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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8gac | ||||||
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タイトル | Crystal structure of a high affinity CTLA-4 binder | ||||||
![]() | CTLA-4 binder | ||||||
![]() | PROTEIN BINDING / De novo protein design / high affinity binder / CTLA-4 | ||||||
生物種 | synthetic construct (人工物) | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Yang, W. / Almo, S.C. / Ghosh, A. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of a high affinity CTLA-4 binder 著者: Yang, W. / Almo, S.C. / Ghosh, A. / Baker, D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 57 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 40.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12636.498 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) synthetic construct (人工物) / プラスミド: pET29 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-EDO / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
研究の焦点であるリガンドがあるか | N |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.2 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.01 % / 解説: Thin plates |
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結晶化 | 温度: 292 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 30 % (w/v) PEG 3350, 0.22 M MgCl2 and 0.0.8 M Bis-Tris pH 5.5 and 0.15 M HEPES |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2022年9月22日 / 詳細: KB MIRRORS |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.98 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.85→19.85 Å / Num. obs: 9931 / % possible obs: 99.6 % / 冗長度: 10.6 % / Biso Wilson estimate: 26.37 Å2 / CC1/2: 0.99 / CC star: 1 / Rmerge(I) obs: 0.08 / Net I/σ(I): 18.4 |
反射 シェル | 解像度: 1.85→1.92 Å / Num. unique obs: 1170 / CC1/2: 0.43 / CC star: 0.78 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.85→19.85 Å
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