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Yorodumi- PDB-9f41: Crystal structure of the NTD domain from S. cerevisia Niemann-Pic... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 9f41 | ||||||||||||
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Title | Crystal structure of the NTD domain from S. cerevisia Niemann-Pick type C protein NCR1 with cholesterol bound | ||||||||||||
Components | NPC intracellular sterol transporter 1-related protein 1 | ||||||||||||
Keywords | MEMBRANE PROTEIN / cholesterol / vacuole / NCR1 / Niemann-Pick type C protein | ||||||||||||
Function / homology | Function and homology information Intestinal lipid absorption / LDL clearance / sterol transport / sterol binding / sphingolipid metabolic process / fungal-type vacuole membrane / cholesterol binding / cholesterol homeostasis / endoplasmic reticulum / membrane / plasma membrane Similarity search - Function | ||||||||||||
Biological species | Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast) | ||||||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.64 Å | ||||||||||||
Authors | Nel, L. / Olesen, E. / Frain, K.M. / Pedersen, B.P. | ||||||||||||
Funding support | Denmark, European Union, 3items
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Citation | Journal: To Be Published Title: Structural and biochemical analysis of ligand binding in yeast Niemann-Pick type C 1-related protein Authors: Jamecna, D. / Thaysen, K. / Nel, L. / Olesen, E. / Szomek, M. / Frain, K.M. / Langer, J. / Pedersen, B.P. / Wustner, D. / Hoglinger, D. | ||||||||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 9f41.cif.gz | 502.6 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb9f41.ent.gz | 356 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 9f41.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 9f41_validation.pdf.gz | 4.5 MB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 9f41_full_validation.pdf.gz | 4.5 MB | Display | |
Data in XML | 9f41_validation.xml.gz | 41 KB | Display | |
Data in CIF | 9f41_validation.cif.gz | 55.1 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f4/9f41 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f4/9f41 | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 9f40C C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data | Similarity search - Function & homologyF&H Search |
Experimental dataset #1 | Data reference: 10.51093/xrd-00256 / Data set type: diffraction image data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Components on special symmetry positions |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Ens-ID: ens_1
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