PDB-8vhp: Crystal structure of E. coli class Ia ribonucleotide reductase al...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 8vhp

タイトル

Crystal structure of E. coli class Ia ribonucleotide reductase alpha subunit W28A variant bound to CDP and two molecules of ATP

要素

Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

キーワード

OXIDOREDUCTASE / Ribonucleotide reductase / allosteric regulation / nucleotide binding / subunit interaction

機能・相同性

機能・相同性情報

ribonucleoside diphosphate metabolic process / 2'-deoxyribonucleotide biosynthetic process / nucleobase-containing small molecule interconversion / ribonucleoside-diphosphate reductase complex / ribonucleoside-diphosphate reductase / ribonucleoside-diphosphate reductase activity, thioredoxin disulfide as acceptor / deoxyribonucleotide biosynthetic process / protein folding chaperone / ATP binding / identical protein binding / cytosol
類似検索 - 分子機能

生物種

Escherichia coli K-12 (大腸菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.608 Å

データ登録者

Funk, M.A. / Zimanyi, C.M. / Drennan, C.L.

資金援助

米国, 4件

組織	認可番号	国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)	R35GM126982	米国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)	T32GM08334	米国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)	P30-ES002109	米国
National Science Foundation (NSF, United States)	0645960	米国

引用

ジャーナル: Biochemistry / 年: 2024
タイトル: How ATP and dATP Act as Molecular Switches to Regulate Enzymatic Activity in the Prototypical Bacterial Class Ia Ribonucleotide Reductase.
著者: Funk, M.A. / Zimanyi, C.M. / Andree, G.A. / Hamilos, A.E. / Drennan, C.L.

履歴

登録	2024年1月2日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2024年9月4日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年10月9日	Group: Database references / Structure summary / カテゴリ: citation / pdbx_entry_details Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _pdbx_entry_details.has_protein_modification

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	8vhp.cif.gz	2.2 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb8vhp.ent.gz	1.9 MB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	8vhp.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	8vhp_validation.pdf.gz	10 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	8vhp_full_validation.pdf.gz	10.1 MB	表示
XML形式データ	8vhp_validation.xml.gz	232 KB	表示
CIF形式データ	8vhp_validation.cif.gz	297.6 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vh/8vhp ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vh/8vhp	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	8vhnC 8vhoC 8vhqC 8vhrC 8vhuC 5cnsS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#238 - 2019年10月リボヌクレオチド還元酵素 (Ribonucleotide Reductase) 類似性 (14)

登録構造単位

A: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

B: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

C: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

D: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

E: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

F: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

G: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

H: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

ヘテロ分子

721 kDa, 8 ポリマー
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1

A: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

B: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
180 kDa, 2 ポリマー
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2

C: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

D: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
180 kDa, 2 ポリマー
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3

E: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

F: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

ヘテロ分子

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180 kDa, 2 ポリマー
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4

G: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

H: Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
180 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	288.719, 316.613, 158.940
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	20
Space group name H-M	C222₁

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	chain A
2	1	chain B
3	1	chain C
4	1	chain D
5	1	chain E
6	1	chain F
7	1	chain G
8	1	chain H

NCSドメイン領域:

Component-ID: 1 / Ens-ID: 1 / End auth comp-ID: ASP / End label comp-ID: ASP

Dom-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	GLN	GLN	chain A	A	A	3 - 736	22 - 755
2	ASN	ASN	chain B	B	B	4 - 736	23 - 755
3	ASN	ASN	chain C	C	C	4 - 736	23 - 755
4	ASN	ASN	chain D	D	D	4 - 736	23 - 755
5	ASN	ASN	chain E	E	E	4 - 736	23 - 755
6	GLN	GLN	chain F	F	F	3 - 736	22 - 755
7	ASN	ASN	chain G	G	G	4 - 736	23 - 755
8	ASN	ASN	chain H	H	H	2 - 736	21 - 755

-
タンパク質 , 1種, 8分子 ABCDEFGH

#1: タンパク質	Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha / Protein B1 / Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 R1 subunit / Ribonucleotide reductase 1 分子量: 87682.008 Da / 分子数: 8 / 変異: W28A / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli K-12 (大腸菌) / 株: K-12 / 遺伝子: nrdA, dnaF, b2234, JW2228 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) 参照: UniProt: P00452, ribonucleoside-diphosphate reductase

#1: タンパク質

Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha / Protein B1 / Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 R1 subunit / Ribonucleotide reductase 1

