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- PDB-8ev1: Dual Modulators -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 8ev1
タイトルDual Modulators
要素
  • Estrogen Receptor
  • Estrogen receptor
  • Nuclear receptor coactivator 2
キーワードDNA BINDING PROTEIN / ER-alpha / ligand complex / carbonic anhydrase
機能・相同性
機能・相同性情報


regulation of epithelial cell apoptotic process / antral ovarian follicle growth / G protein-coupled estrogen receptor activity / RNA polymerase II intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding / regulation of branching involved in prostate gland morphogenesis / RUNX1 regulates transcription of genes involved in WNT signaling / RUNX1 regulates estrogen receptor mediated transcription / regulation of toll-like receptor signaling pathway / prostate epithelial cord arborization involved in prostate glandular acinus morphogenesis / nuclear estrogen receptor activity ...regulation of epithelial cell apoptotic process / antral ovarian follicle growth / G protein-coupled estrogen receptor activity / RNA polymerase II intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding / regulation of branching involved in prostate gland morphogenesis / RUNX1 regulates transcription of genes involved in WNT signaling / RUNX1 regulates estrogen receptor mediated transcription / regulation of toll-like receptor signaling pathway / prostate epithelial cord arborization involved in prostate glandular acinus morphogenesis / nuclear estrogen receptor activity / epithelial cell proliferation involved in mammary gland duct elongation / epithelial cell development / prostate epithelial cord elongation / locomotor rhythm / negative regulation of smooth muscle cell apoptotic process / mammary gland branching involved in pregnancy / uterus development / vagina development / aryl hydrocarbon receptor binding / TFIIB-class transcription factor binding / regulation of lipid metabolic process / androgen metabolic process / steroid hormone receptor signaling pathway / cellular response to Thyroglobulin triiodothyronine / regulation of glucose metabolic process / Synthesis of bile acids and bile salts / mammary gland alveolus development / estrogen receptor signaling pathway / cellular response to estrogen stimulus / Endogenous sterols / Synthesis of bile acids and bile salts via 27-hydroxycholesterol / estrogen response element binding / Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol / : / nuclear receptor-mediated steroid hormone signaling pathway / negative regulation of canonical NF-kappaB signal transduction / Nuclear signaling by ERBB4 / RNA polymerase II preinitiation complex assembly / Recycling of bile acids and salts / cellular response to hormone stimulus / protein localization to chromatin / 14-3-3 protein binding / positive regulation of adipose tissue development / peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway / RORA activates gene expression / TBP-class protein binding / nitric-oxide synthase regulator activity / steroid binding / Regulation of lipid metabolism by PPARalpha / regulation of cellular response to insulin stimulus / TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of growth factors and their receptors / ESR-mediated signaling / transcription corepressor binding / BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression / SUMOylation of transcription cofactors / negative regulation of miRNA transcription / Activation of gene expression by SREBF (SREBP) / nuclear receptor coactivator activity / positive regulation of nitric-oxide synthase activity / cellular response to estradiol stimulus / transcription coregulator binding / response to progesterone / stem cell differentiation / nuclear estrogen receptor binding / nuclear receptor binding / circadian regulation of gene expression / Heme signaling / SUMOylation of intracellular receptors / euchromatin / mRNA transcription by RNA polymerase II / Activated PKN1 stimulates transcription of AR (androgen receptor) regulated genes KLK2 and KLK3 / Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis / negative regulation of DNA-binding transcription factor activity / PPARA activates gene expression / Cytoprotection by HMOX1 / beta-catenin binding / transcription coactivator binding / positive regulation of DNA-binding transcription factor activity / Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation / Nuclear Receptor transcription pathway / response to estrogen / RNA polymerase II transcription regulator complex / Regulation of RUNX2 expression and activity / Constitutive Signaling by Aberrant PI3K in Cancer / nuclear receptor activity / male gonad development / positive regulation of nitric oxide biosynthetic process / sequence-specific double-stranded DNA binding / positive regulation of fibroblast proliferation / Ovarian tumor domain proteases / Circadian Clock / PIP3 activates AKT signaling / response to estradiol / phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway / HATs acetylate histones / positive regulation of cytosolic calcium ion concentration / ATPase binding / regulation of inflammatory response / fibroblast proliferation / PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
