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- PDB-8ukz: Structure of P450Blt from Micromonospora sp. MW-13 with E238A Mutation -

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基本情報

登録情報

データベース: PDB / ID: 8ukz

タイトル

Structure of P450Blt from Micromonospora sp. MW-13 with E238A Mutation

要素

Cytochrome P450-SU1

キーワード

OXIDOREDUCTASE / mutant / biarylitide / crosslink

機能・相同性

機能・相同性情報

酸化還元酵素; 電子対供与作用を持つ; 分子酸素を取り込むないしは分子酸素を還元する / cholest-4-en-3-one 26-monooxygenase activity / steroid hydroxylase activity / cholesterol catabolic process / iron ion binding / heme binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Micromonospora sp. MW-13 (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.95 Å

データ登録者

Hansen, M.H. / Cryle, M.J.

資金援助

オーストラリア, 2件

引用

ジャーナル: Acs Catalysis / 年: 2024
タイトル: Structural Insights into a Side Chain Cross-Linking Biarylitide P450 from RiPP Biosynthesis
著者: Hansen, M.H. / Keto, A. / Treisman, M. / Sasi, V.M. / Coe, L. / Zhao, Y. / Padva, L. / Hess, C. / Leichthammer, V. / Machell, D.L. / Schittenhelm, R.B. / Jackson, C.J. / Tailhades, J. / ...

履歴

登録	2023年10月15日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2024年1月10日	Provider: repository / タイプ: Initial release

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構造の表示

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロードとリンク

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	8ukz.cif.gz	715 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb8ukz.ent.gz	542.5 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	8ukz.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	8ukz_validation.pdf.gz	1.4 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	8ukz_full_validation.pdf.gz	1.5 MB	表示
XML形式データ	8ukz_validation.xml.gz	41.2 KB	表示
CIF形式データ	8ukz_validation.cif.gz	57.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/uk/8ukz ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/uk/8ukz	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	8u2mC 8u3nC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#82 - 2006年10月シトクロムp450 (Cytochrome p450) 類似性 (1)

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集合体

登録構造単位

A: Cytochrome P450-SU1

B: Cytochrome P450-SU1

C: Cytochrome P450-SU1

ヘテロ分子

138 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

A: Cytochrome P450-SU1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
46.2 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

B: Cytochrome P450-SU1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
46.2 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

C: Cytochrome P450-SU1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
46.1 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	61.957, 94.480, 105.985
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 92.680, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1
Space group name Hall	P2yb
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: -x,y+1/2,-z

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
d_1	ens_1	(chain "A" and (resid 14 through 32 or resid 34...
d_2	ens_1	(chain "B" and (resid 14 through 32 or resid 34...
d_3	ens_1	(chain "C" and (resid 14 through 32 or resid 34...

NCSドメイン領域:

