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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8qja | ||||||
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タイトル | T6SS-linked Rhs repeat protein - Advenella mimigardefordensis VgrG-Rhs core | ||||||
要素 | Putative type VI secretion system YD repeat-containing Rhs element Vgr protein | ||||||
キーワード | CELL INVASION / Rhs / T6SS / VgrG-Rhs / toxin cannister / Rhs-repeat | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Bacteriophage T4 gp5 C-terminal trimerisation domain / Domain of unknown function DUF6531 / Domain of unknown function (DUF6531) / RHS protein / RHS protein / Type VI secretion system, RhsGE-associated Vgr family subset / Phage tail baseplate hub (GPD) / RHS repeat / RHS Repeat / Type VI secretion system, RhsGE-associated Vgr protein ...Bacteriophage T4 gp5 C-terminal trimerisation domain / Domain of unknown function DUF6531 / Domain of unknown function (DUF6531) / RHS protein / RHS protein / Type VI secretion system, RhsGE-associated Vgr family subset / Phage tail baseplate hub (GPD) / RHS repeat / RHS Repeat / Type VI secretion system, RhsGE-associated Vgr protein / YD repeat / Gp5/Type VI secretion system Vgr protein, OB-fold domain / Type VI secretion system/phage-baseplate injector OB domain / : / Vgr protein, OB-fold domain superfamily / Rhs repeat-associated core / Quinoprotein alcohol dehydrogenase-like superfamily 類似検索 - ドメイン・相同性 | ||||||
生物種 | Advenella mimigardefordensis DPN7 (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.36 Å | ||||||
データ登録者 | Kielkopf, C.S. / Shneider, M.M. / Leiman, P.G. / Taylor, N.M.I. | ||||||
資金援助 | スイス, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: T6SS-associated Rhs proteins form toxin containers: Structural and functional insights into bacterial weaponry and self-protection 著者: Kielkopf, C.S. / Shneider, M.M. / Leiman, P.G. / Taylor, N.M.I. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 8qja.cif.gz | 2 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb8qja.ent.gz | 1.4 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 8qja.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 8qja_validation.pdf.gz | 514.3 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 8qja_full_validation.pdf.gz | 572.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | 8qja_validation.xml.gz | 149.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 8qja_validation.cif.gz | 188.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qj/8qja ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qj/8qja | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 8qjbC 8qjcC 8qjdC C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
NCSドメイン領域: Ens-ID: ens_1
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