分子量: 87682.008 Da / 分子数: 8 / 変異: W28A / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Escherichia coli K-12 (大腸菌) / 株: K-12 / 遺伝子: nrdA, dnaF, b2234, JW2228 / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌)
参照: UniProt: P00452, ribonucleoside-diphosphate reductase

-
非ポリマー , 5種, 1310分子

#2: 化合物	... ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 40 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#3: 化合物	... ChemComp-ATP / ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP 分子量: 507.181 Da / 分子数: 24 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₆N₅O₁₃P₃ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: ATP, エネルギー貯蔵分子*YM
#4: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 16 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#5: 化合物	ChemComp-CDP / CYTIDINE-5'-DIPHOSPHATE / CDP 分子量: 403.176 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₉H₁₅N₃O₁₁P₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1222 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y
Has protein modification	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.74 Å³/Da / 溶媒含有率: 55.15 %
結晶化	温度: 291.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: 1.9 M ammonium sulfate, 4% (w/vol) PEG MME 500, 0.1 M bis-Tris pH 6.5

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 24-ID-C / 波長: 0.979183 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2013年8月2日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.979183 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.6→50 Å / Num. obs: 218946 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 7.2 % / B_iso Wilson estimate: 54.92 Å² / R_merge(I) obs: 0.128 / R_pim(I) all: 0.056 / R_rim(I) all: 0.132 / Χ²: 0.931 / Net I/σ(I): 5.2 / Num. measured all: 1584464

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	Num. unique obs	CC_1/2	R_pim(I) all	Χ²	% possible all	R_merge(I) obs	R_rim(I) all
2.6-2.64	6.4	10841	0.535	0.584	0.711	99.9
2.64-2.69	6.8	10878	0.596	0.506	0.732	99.9
2.69-2.74	7.1	10897	0.67	0.44	0.715	99.9
2.74-2.8	7.3	10869	0.749	0.382	0.723	100	0.974
2.8-2.86	7.4	10838	0.821	0.316	0.733	99.9	0.812	0.872
2.86-2.93	7.3	10934	0.849	0.276	0.736	99.9	0.703	0.756
2.93-3	7.1	10853	0.863	0.249	0.744	99.9	0.626	0.675
3-3.08	6.6	10861	0.895	0.213	0.77	99.5	0.513	0.557
3.08-3.17	7.6	10913	0.941	0.161	0.776	99.9	0.421	0.452
3.17-3.28	7.6	10925	0.963	0.124	0.801	99.9	0.325	0.348
3.28-3.39	7.5	10912	0.975	0.102	0.849	99.9	0.266	0.286
3.39-3.53	7.4	10931	0.983	0.078	0.94	100	0.202	0.217
3.53-3.69	7.2	10952	0.988	0.062	1.026	99.8	0.157	0.17
3.69-3.88	6.9	10915	0.992	0.049	1.113	99.7	0.121	0.131
3.88-4.13	7.7	10930	0.995	0.038	1.178	99.9	0.101	0.108
4.13-4.45	7.6	11006	0.996	0.034	1.255	99.8	0.088	0.094
4.45-4.89	7.2	10988	0.997	0.029	1.287	99.7	0.074	0.079
4.89-5.6	7.4	11020	0.997	0.027	1.168	99.7	0.07	0.075
5.6-7.05	7.4	11124	0.997	0.026	1.095	100	0.066	0.071
7.05-50	7.2	11359	0.999	0.015	1.16	99.3	0.038	0.041

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
PHASER		位相決定
PHENIX	1.9_1692	精密化
PDB_EXTRACT	3.27	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5CNS

5cns

解像度: 2.608→49.736 Å / SU ML: 0.31 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 22.12 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2095	2000	0.91 %
R_work	0.1889	216879	-
obs	0.1891	218879	99.53 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 124.84 Å² / B_iso mean: 54.1067 Å² / B_iso min: 34.94 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.608→49.736 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	46569	0	1160	1224	48953
B_iso mean	-	-	53.08	51.08	-
残基数	-	-	-	-	5853

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.004	48880
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.762	66311
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.032	7217
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	8752
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	11.756	18353