Ens-ID: ens_1

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
d_1	1	TYR	TYR	LEU	LEU	A	A	14 - 32	35 - 53
d_1	2	GLU	GLU	VAL	VAL	A	A	34 - 38	55 - 59
d_1	3	TRP	TRP	CYS	CYS	A	A	40 - 55	61 - 76
d_1	4	GLN	GLN	VAL	VAL	A	A	57 - 110	78 - 131
d_1	5	GLN	GLN	GLU	GLU	A	A	112 - 124	133 - 145
d_1	6	GLY	GLY	VAL	VAL	A	A	130 - 169	151 - 190
d_1	7	SER	SER	GLU	GLU	A	A	171 - 204	192 - 225
d_1	8	GLY	GLY	ALA	ALA	A	A	206 - 215	227 - 236
d_1	9	ASP	ASP	VAL	VAL	A	A	265 - 289	286 - 310
d_1	10	ASP	ASP	LEU	LEU	A	A	291 - 354	312 - 375
d_1	11	GLU	GLU	ALA	ALA	A	A	356 - 363	377 - 384
d_1	12	LEU	LEU	SER	SER	A	A	368 - 391	389 - 412
d_2	1	TYR	TYR	LEU	LEU	B	B	14 - 32	35 - 53
d_2	2	GLU	GLU	VAL	VAL	B	B	34 - 38	55 - 59
d_2	3	TRP	TRP	CYS	CYS	B	B	40 - 55	61 - 76
d_2	4	GLN	GLN	VAL	VAL	B	B	57 - 110	78 - 131
d_2	5	GLN	GLN	GLU	GLU	B	B	112 - 124	133 - 145
d_2	6	GLY	GLY	VAL	VAL	B	B	130 - 169	151 - 190
d_2	7	SER	SER	GLU	GLU	B	B	171 - 204	192 - 225
d_2	8	GLY	GLY	ALA	ALA	B	B	206 - 215	227 - 236
d_2	9	ASP	ASP	ASP	ASP	B	B	219	240
d_2	10	ALA	ALA	VAL	VAL	B	B	266 - 289	287 - 310
d_2	11	ASP	ASP	LEU	LEU	B	B	291 - 354	312 - 375
d_2	12	GLU	GLU	ALA	ALA	B	B	356 - 363	377 - 384
d_2	13	LEU	LEU	SER	SER	B	B	368 - 391	389 - 412
d_3	1	TYR	TYR	LEU	LEU	C	C	14 - 32	35 - 53
d_3	2	GLU	GLU	VAL	VAL	C	C	34 - 38	55 - 59
d_3	3	TRP	TRP	CYS	CYS	C	C	40 - 55	61 - 76
d_3	4	GLN	GLN	VAL	VAL	C	C	57 - 110	78 - 131
d_3	5	GLN	GLN	VAL	VAL	C	C	112 - 169	133 - 190
d_3	6	SER	SER	GLU	GLU	C	C	171 - 204	192 - 225
d_3	7	GLY	GLY	ALA	ALA	C	C	206 - 215	227 - 236
d_3	8	ASP	ASP	ASP	ASP	C	C	219	240
d_3	9	ALA	ALA	VAL	VAL	C	C	266 - 289	287 - 310
d_3	10	ASP	ASP	LEU	LEU	C	C	291 - 354	312 - 375
d_3	11	GLU	GLU	SER	SER	C	C	356 - 391	377 - 412

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(0.560235408689, -0.822783302774, 0.0957283841247), (-0.82474944631, -0.564812804572, -0.0278360665867), (0.076971667917, -0.0633571816625, -0.995018205798)	-49.6424893263, -84.3299250137, -70.6423880528
2	given	(0.488779971403, 0.870846511858, 0.0521583391124), (0.871331655082, -0.490271869634, 0.0203627281292), (0.0433045771968, 0.0354943182725, -0.99843120292)	-26.9871823014, -60.2503172697, -34.1962046526

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要素

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タンパク質 , 1種, 3分子 ABC

#1: タンパク質	Cytochrome P450-SU1 分子量: 45274.238 Da / 分子数: 3 / 変異: E238A / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Micromonospora sp. MW-13 (バクテリア) 遺伝子: C5N14_21030 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A3E2YLT4

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非ポリマー , 5種, 224分子

#2: 化合物	ChemComp-HEM / PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / HEME 分子量: 616.487 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃₄H₃₂FeN₄O₄
#3: 化合物	ChemComp-TFA / trifluoroacetic acid / トリフルオロ酢酸分子量: 114.023 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂HF₃O₂
#4: 化合物	ChemComp-ACT / ACETATE ION / 酢酸イオン分子量: 59.044 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₃O₂
#5: 化合物	ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル分子量: 106.120 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₃
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 212 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

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詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	N

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実験情報

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実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶	マシュー密度: 2.28 Å³/Da / 溶媒含有率: 46.09 %
結晶化	温度: 293.15 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.5 / 詳細: 0.1 M MES pH 6.5, 12% PEG400 and 14% PEG 20K

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データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Australian Synchrotron / ビームライン: MX2 / 波長: 0.95373 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2022年7月28日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.95373 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.95→47.24 Å / Num. obs: 88780 / % possible obs: 99.89 % / 冗長度: 3.5 % / B_iso Wilson estimate: 34.75 Å² / CC_1/2: 0.995 / CC star: 0.999 / Net I/σ(I): 5.68
反射シェル	解像度: 1.95→2.02 Å / Num. unique obs: 8823 / CC_1/2: 0.257 / CC star: 0.64

