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- PDB-9b62: Human RANBP2/RAN(GTP)/RANGAP1-SUMO1/UBC9/CRM1/RAN(GTP) - composit... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 9b62
タイトルHuman RANBP2/RAN(GTP)/RANGAP1-SUMO1/UBC9/CRM1/RAN(GTP) - composite map and model
要素
  • E3 SUMO-protein ligase RanBP2
  • Exportin-1
  • GTP-binding nuclear protein Ran
  • Ran GTPase-activating protein 1
  • SUMO-conjugating enzyme UBC9
  • Small ubiquitin-related modifier 1
キーワードTRANSPORT PROTEIN / karyopherin / SUMO E3 / SUMO E2 / transporter / GTPase / GTPase activating protein / exportin / G-protein
機能・相同性
機能・相同性情報


cellular response to triglyceride / cellular response to salt / cellular response to vasopressin / SUMO conjugating enzyme activity / cytoplasmic periphery of the nuclear pore complex / HuR (ELAVL1) binds and stabilizes mRNA / RING-like zinc finger domain binding / SUMO ligase complex / negative regulation of potassium ion transmembrane transporter activity / SUMO ligase activity ...cellular response to triglyceride / cellular response to salt / cellular response to vasopressin / SUMO conjugating enzyme activity / cytoplasmic periphery of the nuclear pore complex / HuR (ELAVL1) binds and stabilizes mRNA / RING-like zinc finger domain binding / SUMO ligase complex / negative regulation of potassium ion transmembrane transporter activity / SUMO ligase activity / protein localization to nuclear pore / : / transferase complex / annulate lamellae / SUMOylation of nuclear envelope proteins / HLH domain binding / SUMO is proteolytically processed / Negative regulation of activity of TFAP2 (AP-2) family transcription factors / SUMO is conjugated to E1 (UBA2:SAE1) / regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process / negative regulation of delayed rectifier potassium channel activity / PML body organization / negative regulation of DNA binding / SUMO is transferred from E1 to E2 (UBE2I, UBC9) / negative regulation of action potential / nuclear stress granule / Vitamin D (calciferol) metabolism / pre-miRNA export from nucleus / RNA nuclear export complex / nuclear pore cytoplasmic filaments / mitotic nuclear membrane reassembly / snRNA import into nucleus / synaptonemal complex / regulation of centrosome duplication / nuclear export signal receptor activity / manchette / cellular response to mineralocorticoid stimulus / nuclear inclusion body / small protein activating enzyme binding / Nuclear Pore Complex (NPC) Disassembly / nuclear pore nuclear basket / Transport of Ribonucleoproteins into the Host Nucleus / Regulation of Glucokinase by Glucokinase Regulatory Protein / Defective TPR may confer susceptibility towards thyroid papillary carcinoma (TPC) / Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) / activation of GTPase activity / SUMOylation of DNA methylation proteins / Transport of the SLBP independent Mature mRNA / SUMOylation of immune response proteins / importin-alpha family protein binding / NS1 Mediated Effects on Host Pathways / Transport of the SLBP Dependant Mature mRNA / XY body / NLS-bearing protein import into nucleus / SUMOylation of SUMOylation proteins / regulation of protein export from nucleus / regulation of calcium ion transmembrane transport / Transport of Mature mRNA Derived from an Intronless Transcript / protein localization to nucleolus / negative regulation of protein export from nucleus / Maturation of nucleoprotein / Rev-mediated nuclear export of HIV RNA / nuclear export / Nuclear import of Rev protein / SUMOylation of RNA binding proteins / NEP/NS2 Interacts with the Cellular Export Machinery / kinase activator activity / 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基を移すもの / GTP metabolic process / regulation of cardiac muscle cell contraction / SUMO transferase activity / Transport of Mature mRNA derived from an Intron-Containing Transcript / tRNA processing in the nucleus / Postmitotic nuclear pore complex (NPC) reformation / aggresome / nucleocytoplasmic transport / Maturation of nucleoprotein / centrosome localization / MicroRNA (miRNA) biogenesis / regulation of gluconeogenesis / Viral Messenger RNA Synthesis / DNA metabolic process / negative regulation of protein import into nucleus / SUMOylation of ubiquitinylation proteins / transcription factor binding / ubiquitin-specific protease binding / Vpr-mediated nuclear import of PICs / Maturation of hRSV A proteins / dynein intermediate chain binding / cellular response to cadmium ion / ubiquitin-like protein ligase binding / roof of mouth development / SUMOylation of transcription factors / mitotic sister chromatid segregation / SUMOylation of DNA replication proteins / protein sumoylation / ribosomal large subunit export from nucleus / spermatid development / Estrogen-dependent nuclear events downstream of ESR-membrane signaling / Regulation of HSF1-mediated heat shock response
類似検索 - 分子機能
