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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8fuo | ||||||
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タイトル | Fe-bound AibH1H2 | ||||||
![]() | (Amidohydrolase![]() | ||||||
![]() | ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() secondary metabolic process / : / ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Powell, M.M. / Rittle, J. | ||||||
資金援助 | 1件
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![]() | ![]() タイトル: Enzymatic Hydroxylation of Aliphatic C-H Bonds by a Mn/Fe Cofactor. 著者: Powell, M.M. / Rao, G. / Britt, R.D. / Rittle, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 299.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 236 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 43992.102 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: Rhow_000804 / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() #2: タンパク質 | ![]() 分子量: 42272.211 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: Rhow_000803 / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() #3: 化合物 | ChemComp-FE / ![]() #4: 化合物 | ChemComp-TRS / | ![]() #5: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.44 % |
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結晶化![]() | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.7 / 詳細: 0.16M MgCl2, 0.08M Tris-HCl, 20% PEG4000 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2021年7月6日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.43→79.74 Å / Num. obs: 55039 / % possible obs: 96.7 % / 冗長度: 11.8 % / Biso Wilson estimate: 49.85 Å2 / CC1/2: 0.999 / Net I/σ(I): 18.3 |
反射 シェル | 解像度: 2.43→2.52 Å / 冗長度: 10.3 % / Num. unique obs: 5260 / CC1/2: 0.81 / % possible all: 93.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 開始モデル: 6M2I 解像度: 2.43→79.74 Å / SU ML: 0.3897 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 26.4901 / 立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 52.91 Å2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.43→79.74 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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