PDB-8bqs: Cryo-EM structure of the I-II-III2-IV2 respiratory supercomplex f...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB / ID: 8bqs
• タイトル: Cryo-EM structure of the I-II-III2-IV2 respiratory supercomplex from Tetrahymena thermophila

要素

• (Acyl carrier ...) x 2
• (Cytochrome c oxidase subunit ...) x 3
• (Gamma-carbonic ...) x 2
• (NADH dehydrogenase [ubiquinone] ...) x 8
• (NADH dehydrogenase subunit ...) x 6
• (NADH-ubiquinone oxidoreductase ...) x 7
• (SURF1-like protein) x 2
• (Transmembrane ...) x 34
• (Transposase) x 2
• (Zf-Tim10_DDP domain-containing ...) x 2
• 2 iron, 2 sulfur cluster-binding protein
• 2-oxoglutarate/malate carrier protein
• 37S ribosomal protein S25, mitochondrial
• 39S ribosomal protein L9, mitochondrial
• ABC transporter
• ATP synthase subunit e, mitochondrial
• Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II
• Annexin
• Apocytochrome b
• CHCH domain-containing protein
• COX assembly mitochondrial protein
• COXTT10
• COXTT12,Transmembrane protein,Transmembrane protein,Transmembrane protein
• COXTT22
• COXTT27
• COXTT28
• COXTT9
• CTF/NF-I domain-containing protein
• CX9C domain-containing protein
• Carrier protein
• Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,chain 150
• Complex I-MNLL
• Complex III subunit VII
• Cullin domain-containing protein
• Cytochrome protein c1
• DUF4885 domain-containing protein
• Decapping nuclease
• Diphthamide synthesis protein
• DnaJ domain protein
• ETC complex I subunit motif protein
• GRAM domain protein
• Iron-binding zinc finger CDGSH type protein
• Lipid-A-disaccharide synthase
• Lysozyme
• M16 family peptidase, putative
• Mobilization protein
• NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein
• NADH dehydrogenase, putative
• ND5a
• NDUA13
• NDUB10
• NDUB4
• NDUB6
• NDUB8
• NDUPH2
• NDUTT10
• NDUTT11
• NDUTT12
• NmrA domain-containing protein
• Oxoglutarate/malate translocator protein, putative
• PH domain-containing protein
• Peptidase M16 inactive domain protein
• Phage protein
• Protein phosphatase 2C, putative
• RNase III domain-containing protein
• Ribosomal protein L51/S25/CI-B8 domain protein
• Rieske iron-sulfur protein, ubiquinol-cytochrome C reductase iron-sulfur subunit
• SDHTT11
• Structural protein
• Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial
• Thioredoxin
• Tim10/DDP family zinc finger protein
• TraB family protein
• Transcription factor apfi protein, putative
• UQCRTT1
• UQCRTT2
• UQCRTT3
• Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein
• YflT domain-containing protein
• Ymf57
• Ymf58
• Ymf62
• Ymf65
• Ymf67
• Ymf68
• Ymf70
• Ymf75
• Zinc-finger protein
• chain 77
• succinate dehydrogenase
• succinate dehydrogenase complex iron-sulfur subunit D

• キーワード: ELECTRON TRANSPORT / Ciliate / Mitochondrial / Supercomplex

機能・相同性

分子機能:

lipid-A-disaccharide synthase / lipid-A-disaccharide synthase activity / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / : / quinol-cytochrome-c reductase / : / mitochondrial electron transport, succinate to ubiquinone / P450-containing electron transport chain / succinate dehydrogenase (quinone) activity / succinate dehydrogenase / NADH dehydrogenase complex / respiratory chain complex IV / mitochondrial envelope / cytochrome-c oxidase / oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / 3 iron, 4 sulfur cluster binding / cytochrome-c oxidase activity / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / lipid A biosynthetic process / ligase activity / acyl binding / acyl carrier activity / electron transport coupled proton transport / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / NADH dehydrogenase activity / respiratory chain complex I / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / quinone binding / ATP synthesis coupled electron transport / : / tricarboxylic acid cycle / protein folding chaperone / aerobic respiration / respiratory electron transport chain / electron transport chain / mitochondrial membrane / phospholipid binding / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / NAD binding / metallopeptidase activity / unfolded protein binding / protein transport / FMN binding / flavin adenine dinucleotide binding / protein-folding chaperone binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / response to oxidative stress / electron transfer activity / mitochondrial inner membrane / oxidoreductase activity / ribosome / copper ion binding / DNA-binding transcription factor activity / heme binding / protein-containing complex binding / mitochondrion / zinc ion binding / metal ion binding / nucleus / membrane / plasma membrane / cytoplasm