Ran-GTPase activating protein 1, C-terminal / Ran-GTPase activating protein 1, C-terminal domain superfamily / RanGAP1 C-terminal domain / : / Nup358/RanBP2 E3 ligase domain / Nup358/RanBP2 E3 ligase domain / Small ubiquitin-related modifier 1, Ubl domain / Exportin-1, repeat 3 / Chromosome region maintenance repeat / Exportin-1, repeat 2 ...Ran-GTPase activating protein 1, C-terminal / Ran-GTPase activating protein 1, C-terminal domain superfamily / RanGAP1 C-terminal domain / : / Nup358/RanBP2 E3 ligase domain / Nup358/RanBP2 E3 ligase domain / Small ubiquitin-related modifier 1, Ubl domain / Exportin-1, repeat 3 / Chromosome region maintenance repeat / Exportin-1, repeat 2 / Chromosome region maintenance or exportin repeat / CRM1 / Exportin repeat 2 / CRM1 / Exportin repeat 3 / CRM1 C terminal / Exportin-1, C-terminal / CRM1 C terminal / Exportin-1/5 / Exportin-1/Importin-beta-like / Exportin 1-like protein / Ran binding protein RanBP1-like / Ran binding domain / RanBP1 domain / Ran binding domain type 1 profile. / Ran-binding domain / Ran GTPase / Small GTPase Ran-type domain profile. / Importin-beta N-terminal domain / Importin-beta N-terminal domain / Importin-beta N-terminal domain profile. / Importin-beta, N-terminal domain / Rad60/SUMO-like domain / Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like / Leucine rich repeat, ribonuclease inhibitor type / : / Zinc finger domain / Leucine Rich repeat / Zn-finger in Ran binding protein and others / Zinc finger RanBP2 type profile. / Zinc finger, RanBP2-type superfamily / Zinc finger RanBP2-type signature. / Zinc finger, RanBP2-type / Ubiquitin-conjugating enzyme, active site / Ubiquitin-conjugating (UBC) active site signature. / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, conserved site / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase signature. / Ubiquitin-conjugating enzyme E2 / Ubiquitin-conjugating enzyme / Ubiquitin-conjugating (UBC) core domain profile. / Ubiquitin-conjugating enzyme E2, catalytic domain homologues / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain profile. / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain / Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD / Cyclophilin-like domain superfamily / Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like / Ran (Ras-related nuclear proteins) /TC4 subfamily of small GTPases / TPR repeat region circular profile. / TPR repeat profile. / Tetratricopeptide repeats / Tetratricopeptide repeat / Leucine-rich repeat / Rho (Ras homology) subfamily of Ras-like small GTPases / Ras subfamily of RAS small GTPases / Small GTPase / Ras family / Rab subfamily of small GTPases / Leucine-rich repeat domain superfamily / Armadillo-like helical / Ubiquitin homologues / Ubiquitin domain profile. / Ubiquitin-like domain / Small GTP-binding protein domain / Tetratricopeptide-like helical domain superfamily / PH-like domain superfamily / Armadillo-type fold / Ubiquitin-like domain superfamily / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
類似検索 - ドメイン・相同性
GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / Exportin-1 / Ran GTPase-activating protein 1 / E3 SUMO-protein ligase RanBP2 / GTP-binding nuclear protein Ran / Small ubiquitin-related modifier 1 / SUMO-conjugating enzyme UBC9
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.9 Å
データ登録者Lima, C.D. / DiMattia, M.A.
資金援助 米国, 2件
組織認可番号国
Howard Hughes Medical Institute (HHMI) 米国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)GM118080 米国
引用ジャーナル: Nat Commun / 年: 2025
タイトル: Structural basis for a nucleoporin exportin complex between RanBP2, SUMO1-RanGAP1, the E2 Ubc9, Crm1 and the Ran GTPase.
著者: Vladimir Baytshtok / Michael A DiMattia / Christopher D Lima /
要旨: The human nucleoporin RanBP2/Nup358 interacts with SUMO1-modified RanGAP1 and the SUMO E2 Ubc9 at the nuclear pore complex (NPC) to promote export and disassembly of exportin Crm1/Ran(GTP)/cargo ...The human nucleoporin RanBP2/Nup358 interacts with SUMO1-modified RanGAP1 and the SUMO E2 Ubc9 at the nuclear pore complex (NPC) to promote export and disassembly of exportin Crm1/Ran(GTP)/cargo complexes. In mitosis, RanBP2/SUMO1-RanGAP1/Ubc9 remains intact after NPC disassembly and is recruited to kinetochores and mitotic spindles by Crm1 where it contributes to mitotic progression. RanBP2 binds SUMO1-RanGAP1/Ubc9 via motifs that also catalyze SUMO E3 ligase activity. Here, we resolve cryo-EM structures of a RanBP2 C-terminal fragment in complex with Crm1, SUMO1-RanGAP1/Ubc9, and two molecules of Ran(GTP). These structures reveal several interactions with Crm1 including a nuclear export signal (NES) for RanGAP1, the deletion of which mislocalizes RanGAP1 and the Ran GTPase in cells. Our structural and biochemical results support models in which RanBP2 E3 ligase activity is dependent on Crm1, the RanGAP1 NES and Ran GTPase cycling.
履歴
登録2024年3月23日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02024年10月16日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12025年4月30日Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author / em_admin
Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _citation_author.identifier_ORCID / _em_admin.last_update
改定 1.22025年7月23日Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author / em_admin
Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _citation_author.identifier_ORCID / _em_admin.last_update
改定 1.32025年7月30日Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / em_admin
Item: _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed ..._citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _em_admin.last_update

