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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDBJ2 |
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試料 | Wild-type archaeal biofilm regulator 1 (ABfR1) bound to 40bp dsDNA-Sa oligonucleotide.
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機能・相同性 | Transcription regulator TrmB, N-terminal / Sugar-specific transcriptional regulator TrmB / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / Transcriptional regulator ArsR family 機能・相同性情報 |
生物種 | Sulfolobus acidocaldarius (好気性・好酸性) |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #400 | タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 4.20 A / カイ2乗値: 1.547 / P-value: 0.000002 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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-試料
試料 | 名称: Wild-type archaeal biofilm regulator 1 (ABfR1) bound to 40bp dsDNA-Sa oligonucleotide. 試料濃度: 3.5 mg/ml / Entity id: 262 / 263 |
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バッファ | 名称: 0.5 x Tris/Borate/EDTA (TBE) / 濃度: 0.50 v/v |
要素 #262 | 名称: dsDNA-Sa Oligo / タイプ: DNA / 記述: 40bp long dsDNA-Sa Oligonucleotide / 分子量: 24.7 / 分子数: 1 配列: GTAGTAAGAT TTAAAAAAAC ATACTAAGAT ATAAATTAAC |
要素 #263 | 名称: ABfR1-WT / タイプ: protein 記述: Wild-type archaeal biofilm regulator 1 (ABfR1: Transcriptional regulator ArsR family). 分子量: 13.16 / 分子数: 2 / 由来: Sulfolobus acidocaldarius / 参照: UniProt: Q4JBH1 配列: MSIEITEKYV ILKRFLSVAY GLSESEIDTF LRILESKEGK DIDAISAELK ISKSRTSIIL KKLSDAGLVD KEKGDNMKGG RPKYVYSVNK EELKNRLIAK SEELCKELNQ VIKSFI |
-実験情報
ビーム | 設備名称: ESRF BM29 / 地域: Grenoble / 国: France / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.93 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.43 mm | ||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 1M | ||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: WT archaeal biofilm regulator 1 (ABfR1) + DNA / 測定日: 2015年8月27日 / 保管温度: 4 °C / セル温度: 4 °C / 照射時間: 20 sec. / フレーム数: 10 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 455 /
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結果 | カーブのタイプ: single_conc /
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