PDB-8xfd: Crystal structure of pyruvate kinase tetramer in complex with all...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 8xfd

タイトル

Crystal structure of pyruvate kinase tetramer in complex with allosteric activator, Mitapivat (MTPV, AG-348)

要素

Isoform L-type of Pyruvate kinase PKLR

キーワード

TRANSFERASE / pyruvate kinase / allosteric activator / Mitapivat / AG-348

機能・相同性

機能・相同性情報

pyruvate kinase complex / pyruvate biosynthetic process / SARS-CoV-1-host interactions / ChREBP activates metabolic gene expression / pyruvate kinase / pyruvate kinase activity / Pyruvate metabolism / monosaccharide binding / response to metal ion / Glycolysis ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.1 Å

データ登録者

Sun, R. / Achour, A.

資金援助

1件

引用

ジャーナル: Crystals / 年: 2024
タイトル: High Resolution Crystal Structure of the Pyruvate Kinase Tetramer in Complex with the Allosteric Activator Mitapivat/AG-348
著者: Han, X. / Sandalova, T. / Zhang, C. / Mardinoglu, A. / Achour, A. / Sun, R.

履歴

登録	2023年12月13日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2024年5月15日	Provider: repository / タイプ: Initial release

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	8xfd.cif.gz	954.1 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb8xfd.ent.gz	659.9 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	8xfd.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/xf/8xfd ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/xf/8xfd	HTTPS FTP

-
関連構造データ

類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
実験データセット #1	データ参照: 10.15151/ESRF-ES-998474512 / データの種類: diffraction image data

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#50 - 2004年2月解糖系酵素 (Glycolytic Enzymes) 類似性 (15) #102 - 2008年6月乳酸脱水素酵素 (Lactate Dehydrogenase) 類似性 (1) #194 - 2016年2月人工設計インスリン (Designer Insulins) 類似性 (1) #257 - 2021年5月胎児ヘモグロビン (Fetal Hemoglobin) 類似性 (1) #14 - 2001年2月インスリン (Insulin) 類似性 (1) #222 - 2018年6月タンパク質とナノ粒子 (Proteins and Nanoparticles) 類似性 (1)

PDBのページ

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NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#50 - 2004年2月
解糖系酵素 (Glycolytic Enzymes)
類似性 (15)
#102 - 2008年6月
乳酸脱水素酵素 (Lactate Dehydrogenase)
類似性 (1)
#194 - 2016年2月
人工設計インスリン (Designer Insulins)
類似性 (1)
#257 - 2021年5月
胎児ヘモグロビン (Fetal Hemoglobin)
類似性 (1)
#14 - 2001年2月
インスリン (Insulin)
類似性 (1)
#222 - 2018年6月
タンパク質とナノ粒子 (Proteins and Nanoparticles)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Isoform L-type of Pyruvate kinase PKLR

B: Isoform L-type of Pyruvate kinase PKLR

C: Isoform L-type of Pyruvate kinase PKLR

D: Isoform L-type of Pyruvate kinase PKLR

ヘテロ分子

237 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration

単位格子

Length a, b, c (Å)	84.930, 86.962, 91.554
Angle α, β, γ (deg.)	76.780, 66.880, 80.220
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1
Space group name Hall	P1
Symmetry operation	#1: x,y,z

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
d_1	ens_1	(chain "A" and (resid 24 through 134 or resid 140 through 199 or resid 202 through 551))
d_2	ens_1	(chain "B" and (resid 24 through 134 or resid 140 through 199 or resid 202 through 551))
d_3	ens_1	(chain "C" and (resid 24 through 134 or resid 140 through 551))
d_4	ens_1	(chain "D" and (resid 24 through 134 or resid 140 through 199 or resid 202 through 551))

NCSドメイン領域:

