PDB-8hni: hnRNP A2/B1 RRMs in complex with telomeric DNA

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 8hni

タイトル

hnRNP A2/B1 RRMs in complex with telomeric DNA

要素

DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')
Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

キーワード

DNA BINDING PROTEIN / complex / homodimerization / DNA G4 quadruplex

機能・相同性

機能・相同性情報

miRNA transport / RNA transport / positive regulation of telomere maintenance via telomere lengthening / DNA geometric change / primary miRNA processing / N6-methyladenosine-containing RNA reader activity / single-stranded telomeric DNA binding / G-rich strand telomeric DNA binding / miRNA binding / Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.644 Å

データ登録者

Liu, Y. / Abula, A. / Xiao, H. / Guo, H. / Li, T. / Zheng, L. / Chen, B. / Nguyen, H. / Ji, X.

資金援助

1件

引用

ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2023
タイトル: Structural Insight Into hnRNP A2/B1 Homodimerization and DNA Recognition.
著者: Liu, Y. / Abula, A. / Xiao, H. / Guo, H. / Li, T. / Zheng, L. / Chen, B. / Nguyen, H.C. / Ji, X.

履歴

登録	2022年12月7日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2023年11月29日	Provider: repository / タイプ: Initial release

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	8hni.cif.gz	1.3 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb8hni.ent.gz	1.1 MB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	8hni.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	8hni_validation.pdf.gz	573.6 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	8hni_full_validation.pdf.gz	585.8 KB	表示
XML形式データ	8hni_validation.xml.gz	70.1 KB	表示
CIF形式データ	8hni_validation.cif.gz	94.6 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hn/8hni ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hn/8hni	HTTPS FTP

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関連構造データ

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類似性 (1)
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類似性 (1)
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カスケードとCRISPR (Cascade and CRISPR)
類似性 (1)
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エクスプレソーム (Expressome)
類似性 (1)
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スライディングクランプ (Sliding Clamps)
類似性 (1)
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TALエフェクター (TAL Effectors)
類似性 (1)
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テロメラーゼ (Telomerase)
類似性 (1)
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類似性 (1)
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類似性 (1)
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ビタミンD受容体 (Vitamin D Receptor)
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類似性 (1)
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RNAポリメラーゼ (RNA Polymerase)
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トポイソメラーゼ (Topoisomerase)
類似性 (1)
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ジンクフィンガー (Zinc Fingers)
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#119 - 2009年11月
人工設計DNA結晶 (Designed DNA Crystal)
類似性 (1)
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類似性 (1)
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アクチノマイシン (Actinomycin)
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ヌクレオソーム (Nucleosome)
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制限酵素 (Restriction Enzymes)
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自己スプライシングRNA (Self-splicing RNA)
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#163 - 2013年7月
HIVカプシド (HIV Capsid)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

B: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

C: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

D: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

E: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

F: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

M: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

N: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

O: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

P: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

Q: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

R: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

S: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

T: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

U: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

V: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

W: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

X: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

G: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

H: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

I: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

J: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

K: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

L: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

292 kDa, 24 ポリマー
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1

A: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

M: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

O: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

G: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration
48.6 kDa, 4 ポリマー
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B: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

N: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

P: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

H: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

登録者が定義した集合体
48.6 kDa, 4 ポリマー
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C: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

T: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

V: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

I: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

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D: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

S: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

U: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

J: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

登録者が定義した集合体
48.6 kDa, 4 ポリマー
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E: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

Q: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

R: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

K: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

登録者が定義した集合体
48.6 kDa, 4 ポリマー
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F: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

W: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

X: DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3')

L: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1

登録者が定義した集合体
48.6 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	225.252, 98.306, 145.928
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 130.37, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

#1: タンパク質	Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1 / hnRNP A2/B1 分子量: 20534.172 Da / 分子数: 12 / 断片: UNP RESIDUES 15-193 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: HNRNPA2B1, HNRPA2B1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P22626
#2: DNA鎖	DNA (5'-D(PTPAPGPGPGPTPTPAPGPGPGPT)-3') 分子量: 3773.462 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト)

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.11 Å³/Da / 溶媒含有率: 41.71 %
結晶化	温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法詳細: 200 mM LiCl, 0.1 M MES pH 6.0 , 20% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 6000

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SSRF / ビームライン: BL17U1 / 波長: 0.979 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2020年7月19日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.979 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.64→49.4 Å / Num. obs: 70959 / % possible obs: 99.66 % / 冗長度: 5.6 % / CC_1/2: 0.977 / Net I/σ(I): 32.6
反射シェル	解像度: 2.64→2.69 Å / Num. unique obs: 3533 / R_pim(I) all: 0.089

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.10_2148: ???)	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 1U1Q

1u1q

解像度: 2.644→46.801 Å / SU ML: 0.37 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 29.2 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2615	1996	2.82 %
R_work	0.237	-	-
obs	0.2377	70859	99.55 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.644→46.801 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	16018	2806	0	0	18824

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	19717
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.524	27193
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	18.727	11122
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.043	2935
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.002	3076