類似検索 - 分子機能
Nuclear receptor coactivator 2 / Nuclear receptor coactivator 2/3, DUF4927 / Domain of unknown function (DUF4927) / Estrogen receptor / Oestrogen-type nuclear receptor final C-terminal domain / : / Oestrogen receptor / Oestrogen-type nuclear receptor final C-terminal / Estrogen receptor/oestrogen-related receptor / Nuclear receptor coactivator, DUF1518 ...Nuclear receptor coactivator 2 / Nuclear receptor coactivator 2/3, DUF4927 / Domain of unknown function (DUF4927) / Estrogen receptor / Oestrogen-type nuclear receptor final C-terminal domain / : / Oestrogen receptor / Oestrogen-type nuclear receptor final C-terminal / Estrogen receptor/oestrogen-related receptor / Nuclear receptor coactivator, DUF1518 / Nuclear receptor coactivator, Ncoa-type, interlocking / Nuclear receptor coactivator, Ncoa-type, interlocking domain superfamily / Nuclear receptor coactivator, DUF1518 / Nuclear receptor coactivator / DUF1518 / Nuclear receptor coactivator, receptor-binding domain / Nuclear receptor coactivator / Steroid receptor coactivator / Unstructured region on nuclear receptor coactivator protein / PAS domain / Nuclear receptor coactivator, interlocking / Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily / helix loop helix domain / Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain / Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain profile. / PAS fold / PAS fold / PAS domain / PAS repeat profile. / PAS domain / PAS domain superfamily / Nuclear hormone receptor / Nuclear hormones receptors DNA-binding region signature. / Zinc finger, nuclear hormone receptor-type / Zinc finger, C4 type (two domains) / Nuclear hormone receptors DNA-binding domain profile. / c4 zinc finger in nuclear hormone receptors / Nuclear hormone receptor, ligand-binding domain / Nuclear hormone receptor-like domain superfamily / Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor / Nuclear receptor (NR) ligand-binding (LBD) domain profile. / Ligand binding domain of hormone receptors / Zinc finger, NHR/GATA-type
類似検索 - ドメイン・相同性
Chem-WVR / Chem-WVW / Estrogen receptor / Nuclear receptor coactivator 2
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.83 Å
データ登録者Tinivella, A. / Nwachukwu, J.C. / Angeli, A. / Foschi, F. / Benatti, A.L. / Pinzi, L. / Izard, T. / Ferraroni, M. / Rangarajan, E.S. / Christodoulou, M. ...Tinivella, A. / Nwachukwu, J.C. / Angeli, A. / Foschi, F. / Benatti, A.L. / Pinzi, L. / Izard, T. / Ferraroni, M. / Rangarajan, E.S. / Christodoulou, M. / Passarella, D. / Supuran, C. / Nettles, K.W. / Rastelli, G.
資金援助 米国, 1件
組織認可番号国
National Institutes of Health/National Cancer Institute (NIH/NCI) 米国
引用ジャーナル: Eur.J.Med.Chem. / 年: 2022
タイトル: Design, synthesis, biological evaluation and crystal structure determination of dual modulators of carbonic anhydrases and estrogen receptors.
著者: Tinivella, A. / Nwachukwu, J.C. / Angeli, A. / Foschi, F. / Benatti, A.L. / Pinzi, L. / Izard, T. / Ferraroni, M. / Erumbi, R. / Christodoulou, M.S. / Passarella, D. / Supuran, C.T. / Nettles, K.W. / Rastelli, G.
履歴
登録2022年10月19日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02022年12月28日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12023年10月25日Group: Data collection / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: Estrogen Receptor
B: Estrogen receptor
C: Nuclear receptor coactivator 2
D: Nuclear receptor coactivator 2
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)62,9637
ポリマ－61,9304
非ポリマー1,0333
水2,324129
1
A: Estrogen Receptor
C: Nuclear receptor coactivator 2
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)31,6254
ポリマ－30,9362
非ポリマー6892
水362
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area960 Å2
ΔGint-8 kcal/mol
Surface area11510 Å2
手法PISA
2
B: Estrogen receptor
D: Nuclear receptor coactivator 2
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)31,3383
ポリマ－30,9942
非ポリマー3441
水181
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area1020 Å2
ΔGint-8 kcal/mol
Surface area11190 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)54.055, 82.633, 58.553
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 110.930, 90.000
Int Tables number4
Space group name H-MP1211