Ens-ID: ens_1

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
d_1	1	GLN	GLN	LEU	LEU	A	A	24 - 134	26 - 136
d_1	2	SER	SER	GLY	GLY	A	A	140 - 199	142 - 201
d_1	3	GLY	GLY	ILE	ILE	A	A	202 - 540	204 - 542
d_1	4	MG	MG	MG	MG	A	E	601
d_1	5	FBP	FBP	FBP	FBP	A	F	602
d_2	1	GLN	GLN	LEU	LEU	B	B	24 - 134	26 - 136
d_2	2	SER	SER	GLY	GLY	B	B	140 - 199	142 - 201
d_2	3	GLY	GLY	ILE	ILE	B	B	202 - 540	204 - 542
d_2	4	MG	MG	MG	MG	B	G	601
d_2	5	FBP	FBP	FBP	FBP	B	H	602
d_3	1	GLN	GLN	LEU	LEU	C	C	24 - 134	26 - 136
d_3	2	SER	SER	ILE	ILE	C	C	140 - 540	142 - 542
d_3	3	MG	MG	MG	MG	C	J	601
d_3	4	FBP	FBP	FBP	FBP	C	K	602
d_4	1	GLN	GLN	LEU	LEU	D	D	24 - 134	26 - 136
d_4	2	SER	SER	GLY	GLY	D	D	140 - 199	142 - 201
d_4	3	GLY	GLY	ILE	ILE	D	D	202 - 540	204 - 542
d_4	4	MG	MG	MG	MG	D	L	601
d_4	5	FBP	FBP	FBP	FBP	D	M	602

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(-0.478615601668, -0.739065009867, 0.474035881585), (-0.761549487357, 0.0807177066945, -0.643060673756), (0.437000553942, -0.668780653889, -0.601467333143)	12.7309671947, 31.9125162745, 38.9859807156
2	given	(-0.185761493484, 0.869907660122, 0.456895316675), (0.849742914247, -0.091260358623, 0.519238410204), (0.493385900919, 0.484698060451, -0.722245209724)	6.97902378361, -29.3272866165, 40.8505531515
3	given	(-0.313329131558, -0.0601518815311, -0.94773762533), (-0.17004752609, -0.978307884475, 0.118311123928), (-0.934295827984, 0.198230760283, 0.296303681195)	50.5208059769, 0.516456954915, 35.654183956

#1: タンパク質

Isoform L-type of Pyruvate kinase PKLR / Pyruvate kinase 1 / Pyruvate kinase isozymes L/R / R-type/L-type pyruvate kinase / Red cell/liver ...

分子量: 58564.160 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: PKLR, PK1, PKL / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P30613, pyruvate kinase

#2: 化合物

ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン

分子量: 24.305 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg

#3: 糖

ChemComp-FBP / 1,6-di-O-phosphono-beta-D-fructofuranose / BETA-FRUCTOSE-1,6-DIPHOSPHATE / FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATE / 1,6-di-O-phosphono-beta-D-fructose / 1,6-di-O-phosphono-D-fructose / 1,6-di-O-phosphono-fructose / β-D-フルクトフラノ-ス1,6-ビスりん酸

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 340.116 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₄O₁₂P₂

#4: 化合物

ChemComp-WV2 / mitapivat / N-{4-[4-(cyclopropylmethyl)piperazine-1-carbonyl]phenyl}quinoline-8-sulfonamide

分子量: 450.553 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 式: C₂₄H₂₆N₄O₃S

#5: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 886 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

研究の焦点であるリガンドがあるか

N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.32 Å³/Da / 溶媒含有率: 47 %
結晶化	温度: 293.15 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7 詳細: 0.2M Magnesium formate dihydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID30B / 波長: 0.9655 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS3 2M / 検出器: PIXEL / 日付: 2022年11月17日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9655 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.1→84.32 Å / Num. obs: 131759 / % possible obs: 96.6 % / 冗長度: 2 % / B_iso Wilson estimate: 20.73 Å² / CC_1/2: 0.965 / R_merge(I) obs: 0.054 / R_pim(I) all: 0.054 / R_rim(I) all: 0.076 / Χ²: 0.52 / Net I/σ(I): 7.4
反射シェル	解像度: 2.1→2.14 Å / R_merge(I) obs: 0.102 / Mean I/σ(I) obs: 4.6 / Num. unique obs: 6456 / CC_1/2: 0.963 / R_pim(I) all: 0.102 / R_rim(I) all: 0.145 / Χ²: 0.54 / % possible all: 94.8

