[English] 日本語
Yorodumi- PDB-8j6n: Crystal structure of Cystathionine gamma-lyase in complex with co... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 8j6n | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Crystal structure of Cystathionine gamma-lyase in complex with compound 1 | ||||||
Components | Cystathionine gamma-lyase | ||||||
Keywords | LYASE | ||||||
Function / homology | Function and homology information cystathionine gamma-lyase / L-cystine L-cysteine-lyase (deaminating) / cystathionine gamma-lyase activity / L-cysteine desulfhydrase activity / cysteine biosynthetic process / transsulfuration / pyridoxal phosphate binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Rattus norvegicus (Norway rat) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 1.9 Å | ||||||
Authors | Hibi, R. / Toma-Fukai, S. / Shimizu, T. / Hanaoka, K. | ||||||
Funding support | Japan, 1items
| ||||||
Citation | Journal: Sci Rep / Year: 2023 Title: Discovery of a cystathionine gamma-lyase (CSE) selective inhibitor targeting active-site pyridoxal 5'-phosphate (PLP) via Schiff base formation. Authors: Echizen, H. / Hanaoka, K. / Shimamoto, K. / Hibi, R. / Toma-Fukai, S. / Ohno, H. / Sasaki, E. / Komatsu, T. / Ueno, T. / Tsuchiya, Y. / Watanabe, Y. / Otsuka, T. / Saito, H. / Nagatoishi, S. ...Authors: Echizen, H. / Hanaoka, K. / Shimamoto, K. / Hibi, R. / Toma-Fukai, S. / Ohno, H. / Sasaki, E. / Komatsu, T. / Ueno, T. / Tsuchiya, Y. / Watanabe, Y. / Otsuka, T. / Saito, H. / Nagatoishi, S. / Tsumoto, K. / Kojima, H. / Okabe, T. / Shimizu, T. / Urano, Y. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 8j6n.cif.gz | 951.2 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb8j6n.ent.gz | 787.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 8j6n.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 8j6n_validation.pdf.gz | 3.8 MB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 8j6n_full_validation.pdf.gz | 3.9 MB | Display | |
Data in XML | 8j6n_validation.xml.gz | 194.7 KB | Display | |
Data in CIF | 8j6n_validation.cif.gz | 274.4 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j6/8j6n ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j6/8j6n | HTTPS FTP |
-Related structure data
Similar structure data | Similarity search - Function & homologyF&H Search |
---|
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
|