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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDD88 |
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試料 | The BRCT domain from Mycobacterium tuberculosis DNA ligase
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 DNA ligase (NAD+) / DNA ligase (NAD+) activity / base-excision repair, DNA ligation / DNA ligation / peptidoglycan-based cell wall / DNA replication / magnesium ion binding / plasma membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Mycobacterium tuberculosis (結核菌) |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #2056 | タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 1.30 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 0.785 / P-value: 0.000494 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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モデル #2058 | タイプ: atomic / 対称性: P1 / カイ2乗値: 4.49835837712976 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #2091 | タイプ: atomic / ダミー原子の半径: 1.90 A / カイ2乗値: 2.79002473758130 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: The BRCT domain from Mycobacterium tuberculosis DNA ligase 試料濃度: 10 mg/ml |
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バッファ | 名称: 50 mM Tris-HCl 500 mM NaCl 5mM β-mercaptoethanol / pH: 8 |
要素 #1092 | 名称: BRCT / タイプ: protein / 記述: M.tb. LigA BRCT domain (DNA ligase A) / 分子量: 9.449 / 分子数: 1 / 由来: Mycobacterium tuberculosis / 参照: UniProt: P9WNV1 配列: VDERDESVPR TLAGLTIVVT GSLTGFSRDD AKEAIVARGG KAAGSVSKKT NYVVAGDSPG SKYDKAVELG VPILDEDGFR RLLADGPASR T |
-実験情報
ビーム | 設備名称: CSIR-Central Drug Research Institute Anton Paar SAXSpace 地域: Lucknow / 国: India / 線源: X-ray in house / 波長: 0.154 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 0.3171 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Mythen2 R 1K / タイプ: Hybrid Photon Counting (HPC) | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: The BRCT domain from Mycobacterium tuberculosis DNA ligase 測定日: 2018年6月2日 / 保管温度: 10 °C / セル温度: 10 °C / 照射時間: 1800 sec. / フレーム数: 2 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 1055 /
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結果 | カーブのタイプ: single_conc コメント: The experimental molecular weight quoted for this entry was evaluated using calibrated size-exclusion chromatography (GE Healthcare Superdex75 10/30 column). The atomistic models ...コメント: The experimental molecular weight quoted for this entry was evaluated using calibrated size-exclusion chromatography (GE Healthcare Superdex75 10/30 column). The atomistic models displayed in this entry (ribbon format) are a parent Phyre2 protein homology model (top) and one of ten structures obtained from the parent after elNémo normal mode calculations (bottom). Refer to: Kelley et al. (2015) Nature Protocols 10, 845-858; Suhre & Sanejouand (2004) Nucleic Acids Res. 32(Web Server issue): W610–W614.
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