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.644-2.7096	0.3795	138	0.3551	4697	X-RAY DIFFRACTION	96
2.7096-2.7829	0.3646	144	0.3417	4925	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7829-2.8647	0.3617	143	0.3361	4921	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8647-2.9572	0.3437	142	0.322	4890	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9572-3.0629	0.3681	144	0.3159	4904	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0629-3.1855	0.3075	144	0.2951	4943	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1855-3.3304	0.2713	142	0.267	4917	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3304-3.506	0.2646	145	0.252	4961	X-RAY DIFFRACTION	100
3.506-3.7255	0.2571	142	0.2271	4910	X-RAY DIFFRACTION	100
3.7255-4.013	0.2358	137	0.2119	4931	X-RAY DIFFRACTION	100
4.013-4.4166	0.2076	144	0.1942	4967	X-RAY DIFFRACTION	100
4.4166-5.055	0.2166	144	0.1919	4920	X-RAY DIFFRACTION	100
5.055-6.3663	0.2437	143	0.2115	4998	X-RAY DIFFRACTION	100
6.3663-10	0.234	144	0.2017	4979	X-RAY DIFFRACTION	98

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.4501	0.3967	0.7648	2.7178	1.4754	5.639	-0.1543	0.9351	0.2626	-0.4318	0.0655	0.3471	-0.0761	-0.6035	0.0115	0.5066	-0.0192	-0.1312	0.6731	-0.0894	0.5986	18.5022	7.8697	19.2966
2	6.2276	-0.4355	0.59	4.1015	0.9205	6.7628	0.1342	1.3523	0.1541	-0.7849	-0.0511	0.192	-0.0857	-0.4195	-0.0466	0.57	-0.0252	-0.0059	0.5456	-0.0569	0.52	21.3064	6.6772	20.9878
3	2.7826	-0.3658	-1.1929	4.1443	-0.5943	3.6831	-0.2491	0.0523	-0.5484	0.1643	0.0226	0.4799	0.3351	-0.4672	0.2463	0.5172	-0.0955	0.0898	0.3948	-0.1725	0.7269	20.1292	-11.0574	40.0712
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46	6.4733	-1.117	0.433	8.409	-1.5287	6.0063	-0.0177	0.9905	-0.3735	-0.8997	-0.0934	0.642	1.1601	-0.7437	-0.008	0.6779	-0.2042	-0.0053	0.7264	0.0614	0.4899	10.0252	34.6958	10.979
47	2.929	1.0668	-0.1782	6.0941	0.3656	4.3272	0.278	-0.3408	0.5088	0.3365	-0.0959	0.5051	-0.1123	-0.4351	-0.0634	0.4283	0.0201	0.1027	0.5073	0.0512	0.4821	15.8465	53.8609	25.5798
48	6.2385	3.2355	-0.3304	9.5217	3.1617	7.852	0.9613	-1.3843	0.469	2.3693	-0.2398	-0.6696	-0.4166	0.0683	-0.1993	0.9343	-0.1199	0.07	0.6264	-0.1394	0.6221	26.6386	65.1056	38.1317
49	3.32	1.4596	0.7131	5.5878	0.6876	4.8602	0.1272	-0.2527	0.4482	-0.1581	-0.1326	0.2001	-0.1263	-0.356	-0.0866	0.4216	0.0499	0.0981	0.4195	0.0613	0.5252	17.9641	54.6554	24.1474
50	3.7802	-0.5955	-3.0582	4.0244	4.673	6.9642	-0.4816	0.6514	-0.4285	1.3227	-0.1479	-0.3721	1.3464	-0.9172	-0.3738	0.8286	-0.3424	-0.2357	0.8515	0.1275	0.5232	21.5861	44.6872	-8.7968
51	1.8853	1.513	0.3949	1.3755	-0.1048	1.1432	0.0103	0.405	0.1979	-0.268	0.7078	1.0394	0.2949	-0.5235	1.7837	0.7787	-0.4079	-0.6289	1.4723	0.7256	0.9814	12.5417	54.3694	-16.7713
52	5.9046	6.8897	-1.4546	8.4428	-1.5619	6.1764	0.2101	1.1599	1.3561	1.5064	0.3236	2.0801	0.5254	-1.1724	-0.638	0.692	0.0446	0.0439	1.1823	0.364	0.8734	10.6573	55.1764	-6.2179
53	4.243	1.0998	-2.6214	0.8383	-0.2323	7.7321	-0.8976	1.7826	-0.0178	-0.7933	1.3193	0.043	0.7136	-0.4761	-0.4573	0.8605	-0.3819	-0.1089	1.0314	-0.0257	0.5628	21.5232	46.4089	-15.1623
54	0.1449	0.404	-0.3803	2.5822	-0.8215	1.0592	0.0351	0.8398	0.1932	-0.3508	0.5463	0.9531	-0.2394	-0.3966	-0.0594	0.5512	-0.1699	-0.2065	1.0363	0.2706	0.5554	22.2055	54.8708	-12.2551
55	5.5771	-0.2917	-2.665	3.879	0.049	9.1725	0.0869	0.1247	0.7693	0.2118	0.5642	-0.2102	-0.2852	0.198	-0.3997	0.6795	-0.0538	0.0034	0.398	0.0486	0.3196	32.0047	56.1096	-2.8814
56	7.3594	-1.6743	1.7823	5.8153	-2.0215	8.4179	-0.0324	0.7192	-0.1124	-0.8377	-0.3011	-0.7567	0.5619	0.9903	0.2172	0.6519	-0.0817	0.2189	0.6953	0.0388	0.5063	48.0079	49.4482	-10.5724
57	4.4164	0.4887	-2.1243	3.2839	-0.1972	3.06	-0.192	-0.1528	-0.2457	0.23	0.1992	-0.0391	0.0512	0.3336	0.083	0.754	-0.0652	0.0801	0.562	0.0732	0.374	40.0327	48.8267	-4.3871
58	0.921	-0.2495	1.2998	2.7221	-0.9903	4.6835	-0.4473	0.2334	1.2752	0.2018	-0.1301	-0.4357	-1.1721	0.6586	0.2674	0.8086	-0.0465	0.2159	0.5661	0.1567	1.4169	-8.0905	26.8305	32.3348
59	9.1872	-0.5167	4.1519	7.5999	0.8943	2.044	-0.1388	-1.7231	0.8974	0.4031	0.2961	1.0389	-0.3737	-1.3854	-1.0765	0.5526	0.0564	0.1248	0.7253	0.0806	1.1163	-13.1111	23.5286	39.9808
60	2.5334	-1.0173	-0.0544	0.4515	0.2474	0.3428	0.5294	1.1748	1.0597	-0.55	-0.397	-0.5951	-0.5095	0.0394	-0.4096	0.7158	0.2356	0.3674	0.9909	0.3558	0.9534	-7.6785	14.2096	18.9225
61	1.9524	-0.5968	1.7957	0.2632	-0.4118	1.9426	0.7557	0.5858	-0.0744	-0.2387	0.0408	0.3988	-0.2242	-0.4351	0.8823	0.7285	0.3332	0.3365	1.019	0.3157	0.811	-12.9225	3.9349	17.2066
62	3.6379	0.966	-0.4536	5.6842	1.5034	6.8821	0.1986	0.1733	0.9187	-0.3818	-0.0255	0.1456	-1.3425	-0.049	-0.1143	0.6459	0.1805	0.0645	0.5363	0.1223	0.7452	74.1366	73.4164	34.9441
63	4.1249	-0.656	-0.1038	5.2326	-2.0152	4.9076	0.0259	-0.3013	-0.1426	0.0652	0.0408	0.0829	-0.0409	-0.2364	-0.0827	0.2917	0.0305	0.0083	0.5429	0.0022	0.3628	75.9834	49.598	43.8915