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要素

-
タンパク質 , 2種, 2分子 AB

#1: タンパク質 Estrogen Receptor


分子量: 29356.586 Da / 分子数: 1 / 断片: Ligand binding domain / 変異: Y537S / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P03372
#2: タンパク質 Estrogen receptor / ER / ER-alpha / Estradiol receptor / Nuclear receptor subfamily 3 group A member 1


分子量: 29413.637 Da / 分子数: 1 / 断片: Ligand binding domain / 変異: Y537S / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: ESR1, ESR, NR3A1 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P03372

-
タンパク質・ペプチド , 1種, 2分子 CD

#3: タンパク質・ペプチド Nuclear receptor coactivator 2 / NCoA-2 / Class E basic helix-loop-helix protein 75 / bHLHe75 / Transcriptional intermediary factor 2 / hTIF2


分子量: 1579.866 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q15596

-
非ポリマー , 3種, 132分子

#4: 化合物 ChemComp-WVW / (3aS,4R,9bR)-4-(4-hydroxyphenyl)-2,3,3a,4,5,9b-hexahydro-1H-cyclopenta[c]quinoline-8-sulfonamide


分子量: 344.428 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C18H20N2O3S / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#5: 化合物 ChemComp-WVR / (3aR,4S,9bS)-4-(4-hydroxyphenyl)-2,3,3a,4,5,9b-hexahydro-1H-cyclopenta[c]quinoline-8-sulfonamide


分子量: 344.428 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C18H20N2O3S / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#6: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 129 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

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詳細

研究の焦点であるリガンドがあるかY

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 1.97 Å3/Da / 溶媒含有率: 37.63 %
結晶化温度: 298 K / 手法: 蒸発脱水法
詳細: 20-25% PEG 3350, 200 mM MgCl2, 200 mM NaCl, 0.1 M Hepes pH 7
PH範囲: 6.5 - 8.0

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 22-BM / 波長: 1 Å
検出器タイプ: MAR CCD 165 mm / 検出器: CCD / 日付: 2019年7月18日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1 Å / 相対比: 1
反射解像度: 1.828→50.54 Å / Num. obs: 27680 / % possible obs: 92.6 % / 冗長度: 7.6 % / CC1/2: 0.998 / Rmerge(I) obs: 0.123 / Net I/σ(I): 12
反射 シェル解像度: 1.828→2.068 Å / Num. unique obs: 1385 / CC1/2: 0.513

-
位相決定

位相決定手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類NB
REFMAC5.8.0253精密化
XDSデータ削減
Aimlessデータスケーリング
PHASER位相決定
PDB_EXTRACT3.27データ抽出
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 2qzo