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.20.1_4487	精密化
autoPROC		data processing
autoPROC		データ削減
Aimless		データスケーリング
PHASER		位相決定
Coot		モデル構築

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.1→54.43 Å / SU ML: 0.2859 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.98 / 位相誤差: 29.4174
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2653	6502	4.94 %
R_work	0.2317	125103	-
obs	0.2333	131605	96.5 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 30.32 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.1→54.43 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	15587	0	148	886	16621

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0084	15990
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1	21697
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0568	2525
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.02	2871
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	23.11	2352

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Asym-ID	Auth asym-ID	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
ens_1	d_2	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	1.55226141995
ens_1	d_3	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	1.93822645314
ens_1	d_4	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	2.07654377599

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.1-2.12	0.3135	223	0.2646	4165	X-RAY DIFFRACTION	95.14
2.12-2.15	0.3236	201	0.2482	4017	X-RAY DIFFRACTION	95.02
2.15-2.18	0.3036	232	0.2531	4232	X-RAY DIFFRACTION	95.06
2.18-2.2	0.297	190	0.2448	4037	X-RAY DIFFRACTION	95.96
2.2-2.23	0.2825	217	0.2467	4191	X-RAY DIFFRACTION	95.54
2.23-2.26	0.2905	222	0.2512	4059	X-RAY DIFFRACTION	93.92
2.26-2.29	0.2962	238	0.253	4118	X-RAY DIFFRACTION	95.69
2.29-2.33	0.3561	196	0.2464	4118	X-RAY DIFFRACTION	96.19
2.33-2.37	0.2965	213	0.2463	4124	X-RAY DIFFRACTION	94.9
2.37-2.4	0.2887	200	0.2421	4108	X-RAY DIFFRACTION	95.12
2.4-2.45	0.2992	220	0.2435	4117	X-RAY DIFFRACTION	96.08
2.45-2.49	0.2949	205	0.2468	4153	X-RAY DIFFRACTION	94.9
2.49-2.54	0.3127	202	0.2533	4077	X-RAY DIFFRACTION	94.88
2.54-2.59	0.2953	183	0.2538	4226	X-RAY DIFFRACTION	96.92
2.59-2.65	0.3066	217	0.2525	4262	X-RAY DIFFRACTION	97.1
2.65-2.71	0.3013	216	0.2562	4095	X-RAY DIFFRACTION	95.86
2.71-2.78	0.2824	231	0.251	4181	X-RAY DIFFRACTION	96.67
2.78-2.85	0.3004	223	0.2465	4210	X-RAY DIFFRACTION	97.51
2.85-2.93	0.256	247	0.2435	4174	X-RAY DIFFRACTION	97.25
2.93-3.03	0.2927	201	0.242	4202	X-RAY DIFFRACTION	97.58
3.03-3.14	0.3084	230	0.2504	4208	X-RAY DIFFRACTION	97.39
3.14-3.26	0.2822	203	0.2515	4241	X-RAY DIFFRACTION	97.2
3.26-3.41	0.2646	221	0.2393	4186	X-RAY DIFFRACTION	97.26
3.41-3.59	0.2473	255	0.2181	4176	X-RAY DIFFRACTION	97.64
3.59-3.82	0.2577	235	0.2242	4243	X-RAY DIFFRACTION	98.18
3.82-4.11	0.2322	192	0.2151	4269	X-RAY DIFFRACTION	98.13
4.11-4.52	0.1971	209	0.1999	4238	X-RAY DIFFRACTION	98.38
4.52-5.18	0.2233	235	0.202	4218	X-RAY DIFFRACTION	98.37
5.18-6.52	0.2589	226	0.2194	4273	X-RAY DIFFRACTION	98.25
6.52-54.43	0.1785	219	0.185	4185	X-RAY DIFFRACTION	97.22