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	Rms	タイプ
1	1	A	28597	X-RAY DIFFRACTION	4.564	TORSIONAL
1	2	B	28597	X-RAY DIFFRACTION	4.564	TORSIONAL
1	3	C	28597	X-RAY DIFFRACTION	4.564	TORSIONAL
1	4	D	28597	X-RAY DIFFRACTION	4.564	TORSIONAL
1	5	E	28597	X-RAY DIFFRACTION	4.564	TORSIONAL
1	6	F	28597	X-RAY DIFFRACTION	4.564	TORSIONAL
1	7	G	28597	X-RAY DIFFRACTION	4.564	TORSIONAL
1	8	H	28597	X-RAY DIFFRACTION	4.564	TORSIONAL

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	% reflection obs (%)
2.608-2.6728	0.3499	137	0.2862	14795	96
2.6728-2.745	0.3108	142	0.2684	15472	100
2.745-2.8258	0.2911	142	0.2588	15413	100
2.8258-2.917	0.2627	143	0.2456	15451	100
2.917-3.0212	0.2712	142	0.2457	15453	100
3.0212-3.1422	0.2623	143	0.2405	15447	100
3.1422-3.2851	0.2468	142	0.2222	15455	100
3.2851-3.4583	0.2306	144	0.2027	15542	100
3.4583-3.6749	0.1989	142	0.1872	15462	100
3.6749-3.9585	0.1789	144	0.1673	15534	100
3.9585-4.3567	0.1706	143	0.1556	15584	100
4.3567-4.9866	0.1844	144	0.1509	15589	100
4.9866-6.2806	0.201	144	0.1738	15705	100
6.2806-49.736	0.1723	148	0.1699	15977	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.423	-0.0617	-0.0607	0.5697	0.4712	0.9499	-0.025	-0.0849	0.0422	0.0817	0.0267	-0.0288	-0.02	0.0055	0	0.57	0.0385	-0.0166	0.5677	0.0103	0.5143	303.7902	113.0451	167.7123
2	0.8762	0.1151	-0.0188	1.1808	0.1932	0.7933	-0.0171	0.0445	-0.0215	-0.0505	0.0024	0.0602	-0.0407	-0.0458	-0	0.5637	0.0314	-0.0305	0.5611	0.038	0.4696	291.3184	107.2578	145.5972
3	0.9249	0.7141	-0.4366	1.6259	0.4107	0.8126	-0.0905	0.3492	-0.0926	-0.2455	0.0263	-0.038	0.1071	0.0775	0.0019	0.6963	-0.0287	0.0204	0.7745	-0.0845	0.6745	311.2245	45.5724	132.9419
4	0.3857	-0.0998	-0.0337	0.7894	0.3641	0.5779	-0.0441	0.129	-0.0297	-0.1875	0.0647	-0.1117	-0.0932	0.0358	-0	0.5814	-0.0068	0.0639	0.6151	-0.0169	0.5735	326.7769	73.692	141.448
5	0.7173	-0.0601	-0.2898	2.3559	-0.2151	1.5504	-0.1362	-0.1377	0.058	0.2619	0.1648	-0.0239	-0.0678	-0.069	-0.0001	0.6023	0.0793	0.0056	0.6078	-0.0144	0.5517	325.9117	84.584	175.8958
6	1.0198	-0.0706	-0.0142	0.9083	0.0597	1.443	-0.0319	0.0259	0.0259	-0.0341	0.1477	-0.2559	-0.0638	0.2456	-0	0.5028	0.0087	0.026	0.6099	-0.0758	0.6303	342.6518	73.9211	154.7299
7	0.6337	-0.1207	-0.0658	1.1818	0.6567	1.054	0.0035	-0.0791	-0.2518	0.2365	0.0135	0.1267	0.1908	-0.1058	-0	0.603	0.0775	-0.0062	0.6043	-0.0019	0.6431	328.5608	59.7997	163.4708
8	1.2645	-0.1336	-0.3625	1.0954	-0.7862	0.6823	-0.112	0.2277	0.2065	-0.2078	0.0029	0.3765	-0.2697	0.0737	0.0006	0.6599	0.0107	-0.0447	0.7741	0.0805	0.8132	259.343	103.6891	147.3505
9	0.6005	-0.1734	0.107	0.8944	-0.1948	0.492	0.0303	0.07	0.1017	-0.0404	0.0204	0.2372	0.033	-0.0509	0.0001	0.5221	0.0356	0.007	0.5947	-0.02	0.6666	250.8981	75.8981	163.6667
10	0.7338	-0.4067	0.7211	2.1426	0.0916	1.1334	-0.0002	-0.1391	0.005	0.3296	0.0873	-0.1631	0.1513	0.3737	-0	0.6942	0.0983	-0.0392	0.7193	-0.106	0.6367	270.4314	65.6653	192.3167
11	1.0401	0.2383	-0.1169	0.8393	-0.1382	1.2021	0.0598	-0.0459	0.0593	0.1813	0.0358	0.2097	0.0064	-0.0621	0	0.5623	0.0487	0.0674	0.5159	-0.0241	0.6966	244.8056	76.2649	183.8097
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14	0.991	-0.1981	-0.0911	1.3742	-0.0511	0.8324	-0.0074	0.0911	-0.005	-0.0751	0.0144	0.0555	-0.0196	-0.0683	-0	0.4889	0.012	-0.0168	0.5398	-0.0578	0.4951	279.2193	41.2928	148.1398
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24	2.548	-0.7038	0.0617	0.4849	-0.3498	1.0988	0.2859	0.4507	0.1984	-0.4105	-0.2302	-0.1931	0.1339	0.1162	-0.0001	0.8797	0.0453	0.1585	0.6696	0.0467	0.6362	374.7458	40.7754	188.0776
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29	1.4833	0.216	-0.3576	1.2555	-0.0084	0.6018	0.0531	-0.1611	-0.0984	0.07	-0.0148	-0.0611	0.0596	0.0397	0	0.626	-0.0185	-0.0117	0.5665	0.0028	0.5072	397.0082	0.5201	211.857
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34	1.2903	0.0483	-0.0917	0.7603	-0.8484	0.8824	0.0412	0.2211	0.3099	-0.0342	-0.0077	-0.0306	-0.2455	-0.0309	0	0.6043	0.0468	0.0681	0.6341	0.0373	0.6315	356.6669	-15.8445	166.7815
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36	0.2612	0.0965	0.108	0.2477	-0.0019	0.1694	0.1163	0.1411	-0.2129	0.0681	0.034	-0.2193	-0.0278	0.1351	0	0.5232	-0.0138	0.0221	0.5977	-0.0689	0.6765	379.7981	-33.3681	182.0191
37	0.7972	-0.6951	-0.1603	0.774	0.0477	1.3648	0.0298	0.3543	0.135	-0.2146	0.0065	-0.4442	-0.1668	0.2387	0	0.5602	-0.0323	0.0624	0.6519	0.0179	0.6151	377.3836	-23.3212	167.5236

