PDB-8cd8: Ulilysin - C269A with AEBSF complex

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 8cd8

タイトル

Ulilysin - C269A with AEBSF complex

要素

GLY-SER-SER
Ulilysin

キーワード

HYDROLASE / Inhibitor / complex / protease / serine protease / metalloprotease / metzincin

機能・相同性

機能・相同性情報

加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; その他のペプチターゼ / metallopeptidase activity / proteolysis / metal ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Methanosarcina acetivorans C2A (古細菌)

Escherichia coli (大腸菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.65 Å

データ登録者

Rodriguez-Banqueri, A. / Eckhard, U. / Gomis-Ruth, F.X.

資金援助

スペイン, 1件

引用

ジャーナル: Dalton Trans / 年: 2023
タイトル: Structural insights into latency of the metallopeptidase ulilysin (lysargiNase) and its unexpected inhibition by a sulfonyl-fluoride inhibitor of serine peptidases.
著者: Rodriguez-Banqueri, A. / Moliner-Culubret, M. / Mendes, S.R. / Guevara, T. / Eckhard, U. / Gomis-Ruth, F.X.

#1: ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 2012
タイトル: Towards automated crystallographic structure refinement with phenix.refine.
著者: Afonine, P.V. / Grosse-Kunstleve, R.W. / Echols, N. / Headd, J.J. / Moriarty, N.W. / Mustyakimov, M. / Terwilliger, T.C. / Urzhumtsev, A. / Zwart, P.H. / Adams, P.D.

#2: ジャーナル: Acta Crystallogr D Struct Biol / 年: 2019
タイトル: Macromolecular structure determination using X-rays, neutrons and electrons: recent developments in Phenix.
著者: Dorothee Liebschner / Pavel V Afonine / Matthew L Baker / Gábor Bunkóczi / Vincent B Chen / Tristan I Croll / Bradley Hintze / Li Wei Hung / Swati Jain / Airlie J McCoy / Nigel W Moriarty / ...
要旨: Diffraction (X-ray, neutron and electron) and electron cryo-microscopy are powerful methods to determine three-dimensional macromolecular structures, which are required to understand biological ...

履歴

登録	2023年1月30日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2023年3月22日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年3月29日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	8cd8.cif.gz	283.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb8cd8.ent.gz	190.6 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	8cd8.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	8cd8_validation.pdf.gz	4.3 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	8cd8_full_validation.pdf.gz	4.3 MB	表示
XML形式データ	8cd8_validation.xml.gz	28.7 KB	表示
CIF形式データ	8cd8_validation.cif.gz	43.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cd/8cd8 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cd/8cd8	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	8cdbC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#28 - 2002年4月炭疽毒素 (Anthrax Toxin) 類似性 (1) #237 - 2019年9月ナノディスクと高密度リポタンパク質 (Nanodiscs and HDL) 類似性 (1) #44 - 2003年8月カルモジュリン (Calmodulin) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Ulilysin

B: GLY-SER-SER

C: Ulilysin

D: GLY-SER-SER

ヘテロ分子

82.2 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Ulilysin

B: GLY-SER-SER

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
41.1 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

C: Ulilysin

D: GLY-SER-SER

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
41.1 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	50.130, 124.660, 86.900
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	18
Space group name H-M	P2₁2₁2
Space group name Hall	P22ab
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: x+1/2,-y+1/2,-z #3: -x+1/2,y+1/2,-z #4: -x,-y,z

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
d_1	ens_1	(chain "A" and (resid 61 through 150 or resid 152 through 999))
d_2	ens_1	(chain "B" and (resid 61 through 150 or resid 152 through 999))
d_1	ens_2	chain "C"
d_2	ens_2	chain "D"

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Beg label comp-ID	End label comp-ID	Label asym-ID	Label seq-ID
d_1	1	ens_1	ARG	THR	A	1 - 90
d_1	2	ens_1	ASP	ALA	A	94 - 264
d_1	3	ens_1	CA	CA	B
d_1	4	ens_1	CA	CA	C
d_2	1	ens_1	ARG	THR	G	1 - 90
d_2	2	ens_1	ASP	ALA	G	94 - 264
d_2	3	ens_1	CA	CA	H
d_2	4	ens_1	CA	CA	I
d_1	1	ens_2	GLY	SER	F	1 - 3
d_2	1	ens_2	GLY	SER	L	1 - 3

