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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8tem | ||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of Arabidopsis thaliana Bor1 mutant (R637E/E641R/R643E) in the inward-facing conformation in lauryl maltose neopentyl glycol (LMNG) | ||||||
![]() | Boron transporter 1 | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / Borate transporter / Bor1 | ||||||
機能・相同性 | ![]() borate transmembrane transport / response to boron-containing substance / cellular response to boron-containing substance levels / : / active borate transmembrane transporter activity / monoatomic ion homeostasis / solute:inorganic anion antiporter activity / vacuole / transmembrane transporter activity / transmembrane transport ...borate transmembrane transport / response to boron-containing substance / cellular response to boron-containing substance levels / : / active borate transmembrane transporter activity / monoatomic ion homeostasis / solute:inorganic anion antiporter activity / vacuole / transmembrane transporter activity / transmembrane transport / membrane => GO:0016020 / endosome / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.02 Å | ||||||
![]() | Jiang, Y. / Jiang, J. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of borate transporter Bor1 reveals a novel auto-inhibition mechanism for the SLC4 family 著者: Jiang, Y. / Jiang, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 208 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 163.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.4 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.4 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 42.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 62.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 41191 ![]() 41185 ![]() 41186 ![]() 41187 ![]() 41188 ![]() 41190 ![]() 41192 ![]() 8tegC ![]() 8tehC ![]() 8teiC ![]() 8tejC ![]() 8telC ![]() 8tenC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 80108.898 Da / 分子数: 2 / 断片: R637E/E641R/R643E / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: BOR1, At2g47160, T3D7.3 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: Arabidopsis thaliana Boron transporter 1 / タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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分子量 | 実験値: NO |
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 6.5 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: OTHER / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: OTHER |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2500 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 800 nm |
撮影 | 電子線照射量: 55 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) |
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解析
EMソフトウェア |
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CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
対称性 | 点対称性: C2 (2回回転対称) | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 3.02 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 80443 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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