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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8org | ||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of SH-SY5Y seeded with filaments from corticobasal degeneration extracts (Type II) | ||||||
![]() | Microtubule-associated protein tau![]() | ||||||
![]() | PROTEIN FIBRIL / ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() plus-end-directed organelle transport along microtubule / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Lovestam, S. / Scheres, S.H.W. / Goedert, M. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM structures of tau filaments from SH-SY5Y cells seeded with brain extracts from cases of Alzheimer's disease and corticobasal degeneration. 著者: Airi Tarutani / Sofia Lövestam / Xianjun Zhang / Abhay Kotecha / Andrew C Robinson / David M A Mann / Yuko Saito / Shigeo Murayama / Taisuke Tomita / Michel Goedert / Sjors H W Scheres / Masato Hasegawa / ![]() ![]() ![]() 要旨: The formation of amyloid filaments through templated seeding is believed to underlie the propagation of pathology in most human neurodegenerative diseases. A widely used model system to study this ...The formation of amyloid filaments through templated seeding is believed to underlie the propagation of pathology in most human neurodegenerative diseases. A widely used model system to study this process is to seed amyloid filament formation in cultured cells using human brain extracts. Here, we report the electron cryo-microscopy structures of tau filaments from undifferentiated seeded SH-SY5Y cells that transiently expressed N-terminally HA-tagged 1N3R or 1N4R human tau, using brain extracts from individuals with Alzheimer's disease or corticobasal degeneration. Although the resulting filament structures differed from those of the brain seeds, some degrees of structural templating were observed. Studying templated seeding in cultured cells, and determining the structures of the resulting filaments, can thus provide insights into the cellular aspects underlying neurodegenerative diseases. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 104.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 75.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 17123MC ![]() 8oreC ![]() 8orfC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 43034.785 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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EM実験 | 試料の集合状態: FILAMENT / 3次元再構成法: らせん対称体再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: Tau amyloid filaments / タイプ: CELL / Entity ID: all / 由来: NATURAL |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 7.4 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色![]() ![]() |
急速凍結![]() | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: TFS KRIOS |
電子銃 | 電子線源![]() ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | 電子線照射量: 40 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) |
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解析
EMソフトウェア | 名称: RELION / カテゴリ: 3次元再構成 / 詳細: Relion 4.0 | ||||||||||||||||||||||||
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CTF補正![]() | タイプ: NONE | ||||||||||||||||||||||||
らせん対称 | 回転角度/サブユニット: -0.92 ° / 軸方向距離/サブユニット: 4.75 Å / らせん対称軸の対称性: C1 | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成![]() | 解像度: 2.3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 75380 / 対称性のタイプ: HELICAL | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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