NCSアンサンブル:

ID
ens_1
ens_2

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(-0.999998852252, 0.00150011895311, -0.000212458106001), (-0.00149772943777, -0.999940201183, -0.0108328604284), (-0.000228695980503, -0.0108325297902, 0.999941300275)	24.9735291646, 62.2673536227, 0.37315368688
2	given	(-0.999976297157, -0.00688083527802, -0.000243373326141), (0.00688317488978, -0.999910483148, -0.0114737785851), (-0.000164402359667, -0.0114751818051, 0.999934144419)	25.2730068093, 62.0512493582, 0.399276154775

-
タンパク質 / タンパク質・ペプチド , 2種, 4分子 ACBD

#1: タンパク質	Ulilysin 分子量: 40413.957 Da / 分子数: 2 / 変異: C269A / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Methanosarcina acetivorans C2A (古細菌) 遺伝子: MA_3214 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) 参照: UniProt: Q8TL28, 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; その他のペプチターゼ
#2: タンパク質・ペプチド	GLY-SER-SER 分子量: 249.223 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Escherichia coli (大腸菌)

-
非ポリマー , 5種, 699分子

#3: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#4: 化合物	ChemComp-ZN / ZINC ION 分子量: 65.409 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#5: 化合物	ChemComp-AES / 4-(2-AMINOETHYL)BENZENESULFONYL FLUORIDE / AEBSF / AEBSF 分子量: 203.234 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈H₁₀FNO₂S / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: プロテアーゼ阻害剤*YM
#6: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#7: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 688 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法詳細: 100 mM MES pH 6.5, 200 mM calcium chloride, 18% polyethylene glycol 8000

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ALBA / ビームライン: XALOC / 波長: 0.97866 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2020年6月4日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97866 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.65→86.9 Å / Num. obs: 66338 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 6 % / B_iso Wilson estimate: 53.7 Å² / R_rim(I) all: 0.125 / Net I/σ(I): 11.8
反射シェル	解像度: 1.65→1.65 Å / Num. unique obs: 66008 / R_rim(I) all: 0.125 / % possible all: 99.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.18.2_3874	精密化
PHENIX	1.18.2_3874	精密化
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHENIX	1.18.2_3874	位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 1.65→62.33 Å / SU ML: 0.2274 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 41.7301
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2429	752	1.14 %
R_work	0.2073	65256	-
obs	0.2077	66008	99.43 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 29.07 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.65→62.33 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	4114	0	45	688	4847

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.006	4286
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.9013	5844
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0598	626
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.006	776
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	24.3236	1546

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
ens_1	d_2	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.181657867527
ens_2	d_2	B	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.0257292901405

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.65-1.78	0.4293	147	0.3587	12862	X-RAY DIFFRACTION	99.24
1.78-1.96	0.2977	153	0.2849	12885	X-RAY DIFFRACTION	99.55
1.96-2.24	0.2631	144	0.2201	12987	X-RAY DIFFRACTION	99.48
2.24-2.82	0.2374	145	0.2098	13101	X-RAY DIFFRACTION	99.77
2.82-62.33	0.2078	163	0.1698	13421	X-RAY DIFFRACTION	99.1