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解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.20.1_4487	精密化
XDS		データ削減
Aimless		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 1.95→47.24 Å / SU ML: 0.2519 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 24.4687
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2228	4499	5.07 %
R_work	0.2046	84226	-
obs	0.2055	88725	99.9 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 47.02 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.95→47.24 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	8559	0	180	212	8951

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0041	8984
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.6847	12303
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0416	1367
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.0059	1638
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	7.8349	1314

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Asym-ID	Auth asym-ID	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
ens_1	d_2	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	2.49880385567
ens_1	d_3	A	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	2.49547799663

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.95-1.97	0.3068	155	0.3375	2775	X-RAY DIFFRACTION	99.36
1.97-2	0.3447	156	0.318	2797	X-RAY DIFFRACTION	99.8
2-2.02	0.3545	133	0.3151	2777	X-RAY DIFFRACTION	99.59
2.02-2.05	0.3367	140	0.3063	2786	X-RAY DIFFRACTION	99.73
2.05-2.07	0.3032	161	0.2914	2806	X-RAY DIFFRACTION	99.8
2.07-2.1	0.3163	141	0.2837	2777	X-RAY DIFFRACTION	99.76
2.1-2.13	0.2786	159	0.2667	2820	X-RAY DIFFRACTION	99.93
2.13-2.16	0.3167	125	0.2707	2786	X-RAY DIFFRACTION	99.73
2.16-2.2	0.2874	155	0.256	2809	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2-2.23	0.288	154	0.2556	2776	X-RAY DIFFRACTION	99.9
2.23-2.27	0.2613	140	0.2389	2815	X-RAY DIFFRACTION	99.93
2.27-2.31	0.2803	141	0.2297	2837	X-RAY DIFFRACTION	99.97
2.31-2.36	0.2441	151	0.2211	2797	X-RAY DIFFRACTION	99.93
2.36-2.41	0.245	154	0.2178	2804	X-RAY DIFFRACTION	100
2.41-2.46	0.2432	152	0.2143	2795	X-RAY DIFFRACTION	100
2.46-2.51	0.253	140	0.2061	2799	X-RAY DIFFRACTION	100
2.51-2.58	0.2216	166	0.2025	2809	X-RAY DIFFRACTION	100
2.58-2.65	0.2413	144	0.2032	2778	X-RAY DIFFRACTION	100
2.65-2.72	0.247	180	0.2062	2796	X-RAY DIFFRACTION	100
2.72-2.81	0.2593	142	0.2094	2805	X-RAY DIFFRACTION	100
2.81-2.91	0.2095	135	0.2052	2820	X-RAY DIFFRACTION	99.97
2.91-3.03	0.2603	140	0.2115	2823	X-RAY DIFFRACTION	99.97
3.03-3.17	0.2653	151	0.2224	2792	X-RAY DIFFRACTION	100
3.17-3.33	0.2073	168	0.2046	2825	X-RAY DIFFRACTION	100
3.33-3.54	0.2008	159	0.1929	2820	X-RAY DIFFRACTION	100
3.54-3.82	0.2043	139	0.1811	2819	X-RAY DIFFRACTION	100
3.82-4.2	0.1896	148	0.1686	2834	X-RAY DIFFRACTION	99.93
4.2-4.81	0.1742	158	0.1594	2817	X-RAY DIFFRACTION	100
4.81-6.06	0.1943	127	0.195	2864	X-RAY DIFFRACTION	99.9
6.06-47.24	0.1835	185	0.1837	2868	X-RAY DIFFRACTION	99.87

