGSGK SSLVRTVIAS LMLAHPPEEL QFVLADLKGG SAVKPFDGVP HVSRIITDLE DDQALMERFL EAMWGEIARR KEICFSAGVD GAKEYNELRA RMKARGEDMP PLPMLVVVID EFYEWFRIMP TAVDVLDSIG RQGRAYWVHL MMASQTIESR AEKLMENMGY RLVLKAQTAG AAQAAGVPNA VNLPSQAGLG YFRKSGDEII RFQAEYLWRD YRRGSSYDGE EQAPLTHSVD YIRPQLFTTA FAPLEVSVSG PDGQSALPQV VDGEAVNGHR GGDDVDEEEE ALRTPKVGTV IIDQLRQIDF EPYRLWHPPL DVPVPIDELV NRFLGRPWQQ DYGTAKNLVF PIGIIDRPYK HDQPPWTVDT SGAGANVLIL GAGGAGKTTA LQTLICAAAL THTPEQVQFY CLAYSGTALT TVANLPHVGG VSGPTDPYGV RRTVAEVLGL VRDRKRSFLE YDVPSMEVFR RRKFGGEPGG VPDDGFGDVY LVIDNYRALA EENEVLIEQV NQIINQGPSF GVHVVATADR ESELRPPVRS GFGSRVELRL AAVEDAKLVR SRFAKDVPPK PGRGMVAVNY VRLDSDPQAG LHTLVARPAL GSTPDAVFES DSVAAAVRQV AAGEARPVRR LPARFGLDQL RQVAAADRRQ GVGAGGIAWA ISELDLQPVY LNFADNAHLM VTGRRECGRT TTLATIMSEI GRIYAPGAST APPTSRPSAQ VWLVDPRRQL LTVLGSDYVE KFAYNLDGVA AMMDDLAAAL ARREPPPGLS AEELLSRSWW SGPEIFLIID DIQQLPPGFD SPLHKAAPWV TRAADVGLHV FVTRTFGGWS SAGSDPILRA LHQANAPLLV MDADPDEGFI RGKMKGGPLP RGRGLLMAED TGVFVQVAAT DLRR |
-実験情報
ビーム | 設備名称: PETRA III P12 / 地域: Hamburg / 国: Germany / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.124 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 3.3 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 2M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: ESX-5 type VII secretion system protein EccC5 / 測定日: 2016年7月15日 / 保管温度: 10 °C / セル温度: 20 °C / 照射時間: 0.045 sec. / フレーム数: 20 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 578 /
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結果 | カーブのタイプ: single_conc コメント: Note: The data set presented in this entry was measured from is single fraction from an offline size-exclusion chromatography (SEC) purification.
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