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基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDB95 |
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![]() | Shigella outer membrane protein IcsA autotransporter
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機能・相同性 | ![]() cell tip / cell outer membrane / periplasmic space / cell adhesion / cell surface / extracellular region 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | ![]() |
![]() | ![]() タイトル: The Shigella Virulence Factor IcsA Relieves N-WASP Autoinhibition by Displacing the VCA Domain 著者: Mauricio R / Jeffries C / Svergun D |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #558 | ![]() タイプ: dummy / ソフトウェア: DAMMIN / ダミー原子の半径: 3.40 A / カイ2乗値: 1.858 / P-value: 0.841000 ![]() |
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モデル #559 | ![]() タイプ: dummy / ソフトウェア: GASBOR / ダミー原子の半径: 1.90 A / カイ2乗値: 1.86 / P-value: 0.841000 ![]() |
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試料
![]() | 名称: Shigella outer membrane protein IcsA autotransporter |
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バッファ | 名称: Tris / 濃度: 50.00 mM / pH: 7.4 / 組成: 150 mM NaCl, 10 mM CaCl2, 3% v/v glycerol |
要素 #385 | 名称: IcsA / タイプ: protein / 記述: Outer membrane protein IcsA (53-758) / 分子量: 72.476 / 分子数: 1 / 由来: Shigella flexneri / 参照: UniProt: Q7BCK4 配列: TPLSGTQELH FSEDNYEKLL TPVDGLSPLG AGEDGMDAWY ITSSNPSHAS RTKLRINSDI MISAGHGGAG DNNDGNSCGG NGGDSITGSD LSIINQGMIL GGSGGSGADH NGDGGEAVTG DNLFIINGEI ISGGHGGDSY SDSDGGNGGD AVTGVNLPII NKGTISGGNG ...配列: TPLSGTQELH FSEDNYEKLL TPVDGLSPLG AGEDGMDAWY ITSSNPSHAS RTKLRINSDI MISAGHGGAG DNNDGNSCGG NGGDSITGSD LSIINQGMIL GGSGGSGADH NGDGGEAVTG DNLFIINGEI ISGGHGGDSY SDSDGGNGGD AVTGVNLPII NKGTISGGNG GNNYGEGDGG NGGDAITGSS LSVINKGTFA GGNGGAAYGY GYDGYGGNAI TGDNLSVINN GAILGGNGGH WGDAINGSNM TIANSGYIIS GKEDDGTQNV AGNAIHITGG NNSLILHEGS VITGDVQVNN SSILKIINND YTGTTPTIEG DLCAGDCTTV SLSGNKFTVS GDVSFGENSS LNLAGISSLE ASGNMSFGNN VKVEAIINNW AQKDYKLLSA DKGITGFSVS NISIINPLLT TGAIDYTKSY ISDQNKLIYG LSWNDTDGDS HGEFNLKENA ELTVSTILAD NLSHHNINSW DGKSLTKSGE GTLILAEKNT YSGFTNINAG ILKMGTVEAM TRTAGVIVNK GATLNFSGMN QTVNTLLNSG TVLINNINAP FLPDPVIVTG NMTLEKNGHV ILNNSSSNVG QTYVQKGNWH GKGGILSLGA VLGNDNSKTD RLEIAGHASG ITYVAVTNEG GSGDKTLEGV QIISTDSSDK NAFIQKGRIV AGSYDYRLKQ GTVSGLNTNK WYLTSQMDNQ ESKQMSNQES TQMSSR |
-実験情報
ビーム | 設備名称: PETRA III P12 / 地域: Hamburg / 国: Germany ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 2M | |||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン |
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距離分布関数 P(R) |
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結果 | コメント: The bead models displayed for IcsA are individual/representative low-resolution structural examples calculated using DAMMIN or GASBOR. A cohort of individual GASBOR and DAMMIN models ...コメント: The bead models displayed for IcsA are individual/representative low-resolution structural examples calculated using DAMMIN or GASBOR. A cohort of individual GASBOR and DAMMIN models are supplied in the full entry zip archive and include the average DAMMIN-based spatial representation of IcsA in solution (damfilt.pdb; NSD = 0.7). Individual reduced SEC-SAXS data frames/blocks and Rg/I(0) analysis through the IcsA elution peak are included in the full entry zip archive.
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