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基本情報
| 登録情報 | データベース: PDB / ID: 9v7i | |||||||||||||||||||||
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| タイトル | Phycobilisome rod R3 from Gloeobacter violaceus PCC 7421 | |||||||||||||||||||||
要素 |
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キーワード | PHOTOSYNTHESIS / Phycobilisome | |||||||||||||||||||||
| 機能・相同性 | 機能・相同性情報 | |||||||||||||||||||||
| 生物種 | Gloeobacter violaceus PCC 7421 (バクテリア) | |||||||||||||||||||||
| 手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.03 Å | |||||||||||||||||||||
データ登録者 | Burtseva, A.D. / Baymukhametov, T.N. / Slonimskiy, Y.B. / Popov, V.O. / Sluchanko, N.N. / Boyko, K.M. | |||||||||||||||||||||
| 資金援助 | ロシア, 1件
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引用 | ジャーナル: Sci Adv / 年: 2025タイトル: Structure and quenching of a bundle-shaped phycobilisome. 著者: Anna D Burtseva / Yury B Slonimskiy / Timur N Baymukhametov / Maria A Sinetova / Daniil A Gvozdev / Georgy V Tsoraev / Dmitry A Cherepanov / Eugene G Maksimov / Vladimir O Popov / Konstantin ...著者: Anna D Burtseva / Yury B Slonimskiy / Timur N Baymukhametov / Maria A Sinetova / Daniil A Gvozdev / Georgy V Tsoraev / Dmitry A Cherepanov / Eugene G Maksimov / Vladimir O Popov / Konstantin M Boyko / Nikolai N Sluchanko / ![]() 要旨: Cyanobacteria use soluble antenna megacomplexes, phycobilisomes (PBSs), to maximize light-harvesting efficiency and small photoswitchable orange carotenoid proteins (OCPs) to down-regulate PBSs in ...Cyanobacteria use soluble antenna megacomplexes, phycobilisomes (PBSs), to maximize light-harvesting efficiency and small photoswitchable orange carotenoid proteins (OCPs) to down-regulate PBSs in high light. Among known PBS morphologies, the one from the basal cyanobacterial genus still lacks detailed structural characterization. Here, we reconstructed a cryo-electron microscopy structure of the >10-megadalton PBS, with diverging, conformationally mobile bundles of rods composed of stacked phycoerythrin and phycocyanin hexamers, stemming from a pentacylindrical allophycocyanin core belted by auxiliary phycocyanin hexamers. We show how two -specific multidomain linker proteins, Glr1262 and Glr2806, maintain this bundle-shaped architecture and reveal its differential regulation via nonphotochemical quenching by two OCP types of that recognize separate binding sites within the allophycocyanin core, including lateral cylinders absent in tricylindrical cores. | |||||||||||||||||||||
| 履歴 |
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構造の表示
| 構造ビューア | 分子: Molmil Jmol/JSmol |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
| PDBx/mmCIF形式 | 9v7i.cif.gz | 845.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
|---|---|---|---|---|
| PDB形式 | pdb9v7i.ent.gz | 685.6 KB | 表示 | PDB形式 |
| PDBx/mmJSON形式 | 9v7i.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
| その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
| 文書・要旨 | 9v7i_validation.pdf.gz | 3.4 MB | 表示 | wwPDB検証レポート |
|---|---|---|---|---|
| 文書・詳細版 | 9v7i_full_validation.pdf.gz | 3.6 MB | 表示 | |
| XML形式データ | 9v7i_validation.xml.gz | 164.3 KB | 表示 | |
| CIF形式データ | 9v7i_validation.cif.gz | 226.1 KB | 表示 | |
| アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/v7/9v7i ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/v7/9v7i | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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| 非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
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Gloeobacter violaceus PCC 7421 (バクテリア)
ロシア, 1件
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