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.290486224703	-0.0164015736338	0.102611107652	0.0978681392208	-0.0206946372694	0.522010913643	-0.0986379629547	0.205174950869	-0.165040367932	0.0610626224485	-0.00903263282341	0.0401938454249	-0.313532914415	0.0521591755037	-0.0415123886252	0.215909842323	0.00319834139674	-0.0733592301626	0.21759652512	0.0113101320472	0.260928399529	21.577	48.887	-12.064
2	0.0724468064698	-0.0217581568543	-0.0538067600772	0.0144713845643	0.00492333769187	0.0504703292089	-0.155022903261	0.064083989639	0.0844937332832	0.177978964692	-0.0157912282786	-0.0666481319185	-0.517843228505	0.0444923436763	-0.00140678480685	0.388525072357	-0.0196054553248	-0.0956976173593	0.18931580353	0.0360101706421	0.317235895879	20.653	56.197	-17.679
3	0.737155605284	-0.208653123632	0.482961892825	0.111924226749	0.00420340030183	0.575049289876	-0.0980442752096	-0.0514059371368	0.0925217483091	0.00769486726821	0.0333264940184	-0.140176871663	-0.165665484213	0.0121688401328	-6.91772750329E-6	0.276967937822	0.0222952366817	-0.0206409706257	0.176941677625	0.0107500577434	0.22801323414	17.271	47.248	-14.546
4	0.0258657991942	-0.0113933868633	-0.0165376135078	0.0129027248117	0.0110419688841	0.0321409441327	0.190905286229	0.493358667793	-0.248486678863	-0.00948811754744	-0.113266903871	-0.08528184784	0.23582973115	0.0927546799693	4.42472976227E-5	0.332789932806	-0.000299107877195	0.00679595021949	0.308457030107	-0.0805954643893	0.291170181497	24.19	33.7	-24.515
5	0.134661800146	-0.136086471283	0.180765874094	0.153407683804	-0.25999121178	0.449307218915	-0.0566646085806	0.0954226023792	0.0219590448157	0.0215382279935	0.0094299092598	-0.0355709077214	-0.119508863294	-0.0344831108141	-7.25350206415E-6	0.29906571473	-0.0372877684698	0.0023918986509	0.201891931654	0.0308653648208	0.225137046871	16.545	44.382	-22.693
6	0.404042773025	0.355359200306	-0.0805189153982	0.562359564821	-0.0239843695267	0.0267572882122	0.00326551804307	0.341159882439	0.0464959402673	-0.0576187916704	-0.030659878679	0.248751068131	0.129881943611	-0.298751083003	0.0420841979566	0.414706126257	-0.0601404880928	-0.0512322428197	0.355117402392	-0.00400732874385	0.178517972995	4.832	40.048	-37.864
7	0.0568293169731	-0.0767588652529	0.012778587977	0.123754896984	-0.0752854061103	0.114586087983	0.055959337498	0.0982125208791	0.0915963330264	-0.163719360638	-0.0191025828127	-0.103290692423	-0.075940246823	-0.0379845593471	1.98008376552E-5	0.28230916484	-0.00806532317479	-0.00228003277544	0.242477430183	0.0573191122758	0.225512833835	14.286	49.806	-37.936
8	0.0805837679304	0.00137979021414	-0.0316481405388	0.0596523760749	-0.0146040389677	0.0898105903247	-0.00202445815329	-0.0865558302943	0.139849009365	-0.0617192861694	0.135090405231	0.0627052853396	-0.154153612815	-0.2185717235	0.000851974173033	0.222516358885	0.0985805332919	-0.000713826110948	0.329003993588	0.00735719472177	0.270600095	1.74	50.838	-18.022
9	0.108668133117	0.0418049239216	-0.00224605451553	0.0160463643356	-0.000796667048682	0.00105937489488	0.076320845569	0.00862096807753	-0.0584463879463	-0.010951273016	0.0586082545464	-0.0612080890294	0.0504389522104	-0.0114982489895	-9.90637176027E-5	0.817762001471	0.0927129798394	0.0395214205442	0.477806647933	0.124930943639	0.48177494776	13.534	38.172	-25.724
10	0.14362245266	0.145289457698	-0.0261680605319	0.164782091803	-0.079253892285	0.273591572024	-0.0889638245186	0.142167773059	0.0853189241522	0.0658352538909	-0.0100080427724	0.0272758670327	0.273391669748	-0.115947684214	-0.000424519156492	0.285749622984	-0.00112436603309	0.0156941094085	0.236416346017	-0.0328067610174	0.247462184387	3.469	13.468	-12.224
11	0.219103168409	-0.11443406414	-0.0477438935756	0.144834502123	-0.14892167544	0.367489706051	-0.172234655503	0.130782180702	-0.0626761076269	-0.0445643251963	-0.00392815348564	0.009669774206	0.519214827836	-0.201912949371	-0.0310519325598	0.347413192495	-0.119425677255	0.073138991311	0.235093330959	-0.0578114609653	0.282943085537	4.379	6.227	-17.891
12	0.726741899494	-0.104109573063	-0.486558349135	0.0647831163494	-0.0658126021868	0.635266283089	-0.135588169541	-0.00136833362218	-0.08099705673	-0.0168237938641	0.0297723474077	0.110684912296	0.180030240831	-0.0787037215224	0.00335626417428	0.220403394486	-0.0368024623771	0.00969787759903	0.19162992692	-0.0176406404468	0.231826226705	7.779	15.17	-14.696
13	0.030316264032	-0.0147356765735	0.0131180928464	0.0113466245935	-0.00586798383873	0.0306327921505	0.114621540532	0.491317490102	0.0866571754388	-0.0689530621192	-0.114423953292	0.0725003730995	-0.157341234244	-0.14283468273	0.000107768202736	0.320690970365	-0.00771558023359	0.0327958854205	0.357882470221	0.0756256850349	0.256487369207	0.858	28.769	-24.541
14	0.172230398896	-0.0102885893419	-0.157738009941	0.0979082454997	0.0799681718964	0.310200599102	-0.0456545198423	0.220979745554	-0.0671751469131	-0.0848292358881	-0.0157799853032	-0.121643919617	0.105242128488	-0.120986639215	-0.158116130626	-0.00675099291165	-0.13758798101	0.010386161403	0.302625741632	-0.102992950125	0.254407560657	4.602	18.19	-20.002
15	0.115834079358	-0.153288284014	-0.0730166188297	0.217208441681	0.137165906552	0.129230629786	-0.0106373699733	0.132874317908	-0.0377016000068	-0.0837876198615	-0.00680049626358	0.001936936109	-0.0746120629189	0.0926705135782	-0.0002357020273	0.200613208106	-0.0751347911332	0.0467941427214	0.283298387025	-0.0225433865866	0.201929113222	16.963	20.224	-32.128
16	0.354118688092	-0.204695450862	-0.247732584812	0.339891609667	0.0841269576539	0.188117300406	0.0117928434036	0.114473446058	-0.159077714143	-0.128080580944	-0.0651634818326	-0.0233525368764	0.161647108803	-0.018048563577	6.61337603633E-5	0.273161363693	-0.0354164028685	0.0370830847914	0.284758007653	-0.0486513222054	0.221884941652	14.816	12.461	-31.706
17	0.145577442983	0.0639216220593	0.00403523064796	0.028028300407	0.00166223636976	0.00139472315359	0.0534325634552	0.0142596898711	0.0651392826326	-0.0276302866142	0.0369240689367	0.0433029271935	-0.0387155145433	-0.00259440932616	0.000116522377	0.74438000004	-0.00366991714817	0.0271965230851	0.495166752124	-0.0368572091278	0.427878322754	11.484	24.271	-25.763