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 3 through 316 )	A	3 - 316
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 317 through 736 )	A	317 - 736
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'B' and (resid 4 through 74 )	B	4 - 74
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resid 75 through 316 )	B	75 - 316
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 317 through 409 )	B	317 - 409
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 410 through 624 )	B	410 - 624
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 625 through 736 )	B	625 - 736
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'C' and (resid 4 through 74 )	C	4 - 74
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'C' and (resid 75 through 316 )	C	75 - 316
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 317 through 409 )	C	317 - 409
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 410 through 609 )	C	410 - 609
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 610 through 736 )	C	610 - 736
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'D' and (resid 4 through 316 )	D	4 - 316
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'D' and (resid 317 through 645 )	D	317 - 645
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 652 through 658 )	D	652 - 658
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 659 through 675 )	D	659 - 675
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 676 through 696 )	D	676 - 696
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 697 through 710 )	D	697 - 710
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 711 through 723 )	D	711 - 723
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 724 through 731 )	D	724 - 731
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 732 through 736 )	D	732 - 736
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'E' and (resid 4 through 74 )	E	4 - 74
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'E' and (resid 75 through 318 )	E	75 - 318
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'E' and (resid 319 through 446 )	E	319 - 446
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'E' and (resid 447 through 609 )	E	447 - 609
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resid 610 through 662 )	E	610 - 662
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 663 through 736 )	E	663 - 736
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'F' and (resid 3 through 316 )	F	3 - 316
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'F' and (resid 317 through 736 )	F	317 - 736
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'G' and (resid 4 through 316 )	G	4 - 316
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'G' and (resid 317 through 736 )	G	317 - 736
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'H' and (resid 2 through 74 )	H	2 - 74
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'H' and (resid 75 through 316 )	H	75 - 316
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'H' and (resid 317 through 371 )	H	317 - 371
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'H' and (resid 372 through 609 )	H	372 - 609
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'H' and (resid 610 through 662 )	H	610 - 662
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'H' and (resid 663 through 736 )	H	663 - 736

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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万見 (Yorodumi)