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.03987635595	-0.261872014648	1.48391118543	2.03697491416	0.117016226546	9.63797083549	0.319466704556	-0.0483235441592	0.300130576072	-0.296455448906	-0.280572424316	0.342786828362	-1.63331663003	-2.20488572612	-0.11466875904	0.738897381158	0.188679015529	-0.0605504362723	0.624945351614	-0.0132997311319	0.453646189084	-51.818	-26.612	-25.024
2	9.37586677565	4.99124948835	0.927599346309	4.672277449	4.85931494594	9.54473167255	-0.70904350824	-0.0325097357148	0.144598051181	-0.185081305151	-0.337635782005	2.54196353787	0.620942196788	-1.91394565002	0.917722479096	0.431855875813	-0.174669891932	0.0301623774106	0.947944865676	0.00931877006683	0.541477130481	-50.371	-34.192	-25.086
3	2.06007018443	-1.02627590324	-2.07858183888	5.30673225794	-0.374973118972	3.66387957486	0.0015944305946	-0.776704378206	-0.414511053217	0.352462386105	0.241527441707	0.914940083792	0.997436661197	-0.439465914787	-0.322121997612	0.448611980559	-0.0097021220486	0.0147237921435	0.406647909494	0.145583692481	0.381739165563	-40.635	-35.79	-18.696
4	1.65039314703	-0.285748801874	-0.100923767787	1.69096365984	-0.462820590618	2.14862407102	-0.0171186396695	-0.0148778168056	0.0520425156859	-0.0672489313856	-0.0337556570479	-0.199944086291	0.158981136279	0.200060501591	0.0389104772884	0.185568102005	-0.00202818282313	-0.00246965343657	0.215559934609	-0.0030933040958	0.220389056774	-21.857	-21.214	-31.991
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47	7.3255335138	3.3704241959	-5.05452916815	8.59536638517	-0.755959424076	7.06365285371	0.166150440114	-0.255070846538	0.659957985651	0.333783006346	-0.117125680961	-0.354732040128	-0.291086215831	0.575830895934	-0.102190838943	0.284346125078	-0.0238899939258	-0.0536546504258	0.348782554912	0.00750865223581	0.390957339201	-11.884	-16.98	-19.967
48	4.08138027993	-0.364802427467	-4.74252510396	3.701737271	4.05404420067	9.14837546577	0.367074734366	-0.499732057532	1.14689502628	-0.962530212181	0.506348777668	-0.541911792041	-0.646743181798	0.880544096991	-0.7250242975	0.365793438901	-0.0658604325873	0.0310617184438	0.439917217215	0.0432621907572	0.420696091477	-6.828	-22.073	-29.465
49	5.33413494006	-0.648519514749	-2.79565852649	5.84532901173	-4.19927025741	8.68418850095	0.0432331914493	-1.02721140567	0.191448128619	0.455994087941	-0.343968218444	-0.545940137752	-0.194565351698	1.4009359292	0.343941699455	0.296886601205	0.0732782124994	-0.0348719121261	0.565608744932	-0.0614346515297	0.470716000956	-9.009	-31.489	-23.337