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN A AND RESID 61:83 )	A	61 - 83
2	X-RAY DIFFRACTION	2	( CHAIN A AND RESID 84:99 )	A	84 - 99
3	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN A AND RESID 100:176 )	A	100 - 176
4	X-RAY DIFFRACTION	4	( CHAIN A AND RESID 177:188 )	A	177 - 188
5	X-RAY DIFFRACTION	5	( CHAIN A AND RESID 189:243 )	A	189 - 243
6	X-RAY DIFFRACTION	6	( CHAIN A AND RESID 244:263 )	A	244 - 263
7	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN A AND RESID 264:302 )	A	264 - 302
8	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN A AND RESID 303:322 )	A	303 - 322
9	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN B AND RESID 401:403 )	B	401 - 403
10	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN C AND RESID 61:83 )	C	61 - 83
11	X-RAY DIFFRACTION	11	( CHAIN C AND RESID 84:99 )	C	84 - 99
12	X-RAY DIFFRACTION	12	( CHAIN C AND RESID 100:176 )	C	100 - 176
13	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN C AND RESID 177:188 )	C	177 - 188
14	X-RAY DIFFRACTION	14	( CHAIN C AND RESID 189:223 )	C	189 - 223
15	X-RAY DIFFRACTION	15	( CHAIN C AND RESID 224:263 )	C	224 - 263
16	X-RAY DIFFRACTION	16	( CHAIN C AND RESID 264:322 )	C	264 - 322
17	X-RAY DIFFRACTION	17	( CHAIN D AND RESID 401:403 )	D	401 - 403

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 / タンパク質・ペプチド , 2種, 4分子 ACBD

-
非ポリマー , 5種, 699分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-タンパク質 / タンパク質・ペプチド , 2種, 4分子 ACBD

-非ポリマー , 5種, 699分子

-詳細

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 / タンパク質・ペプチド , 2種, 4分子 ACBD

-
非ポリマー , 5種, 699分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)