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 15 through 44 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 45 through 101 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 102 through 193 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resid 15 through 101 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 102 through 193 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'C' and (resid 15 through 26 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'C' and (resid 27 through 63 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'C' and (resid 64 through 81 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'C' and (resid 82 through 101 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 102 through 179 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 180 through 193 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'D' and (resid 15 through 63 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'D' and (resid 64 through 81 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'D' and (resid 82 through 101 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 102 through 135 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 136 through 154 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 155 through 193 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'E' and (resid 15 through 81 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'E' and (resid 82 through 193 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'F' and (resid 15 through 26 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'F' and (resid 27 through 71 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'F' and (resid 72 through 81 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'F' and (resid 82 through 101 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'F' and (resid 102 through 143 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'F' and (resid 144 through 193 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'M' and (resid 2 through 13 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'N' and (resid 2 through 12 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'O' and (resid 2 through 12 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'P' and (resid 2 through 12 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'Q' and (resid 2 through 12 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'R' and (resid 2 through 12 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'S' and (resid 2 through 12 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'T' and (resid 2 through 12 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'U' and (resid 2 through 12 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'V' and (resid 2 through 12 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'W' and (resid 2 through 12 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'X' and (resid 2 through 12 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'G' and (resid 15 through 44 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'G' and (resid 45 through 112 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'G' and (resid 113 through 193 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'H' and (resid 15 through 33 )
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'H' and (resid 34 through 81 )
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'H' and (resid 82 through 101 )
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'H' and (resid 102 through 112 )
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'H' and (resid 113 through 193 )
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'I' and (resid 15 through 91 )
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'I' and (resid 92 through 143 )
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'I' and (resid 144 through 154 )
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'I' and (resid 155 through 193 )
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'J' and (resid 15 through 26 )
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'J' and (resid 27 through 44 )
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'J' and (resid 45 through 63 )
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'J' and (resid 64 through 81 )
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'J' and (resid 82 through 101 )
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'J' and (resid 102 through 112 )
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'J' and (resid 113 through 163 )
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'J' and (resid 164 through 193 )
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'K' and (resid 16 through 44 )
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'K' and (resid 45 through 63 )
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'K' and (resid 64 through 171 )
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'K' and (resid 172 through 193 )
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'L' and (resid 15 through 88 )
63	X-RAY DIFFRACTION	63	chain 'L' and (resid 89 through 193 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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