50	3.91912034966	2.96414491062	-3.57807292336	4.41497345106	-1.392425343	3.80479491388	0.0543306188352	-0.0204943369383	-0.325900218525	-0.213770000684	-0.0013912769117	0.149220213544	0.404575129977	0.22893494617	-0.0616702759849	0.438984906516	0.0934142470722	-0.0573348778867	0.355876939749	0.0576933947011	0.385642669347	-21.154	-40.226	-27.11
51	6.09665825298	-1.9000932125	-0.413929843145	2.19515172235	-0.958643491017	7.38928287708	0.125879255703	-0.77242174767	-0.920974902924	0.235661084988	0.133642042895	0.0656225800582	1.08923943911	0.379542756375	-0.165489315654	0.52031119621	-0.000294549912238	-0.102485949543	0.329351199215	0.0605325444895	0.410731343132	-33.848	-40.589	-22.021
52	3.88131147303	-1.56357688541	0.173175554061	2.16938723242	1.33626642645	2.74923418417	-0.0736926568317	0.0905286623145	0.31014565771	0.0548703848637	0.0443469833278	0.21815660956	0.032306660008	-0.379611396495	0.00735971492809	0.208588352388	0.004102226306	-0.0013215995705	0.261956497548	-0.0132096958387	0.273220516595	-45.264	-20.552	-32.213
53	3.05979515082	3.10773165489	4.01181924828	4.64873220682	6.06131884775	7.90955666734	-0.483028182364	-0.322336984777	0.726033589181	1.04998313476	0.732238616655	-0.184202459928	0.0728637400225	0.365600886467	-0.259598400187	0.42846494404	0.130500671212	0.0391808855762	0.416799659799	-0.0375422049618	0.54760197934	-39.763	-0.377	-24.698
54	3.84030295982	1.43340460795	-0.462663637364	7.34668064021	3.8133899421	4.83259938664	0.128380274341	-0.164141015317	1.18240114317	0.296375926093	0.0150201239776	1.12670540945	-0.73809909633	-0.408423058209	-0.117524805375	0.434713984769	0.084709971458	0.0717422105988	0.419156298362	-0.113994205769	0.673023232944	-32.089	2.098	-19.956
55	2.85736610446	-0.936958710833	1.35675867845	2.5222345298	0.111471404029	2.53270330456	0.0469720333449	-0.60500046842	0.258829269317	0.278525464732	-0.0140482910656	0.209858762274	-0.180114395102	-0.414423762186	-0.0256409413026	0.300240917964	-0.000508068229106	0.0590498284031	0.365008154379	-0.0578214054522	0.317282881083	-35.982	-17.18	-17.131
56	4.6120932157	2.83926916691	4.96299585326	2.50145709225	2.18875994406	5.36190237889	0.706201229285	-1.68277468462	0.128473917751	0.688994866218	-0.460610196007	0.210787129168	0.462672124024	-0.520834387921	-0.311669349206	0.510226784132	-0.0641569483837	0.030457827514	0.519406805141	0.0519513028904	0.330223075135	-32.855	-26.946	-8.878
57	6.78570242964	6.35430212584	5.64218091817	5.94143422865	5.277656921	4.69098164201	0.0646137965714	-1.17526676576	0.666348138802	1.35125490016	0.502820614586	2.12624135621	0.141790902498	-1.83185909336	-0.505773357805	0.49597604432	-0.040176730679	0.0860030583069	0.845131284204	0.136936807178	0.629306511371	-50.523	-27.792	-16.242