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.226024916528	0.094465424158	-0.443841224597	0.845692259008	-0.100598795419	2.13924728211	-0.00309959610623	-0.00430810505793	0.10223015413	-0.0385557586392	-0.0884023280237	-0.160913088306	-0.133571033345	0.290164980174	0.0906787958169	0.17087177267	-0.0110490461993	-0.0274210775368	0.390787712751	0.135627851692	0.245693603044	12.599	20.582	-0.486
2	3.32614463319	-0.879720795074	-1.78221748353	4.14199649245	1.17768870806	6.04410032887	0.0999895969417	0.199736424385	1.07934473101	-0.628368031513	0.0438739773002	-0.430436149786	-1.18920439725	0.650176863617	-0.152583977325	0.377788644631	-0.143231425528	-0.0717792559333	0.363893545029	0.106500896935	0.604745155314	-21.326	24.251	-3.811
3	5.20234709684	1.06232489726	-0.852282211157	5.83860769879	-0.00858152186038	4.79001377508	-0.0539335723539	0.210408034307	0.622882902147	-0.030709381183	-0.0537990815952	0.164641617953	-0.401961274074	0.0547431458585	0.0905375262632	0.151895563589	-0.0157369039368	-0.0465222448699	0.169112732365	-0.0282603678953	0.231173527114	-25.659	16.325	1.832
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29	8.96038025977	1.77419618778	-4.33128983419	6.78513033214	-4.8805039779	4.61209350856	0.0360250711077	-0.752680737479	-0.797157057327	-0.0648262207424	-0.153286127754	-0.115354466239	0.644822738431	0.528258890942	0.145561499697	0.327863816709	0.0135850812708	-0.00768293660787	0.41331261348	-0.0240129744364	0.280917130665	61.157	-20.073	62.832
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31	6.69475620801	1.76768489552	0.327279324432	9.28347998121	0.99697734622	6.44874514187	0.210903564361	-0.550450568683	0.305835600373	0.611015204568	-0.135655052682	-0.474046835904	-0.083982197221	0.548252020161	-0.0652696120372	0.138848695647	-0.0486409468672	-0.0625463646158	0.221607504644	-0.0682185956744	0.262343018792	65.774	-8.789	40.469
32	2.1567035541	-2.67262895562	-1.45283280194	5.06787903313	3.35892419641	3.96142597323	0.00915289714451	0.0314198464292	0.538366690779	-0.199011344073	-0.130363190773	-0.261073043038	-0.39323153155	0.122034544439	0.0480800574278	0.22161936888	-0.0305996020615	-0.0281010985517	0.105521107488	-0.0502794966617	0.22673086002	60.029	-6.309	33.119
33	2.0712223396	-0.127005810324	-0.293136271541	1.63834099487	-0.0157229003982	1.64547064569	-0.02987692604	-0.0500602322679	0.0726114453059	-0.0504881809938	0.161921572909	0.056800178056	0.142013912548	-0.200985934808	-0.124673441728	0.128166183744	-0.0279672052047	-0.0247777858589	0.119603327506	0.0123072402434	0.120157293718	41.271	-15.021	37.048
34	6.56715149647	6.99802447143	-4.26908869065	9.96022470019	-0.0971524211788	1.99997775321	0.257897992052	0.304977058659	0.625008658762	-0.244951141391	0.270630297949	0.8934154782	-0.490882303987	-0.701287252553	-0.511736831368	0.185001081605	0.0370243374165	0.0133305349372	0.463313434125	0.130290883115	0.261818020689	27.446	-2.523	25.064
35	3.40947580701	0.351719882422	0.469432054376	2.02430867753	-1.09797425688	1.4978848136	-0.00974957323715	0.0666630471756	-0.231346977242	-0.212298924525	0.114957771535	0.120044061799	0.285342793457	-0.213915258323	-0.0903341779995	0.18610963127	-0.0428304320289	-0.0451859307256	0.146012763649	0.00537874992066	0.127344830837	42.539	-9.821	12.525
36	3.10632374386	0.262215190521	-0.457190484368	3.92015699397	0.536001974957	2.55502258146	0.0154715498742	0.0172449735432	-0.480529521267	-0.225826876638	0.0752297740919	0.275547141337	0.562495718111	-0.195767355338	-0.0480938340462	0.252363407926	-0.0236032675346	-0.0440762196666	0.147783488895	0.0566985903236	0.202622982739	39.184	-8.494	6.026

