+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 8oic | |||||||||
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Title | Trichomonas vaginalis riboside hydrolase (His-tagged) | |||||||||
Components | Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein | |||||||||
Keywords | HYDROLASE / NH-fold / nucleoside hydrolase / riboside hydrolase / nicotinamide riboside | |||||||||
Function / homology | purine nucleosidase activity / Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase / Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase domain / Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase / Ribonucleoside hydrolase-like / purine nucleoside catabolic process / cytosol / Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein Function and homology information | |||||||||
Biological species | Trichomonas vaginalis (eukaryote) | |||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.8 Å | |||||||||
Authors | Patrone, M. / Stockman, B.J. / Degano, M. | |||||||||
Funding support | Italy, United States, 2items
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Citation | Journal: J.Biol.Chem. / Year: 2023 Title: A riboside hydrolase that salvages both nucleobases and nicotinamide in the auxotrophic parasite Trichomonas vaginalis. Authors: Patrone, M. / Galasyn, G.S. / Kerin, F. / Nyitray, M.M. / Parkin, D.W. / Stockman, B.J. / Degano, M. | |||||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 8oic.cif.gz | 1.4 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb8oic.ent.gz | 889.3 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 8oic.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/oi/8oic ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/oi/8oic | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 8oi7C 8oi9C 8oiaC 8oibC C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data | Similarity search - Function & homologyF&H Search |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Beg auth comp-ID: MET / Beg label comp-ID: MET / End auth comp-ID: GLY / End label comp-ID: GLY / Auth asym-ID: A / Label asym-ID: A / Auth seq-ID: 1 - 346 / Label seq-ID: 21 - 366
NCS ensembles :
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