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: Exportin-1
B: GTP-binding nuclear protein Ran
C: SUMO-conjugating enzyme UBC9
D: Small ubiquitin-related modifier 1
E: E3 SUMO-protein ligase RanBP2
F: GTP-binding nuclear protein Ran
G: Ran GTPase-activating protein 1
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)337,26211
ポリマ－336,1677
非ポリマー1,0954
水00
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者が定義した集合体
  • 根拠: gel filtration, co-migrates as a 1:1:1:1:1:2 complex between Nup358/RanBP2:RanGAP1-SUMO1:UBC9:CRM1:RAN, cross-linking, Substochimetric crosslinking used. While cross-linking can occur between ...根拠: gel filtration, co-migrates as a 1:1:1:1:1:2 complex between Nup358/RanBP2:RanGAP1-SUMO1:UBC9:CRM1:RAN, cross-linking, Substochimetric crosslinking used. While cross-linking can occur between all of the subunits, SDS-PAGE analysis of the crosslinked material suggests substochiometric crosslinking with most of the material not shifted or crosslinked, 電子顕微鏡法, Structure determined by single particle cryo-EM revealed the expected assembly (and subcomplexes)
タイプ名称対称操作数
identity operation1_5551

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要素

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タンパク質 , 6種, 7分子 ABFCDEG

#1: タンパク質 Exportin-1 / Exp1 / Chromosome region maintenance 1 protein homolog


分子量: 123874.781 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
詳細: SHM N-terminal amino acids remnants of expression tag
由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: XPO1, CRM1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: O14980
#2: タンパク質 GTP-binding nuclear protein Ran / Androgen receptor-associated protein 24 / GTPase Ran / Ras-like protein TC4 / Ras-related nuclear protein


分子量: 25012.764 Da / 分子数: 2 / Mutation: Q69L / 由来タイプ: 組換発現
詳細: GSHMAS N-terminal amino acids residual after removal of purification epitope tag
由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: RAN, ARA24, OK/SW-cl.81 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
参照: UniProt: P62826, 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与
#3: タンパク質 SUMO-conjugating enzyme UBC9 / RING-type E3 SUMO transferase UBC9 / SUMO-protein ligase / Ubiquitin carrier protein 9 / Ubiquitin ...RING-type E3 SUMO transferase UBC9 / SUMO-protein ligase / Ubiquitin carrier protein 9 / Ubiquitin carrier protein I / Ubiquitin-conjugating enzyme E2 I / Ubiquitin-protein ligase I / p18


分子量: 18313.092 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
詳細: GSH N-terminal amino acids left over after cleavage of affinity tag
由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: UBE2I, UBC9, UBCE9 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
参照: UniProt: P63279, 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基を移すもの
#4: タンパク質 Small ubiquitin-related modifier 1 / SUMO-1 / GAP-modifying protein 1 / GMP1 / SMT3 homolog 3 / Sentrin / Ubiquitin-homology domain ...SUMO-1 / GAP-modifying protein 1 / GMP1 / SMT3 homolog 3 / Sentrin / Ubiquitin-homology domain protein PIC1 / Ubiquitin-like protein SMT3C / Smt3C / Ubiquitin-like protein UBL1