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN A AND RESID 24:127 )	A	24 - 127
2	X-RAY DIFFRACTION	2	( CHAIN A AND RESID 128:146 )	A	128 - 146
3	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN A AND RESID 147:224 )	A	147 - 224
4	X-RAY DIFFRACTION	4	( CHAIN A AND RESID 225:233 )	A	225 - 233
5	X-RAY DIFFRACTION	5	( CHAIN A AND RESID 234:265 )	A	234 - 265
6	X-RAY DIFFRACTION	6	( CHAIN A AND RESID 266:408 )	A	266 - 408
7	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN A AND RESID 409:420 )	A	409 - 420
8	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN A AND RESID 421:499 )	A	421 - 499
9	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN A AND RESID 500:540 )	A	500 - 540
10	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN B AND RESID 24:123 )	B	24 - 123
11	X-RAY DIFFRACTION	11	( CHAIN B AND RESID 124:145 )	B	124 - 145
12	X-RAY DIFFRACTION	12	( CHAIN B AND RESID 146:227 )	B	146 - 227
13	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN B AND RESID 228:233 )	B	228 - 233
14	X-RAY DIFFRACTION	14	( CHAIN B AND RESID 234:272 )	B	234 - 272
15	X-RAY DIFFRACTION	15	( CHAIN B AND RESID 273:401 )	B	273 - 401
16	X-RAY DIFFRACTION	16	( CHAIN B AND RESID 402:415 )	B	402 - 415
17	X-RAY DIFFRACTION	17	( CHAIN B AND RESID 416:498 )	B	416 - 498
18	X-RAY DIFFRACTION	18	( CHAIN B AND RESID 499:540 )	B	499 - 540
19	X-RAY DIFFRACTION	19	( CHAIN C AND RESID 24:134 )	C	24 - 134
20	X-RAY DIFFRACTION	20	( CHAIN C AND RESID 139:154 )	C	139 - 154
21	X-RAY DIFFRACTION	21	( CHAIN C AND RESID 155:181 )	C	155 - 181
22	X-RAY DIFFRACTION	22	( CHAIN C AND RESID 182:221 )	C	182 - 221
23	X-RAY DIFFRACTION	23	( CHAIN C AND RESID 222:240 )	C	222 - 240
24	X-RAY DIFFRACTION	24	( CHAIN C AND RESID 241:265 )	C	241 - 265
25	X-RAY DIFFRACTION	25	( CHAIN C AND RESID 266:274 )	C	266 - 274
26	X-RAY DIFFRACTION	26	( CHAIN C AND RESID 275:409 )	C	275 - 409
27	X-RAY DIFFRACTION	27	( CHAIN C AND RESID 410:540 )	C	410 - 540
28	X-RAY DIFFRACTION	28	( CHAIN D AND RESID 24:128 )	D	24 - 128
29	X-RAY DIFFRACTION	29	( CHAIN D AND RESID 129:145 )	D	129 - 145
30	X-RAY DIFFRACTION	30	( CHAIN D AND RESID 146:229 )	D	146 - 229
31	X-RAY DIFFRACTION	31	( CHAIN D AND RESID 230:238 )	D	230 - 238
32	X-RAY DIFFRACTION	32	( CHAIN D AND RESID 239:273 )	D	239 - 273
33	X-RAY DIFFRACTION	33	( CHAIN D AND RESID 274:402 )	D	274 - 402
34	X-RAY DIFFRACTION	34	( CHAIN D AND RESID 403:409 )	D	403 - 409
35	X-RAY DIFFRACTION	35	( CHAIN D AND RESID 410:511 )	D	410 - 511
36	X-RAY DIFFRACTION	36	( CHAIN D AND RESID 512:540 )	D	512 - 540

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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