2qzo


解像度: 1.83→50.54 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.964 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.939 / SU B: 10.527 / SU ML: 0.143 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.248 / ESU R Free: 0.191 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: U VALUES : WITH TLS ADDED HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : RESIDUAL ONLY
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.2242 1383 5 %RANDOM
Rwork0.1761 ---
obs0.1785 26302 64.78 %-
溶媒の処理イオンプローブ半径: 0.7 Å / 減衰半径: 0.7 Å / VDWプローブ半径: 1 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータBiso max: 223.65 Å2 / Biso mean: 48.005 Å2 / Biso min: 9.13 Å2
Baniso -1Baniso -2Baniso -3
1--0.1 Å2-0 Å2-0.18 Å2
2--0.31 Å20 Å2
3----0.06 Å2
精密化ステップサイクル: final / 解像度: 1.83→50.54 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数3888 0 72 129 4089
Biso mean--91.73 39.92 -
残基数----488
拘束条件
Refine-IDタイプDev idealDev ideal target数
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_refined_d0.0070.0184106
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_other_d0.0020.023965
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_refined_deg1.1221.9465554
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_other_deg1.0572.9339179
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_1_deg5.2835483
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_2_deg39.07324.226168
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_3_deg14.82715772
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_4_deg24.051522
X-RAY DIFFRACTIONr_chiral_restr0.0690.2648
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_refined0.0040.024335
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_other0.0010.02771
X-RAY DIFFRACTIONr_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_nbd_other
X-RAY DIFFRACTIONr_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTIONr_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTIONr_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTIONr_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTIONr_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTIONr_sphericity_bonded
LS精密化 シェル解像度: 1.83→1.873 Å / Rfactor Rfree error: 0
Rfactor反射数%反射
Rfree0.38 3 -
Rwork0.398 38 -
obs--1.31 %
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
15.92974.3056-0.21687.61810.27533.02370.2275-0.36770.20130.3705-0.2140.336-0.05110.0668-0.01350.05280.0173-0.00250.0726-0.02990.03435.63916.21433.384
23.6703-0.3686-0.91074.1833-1.42723.3969-0.03910.0142-0.1793-0.1470.02920.10320.2051-0.17390.00990.014-0.0089-0.00360.0162-0.00250.0211.05112.17125.705
317.28535.69245.3196.38161.85815.14820.052-0.0395-0.4701-0.1843-0.1227-0.09860.4358-0.00020.07070.1170.02650.05540.023-0.01710.11259.9512.47420.26
44.85040.583-0.01942.2169-0.09473.88790.0468-0.03150.2209-0.0991-0.07270.0207-0.1940.20310.02590.0178-0.0092-0.00020.02130.00320.020514.01619.4119.868
59.539-0.08951.70414.57510.689410.1220.07720.3821-0.759-0.5322-0.1140.01060.274-0.54950.03680.0886-0.0225-0.02940.2309-0.02770.2317-10.78113.57718.808
64.5382-0.22233.90282.5723-1.04058.3786-0.0891-0.25460.0244-0.1671-0.0921-0.20870.3020.55710.18110.13790.02350.09090.21240.00390.071124.34315.565-5.385
72.4190.53740.28682.691-0.62917.1662-0.22130.1293-0.1840.02390.023-0.0270.7642-0.08080.19830.20250.01810.06660.02870.00030.041114.9039.818-4.397
84.05580.9466-4.28666.3842.133814.1063-0.1890.57170.5786-0.40770.04150.3118-1.1052-0.30430.14750.31980.0234-0.1160.16640.11330.153810.9627.779-8.885
910.23316.68556.253215.2804-2.057.2736-0.0324-0.25180.2336-0.27450.09640.47220.1485-0.3207-0.0640.46980.20990.04310.5720.03570.5496-2.5225.524-5.824
1018.44952.27492.36264.3362-0.84533.8976-0.0564-0.11030.51760.0602-0.04020.2675-0.3941-0.36310.09650.21060.0873-0.00150.07930.01680.07358.67326.7222.116
113.45311.04530.92159.11-1.85874.2337-0.0631-0.0268-0.23460.117-0.1480.03090.36810.28270.21110.09880.04480.05390.13550.0130.048720.93310.6747.172
124.37550.38590.65742.8242-0.22435.3699-0.12510.0554-0.1391-0.2698-0.0423-0.13620.11380.39270.16740.03950.01580.02790.07680.030.027219.7616.1089.082
1317.6507-1.6643-3.68278.26062.60932.6187-0.24020.07580.01520.36320.06230.41330.2856-0.23870.1780.3881-0.1330.05150.3589-0.02010.30581.6025.889-6.225
149.63923.6691-0.808112.21682.99363.8455-0.0308-0.11630.2942-0.16680.11560.4236-0.2487-0.1217-0.08480.11160.0485-0.01430.06330.00410.201-8.36227.59526.241
1512.914-0.40251.65110.66910.32170.4472-0.04970.5133-0.81980.22610.2147-0.03290.20580.1856-0.1650.43970.02490.00890.1144-0.05110.275715.416-2.293-8.023
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1A305 - 338
2X-RAY DIFFRACTION2A339 - 421
3X-RAY DIFFRACTION3A422 - 437
4X-RAY DIFFRACTION4A438 - 530
5X-RAY DIFFRACTION5A531 - 547
6X-RAY DIFFRACTION6B307 - 338
7X-RAY DIFFRACTION7B339 - 394
8X-RAY DIFFRACTION8B395 - 411
9X-RAY DIFFRACTION9B412 - 421
10X-RAY DIFFRACTION10B422 - 437
11X-RAY DIFFRACTION11B438 - 469
12X-RAY DIFFRACTION12B470 - 530
13X-RAY DIFFRACTION13B531 - 548
14X-RAY DIFFRACTION14C568 - 576
15X-RAY DIFFRACTION15D568 - 576

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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