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN A AND RESID 203:208 )	A	203 - 208
2	X-RAY DIFFRACTION	2	( CHAIN A AND RESID 209:215 )	A	209 - 215
3	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN A AND RESID 220:230 )	A	220 - 230
4	X-RAY DIFFRACTION	4	( CHAIN A AND RESID 231:329 )	A	231 - 329
5	X-RAY DIFFRACTION	5	( CHAIN A AND RESID 330:338 )	A	330 - 338
6	X-RAY DIFFRACTION	6	( CHAIN A AND RESID 339:364 )	A	339 - 364
7	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN A AND RESID 365:391 )	A	365 - 391
8	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN A AND ( RESID 392:393 OR RESID 401:403 ) )	A	392 - 393
9	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN A AND ( RESID 392:393 OR RESID 401:403 ) )	A	401 - 403
10	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN B AND RESID 14:29 )	B	14 - 29
11	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN B AND RESID 30:54 )	B	30 - 54
12	X-RAY DIFFRACTION	11	( CHAIN B AND RESID 55:75 )	B	55 - 75
13	X-RAY DIFFRACTION	12	( CHAIN B AND RESID 76:81 )	B	76 - 81
14	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN B AND RESID 82:103 )	B	82 - 103
15	X-RAY DIFFRACTION	14	( CHAIN B AND RESID 104:124 )	B	104 - 124
16	X-RAY DIFFRACTION	15	( CHAIN B AND RESID 125:128 )	B	125 - 128
17	X-RAY DIFFRACTION	16	( CHAIN B AND RESID 129:162 )	B	129 - 162
18	X-RAY DIFFRACTION	17	( CHAIN B AND RESID 163:190 )	B	163 - 190
19	X-RAY DIFFRACTION	18	( CHAIN B AND RESID 191:207 )	B	191 - 207
20	X-RAY DIFFRACTION	19	( CHAIN B AND RESID 208:219 )	B	208 - 219
21	X-RAY DIFFRACTION	20	( CHAIN B AND RESID 220:232 )	B	220 - 232
22	X-RAY DIFFRACTION	21	( CHAIN B AND RESID 233:286 )	B	233 - 286
23	X-RAY DIFFRACTION	22	( CHAIN B AND RESID 287:303 )	B	287 - 303
24	X-RAY DIFFRACTION	23	( CHAIN B AND RESID 304:328 )	B	304 - 328
25	X-RAY DIFFRACTION	24	( CHAIN B AND RESID 329:335 )	B	329 - 335
26	X-RAY DIFFRACTION	25	( CHAIN B AND RESID 336:367 )	B	336 - 367
27	X-RAY DIFFRACTION	26	( CHAIN B AND RESID 368:390 )	B	368 - 390
28	X-RAY DIFFRACTION	27	( CHAIN B AND ( RESID 391:393 OR RESID 401:404 ) )	B	391 - 393
29	X-RAY DIFFRACTION	27	( CHAIN B AND ( RESID 391:393 OR RESID 401:404 ) )	B	401 - 404
30	X-RAY DIFFRACTION	28	( CHAIN C AND RESID 13:38 )	C	13 - 38
31	X-RAY DIFFRACTION	29	( CHAIN C AND RESID 39:69 )	C	39 - 69
32	X-RAY DIFFRACTION	30	( CHAIN C AND RESID 70:96 )	C	70 - 96
33	X-RAY DIFFRACTION	31	( CHAIN C AND RESID 97:103 )	C	97 - 103
34	X-RAY DIFFRACTION	32	( CHAIN C AND RESID 104:120 )	C	104 - 120
35	X-RAY DIFFRACTION	33	( CHAIN C AND RESID 121:124 )	C	121 - 124
36	X-RAY DIFFRACTION	34	( CHAIN C AND RESID 130:133 )	C	130 - 133
37	X-RAY DIFFRACTION	35	( CHAIN C AND RESID 134:189 )	C	134 - 189
38	X-RAY DIFFRACTION	36	( CHAIN C AND RESID 190:207 )	C	190 - 207
39	X-RAY DIFFRACTION	37	( CHAIN C AND RESID 208:216 )	C	208 - 216
40	X-RAY DIFFRACTION	38	( CHAIN C AND RESID 217:248 )	C	217 - 248
41	X-RAY DIFFRACTION	39	( CHAIN C AND RESID 249:269 )	C	249 - 269
42	X-RAY DIFFRACTION	40	( CHAIN C AND RESID 270:293 )	C	270 - 293
43	X-RAY DIFFRACTION	41	( CHAIN C AND RESID 294:301 )	C	294 - 301
44	X-RAY DIFFRACTION	42	( CHAIN C AND RESID 302:338 )	C	302 - 338
45	X-RAY DIFFRACTION	43	( CHAIN C AND RESID 339:356 )	C	339 - 356
46	X-RAY DIFFRACTION	44	( CHAIN C AND RESID 357:363 )	C	357 - 363
47	X-RAY DIFFRACTION	45	( CHAIN C AND RESID 368:387 )	C	368 - 387
48	X-RAY DIFFRACTION	46	( CHAIN C AND RESID 388:391 )	C	388 - 391
49	X-RAY DIFFRACTION	47	( CHAIN A AND RESID 14:28 )	A	14 - 28
50	X-RAY DIFFRACTION	48	( CHAIN A AND RESID 29:35 )	A	29 - 35
51	X-RAY DIFFRACTION	49	( CHAIN A AND RESID 36:52 )	A	36 - 52
52	X-RAY DIFFRACTION	50	( CHAIN A AND RESID 53:74 )	A	53 - 74
53	X-RAY DIFFRACTION	51	( CHAIN A AND RESID 75:96 )	A	75 - 96
54	X-RAY DIFFRACTION	52	( CHAIN A AND RESID 97:120 )	A	97 - 120
55	X-RAY DIFFRACTION	53	( CHAIN A AND RESID 121:127 )	A	121 - 127
56	X-RAY DIFFRACTION	54	( CHAIN A AND RESID 128:134 )	A	128 - 134
57	X-RAY DIFFRACTION	55	( CHAIN A AND RESID 135:175 )	A	135 - 175
58	X-RAY DIFFRACTION	56	( CHAIN A AND RESID 176:197 )	A	176 - 197
59	X-RAY DIFFRACTION	57	( CHAIN A AND RESID 198:202 )	A	198 - 202

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試料調製

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データ収集

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解析

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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万見 (Yorodumi)