+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8i5m | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Rat Kir4.1 in complex with PIP2 | ||||||
![]() | ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 10 | ||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / kir4.1 / ion channel / transport protein | ||||||
機能・相同性 | ![]() glutamate reuptake / Potassium transport channels / L-glutamate import / response to blue light / central nervous system myelination / response to mineralocorticoid / regulation of resting membrane potential / cellular response to potassium ion / oligodendrocyte development / astrocyte projection ...glutamate reuptake / Potassium transport channels / L-glutamate import / response to blue light / central nervous system myelination / response to mineralocorticoid / regulation of resting membrane potential / cellular response to potassium ion / oligodendrocyte development / astrocyte projection / inward rectifier potassium channel activity / potassium ion homeostasis / non-motile cilium assembly / membrane hyperpolarization / Activation of G protein gated Potassium channels / Inhibition of voltage gated Ca2+ channels via Gbeta/gamma subunits / adult walking behavior / regulation of monoatomic ion transmembrane transport / monoatomic ion channel complex / ciliary base / optic nerve development / potassium channel activity / potassium ion import across plasma membrane / microvillus / response to glucocorticoid / potassium ion transmembrane transport / visual perception / establishment of localization in cell / regulation of membrane potential / regulation of long-term neuronal synaptic plasticity / potassium ion transport / presynapse / cell body / basolateral plasma membrane / apical plasma membrane / signaling receptor binding / ATP binding / identical protein binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.85 Å | ||||||
![]() | Zhao, C. / Guo, J. | ||||||
資金援助 | ![]()
| ||||||
![]() | ![]() タイトル: Pharmacological inhibition of astrocytic Kir4.1 channel evokes rapid-onset antidepressant responses 著者: Zhao, C. / Guo, J. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 420.5 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 349.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.4 MB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 1.4 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 44.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 55.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 35195MC ![]() 8i5nC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
---|---|
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
|
---|---|
1 |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 38791.723 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-PIO / [( 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
---|---|
EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
-
試料調製
構成要素 | 名称: Rat Kir4.1 in complex with PIP2 / タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1 / 由来: RECOMBINANT |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() |
緩衝液 | pH: 8 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-
電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
---|---|
顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: DARK FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 1400 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1200 nm |
撮影 | 電子線照射量: 62 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) |
-
解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
3次元再構成 | 解像度: 2.85 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 22786 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
|