分子量: 11532.003 Da / 分子数: 1 / Mutation: Q94P / 由来タイプ: 組換発現
詳細: GSHM N-terminal amino acids left over after cleavage of affinity tag
由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: SUMO1, SMT3C, SMT3H3, UBL1, OK/SW-cl.43 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P63165
#5: タンパク質 E3 SUMO-protein ligase RanBP2 / 358 kDa nucleoporin / Nuclear pore complex protein Nup358 / Nucleoporin Nup358 / Ran-binding ...358 kDa nucleoporin / Nuclear pore complex protein Nup358 / Nucleoporin Nup358 / Ran-binding protein 2 / RanBP2 / p270


分子量: 68399.422 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
詳細: GSH N-terminal amino acids left after cleavage of affinity tag The residues that are misaligned in your alignment should be aligned to residue 66 with a gap after. please fix
由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: RANBP2, NUP358 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
参照: UniProt: P49792, 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基を移すもの
#6: タンパク質 Ran GTPase-activating protein 1 / RanGAP1


分子量: 64022.172 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
詳細: GSHM N-terminal amino acids left after cleavage of affinity tag
由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: RANGAP1, KIAA1835, SD / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P46060

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非ポリマー , 2種, 4分子

#7: 化合物 ChemComp-GTP / GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP


分子量: 523.180 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C10H16N5O14P3 / コメント: GTP, エネルギー貯蔵分子*YM
#8: 化合物 ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン


分子量: 24.305 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg

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詳細

研究の焦点であるリガンドがあるかN
Has protein modificationN

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実験情報

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実験

実験手法: 電子顕微鏡法
EM実験試料の集合状態: PARTICLE / ３次元再構成法: 単粒子再構成法

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試料調製

構成要素名称: Human RANBP2/RAN(GTP)/RANGAP1-SUMO1/UBC9/CRM1/RAN(GTP) complex
タイプ: COMPLEX
詳細: SUMO1 Gly97 is covalently linked to RANGAP1 Lys524 through a isopeptide bond
Entity ID: #1-#6 / 由来: RECOMBINANT
分子量実験値: NO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
由来(組換発現)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
緩衝液pH: 8
詳細: 20 mM Tris-Cl pH 8.0, 50 mM NaCl, 0.1 mM TCEP supplemented with 0.02% (v/v) IGEPAL CA-630
試料濃度: 8 mg/ml / 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES / 詳細: Gel filtered - sample was monodisperse
急速凍結装置: FEI VITROBOT MARK IV / 凍結剤: ETHANE / 湿度: 100 % / 凍結前の試料温度: 295 K / 詳細: 30 s wait time, blot for 2.5 s before plunging

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電子顕微鏡撮影

実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company
顕微鏡モデル: FEI TITAN KRIOS
電子銃電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM
電子レンズモード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 3000 nm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1000 nm / Cs: 2.7 mm
試料ホルダ凍結剤: NITROGEN
試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
撮影平均露光時間: 10 sec. / 電子線照射量: 85.2 e/Å2 / 検出モード: SUPER-RESOLUTION
フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)

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解析

EMソフトウェア
ID名称バージョンカテゴリ
1RELION粒子像選択
2SerialEM画像取得
4GctfCTF補正
9PHENIX1.19.2_4158:モデル精密化
CTF補正タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
粒子像の選択選択した粒子像数: 895509
詳細: This is a composite map so numbers of particles per map component differs - after selection of particles containing Crm1 there were 704835 unique particles - after selection of particles ...詳細: This is a composite map so numbers of particles per map component differs - after selection of particles containing Crm1 there were 704835 unique particles - after selection of particles containing Crm1-Ran(GTP) there were 534708 unique particles
3次元再構成解像度: 2.9 Å / 解像度の算出法: OTHER / 粒子像の数: 534708
詳細: Composite map - estimated best average resolution of FR maps 2.9 Related particles and maps used to generate the composite listed in Related Entries
対称性のタイプ: POINT
原子モデル構築プロトコル: OTHER / 空間: REAL
詳細: Atomic model was manually fit and refined using composite map, and manually inspected using Coot
原子モデル構築
IDPDB-ID 3D fitting-IDAccession codeInitial refinement model-IDSource nameタイプ
13uin

3uin

13uin1PDBexperimental model
23gjx

3gjx

13gjx2PDBexperimental model
34l6e

4l6e

14l6e3PDBexperimental model
41k5d

1k5d

11k5d4PDBexperimental model
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
ELECTRON MICROSCOPYf_bond_d0.00319677
ELECTRON MICROSCOPYf_angle_d0.43626627
ELECTRON MICROSCOPYf_dihedral_angle_d10.5897337
ELECTRON MICROSCOPYf_chiral_restr0.0373006
ELECTRON MICROSCOPYf_plane_restr0.0033405

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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