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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 9rnt | ||||||
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タイトル | RIBONUCLEASE T1 WITH FREE RECOGNITION AND CATALYTIC SITE: CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS AT 1.5 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | RIBONUCLEASE T1 | ||||||
![]() | HYDROLASE(ENDORIBONUCLEASE) | ||||||
機能・相同性 | ![]() hyphal tip / ribonuclease T1 activity / ribonuclease T1 / cell septum / endonuclease activity / lyase activity / RNA binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Martinez-Oyanedel, J. / Heinemann, U. / Saenger, W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Ribonuclease T1 with free recognition and catalytic site: crystal structure analysis at 1.5 A resolution. 著者: Martinez-Oyanedel, J. / Choe, H.W. / Heinemann, U. / Saenger, W. #1: ![]() タイトル: Crystal Structure of Guanosine-Free Ribonuclease T1, Complexed with Vanadate(V), Suggests Conformational Change Upon Substrate Binding 著者: Kostrewa, D. / Choe, H.-W. / Heinemann, U. / Saenger, W. #2: ![]() タイトル: Three-Dimensional Structure of the Ribonuclease T1(Asterisk)2'-Gmp Complex at 1.9-Angstroms Resolution 著者: Arni, R. / Heinemann, U. / Tokuoka, R. / Saenger, W. #3: ![]() タイトル: Specific Protein-Nucleic Acid Recognition in Ribonuclease T1-2'-Guanylic Acid Complex. An X-Ray Study 著者: Heinemann, U. / Saenger, W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 31.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 23.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 406.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 413.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUES PRO 39 AND PRO 55 ARE CIS PROLINES. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11094.694 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-CA / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.09 Å3/Da / 溶媒含有率: 41.23 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.5 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. obs: 13115 / % possible obs: 84.5 % / Num. measured all: 17624 / Rmerge F obs: 1 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PROFFT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.5→6 Å / σ(F): 0 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.5→6 Å
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拘束条件 |
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