ドメイン・相同性:

Surfeit locus 1/Shy1 / Surfeit locus 1/4 / TraB/PryY-like / SURF1 family / SURF1 family profile. / CTF transcription factor/nuclear factor 1, DNA-binding domain / CTF/NF-I DNA-binding domain profile. / Glycosyl transferase, family 19 / Lipid-A-disaccharide synthetase / : / : / Tim10-like / Tim10-like domain superfamily / Tim10/DDP family zinc finger / : / : / Mitochondrial substrate/solute carrier / Iron-binding zinc finger, CDGSH type / Mitochondrial carrier domain superfamily / MitoNEET, CDGSH iron-sulfur domain / Mitochondrial carrier protein / Solute carrier (Solcar) repeat profile. / CDGSH-type zinc finger. Function unknown. / : / Dynactin subunit 5 / : / : / Succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 21kDa subunit, N-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase complex I, 21 kDa subunit / Regulator of chromosome condensation (RCC1) repeat / Regulator of chromosome condensation, RCC1 / Regulator of chromosome condensation (RCC1) repeat profile. / : / Adrenodoxin / Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit / : / Fumarate reductase/succinate dehydrogenase, FAD-binding site / Fumarate reductase / succinate dehydrogenase FAD-binding site. / FAD-dependent oxidoreductase SdhA/FrdA/AprA / 4Fe-4S dicluster domain / Succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulphur protein / Succinate dehydogenase/fumarate reductase N-terminal / 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain / Regulator of chromosome condensation 1/beta-lactamase-inhibitor protein II / Fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like, C-terminal / Fumarate reductase flavoprotein C-term / Fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like, C-terminal domain superfamily / Succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein, catalytic domain superfamily / FAD-dependent oxidoreductase 2, FAD binding domain / Cytochrome c oxidase subunit Vb, zinc binding region signature. / FAD binding domain / Alpha-helical ferredoxin / Cytochrome c oxidase, subunit Vb / Cytochrome c oxidase subunit Vb / Cytochrome c oxidase subunit Vb, zinc binding domain profile. / Cytochrome c oxidase, subunit Vb superfamily / DnaJ domain / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein / Cytochrome c/quinol oxidase subunit II / : / 2Fe-2S ferredoxin, iron-sulphur binding site / 2Fe-2S ferredoxin-type iron-sulfur binding region signature. / DnaJ molecular chaperone homology domain / Hexapeptide repeat / dnaJ domain profile. / Cytochrome c1 / Cytochrome C1 family / Cytochrome c oxidase, subunit I, copper-binding site / Heme-copper oxidase catalytic subunit, copper B binding region signature. / Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain / Chaperone J-domain superfamily / Cytochrome oxidase subunit I profile. / DnaJ domain / Cytochrome c oxidase subunit I / Cytochrome c oxidase-like, subunit I superfamily / Cytochrome C and Quinol oxidase polypeptide I / Cytochrome C oxidase subunit II, periplasmic domain / Cytochrome b/b6, C-terminal domain superfamily / Cytochrome b/b6/petB / Cytochrome c oxidase subunit II-like C-terminal / Cytochrome oxidase subunit II copper A binding domain profile. / Rieske iron-sulphur protein, C-terminal / Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) / 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain / Cytochrome b/b6, N-terminal / Cytochrome b/b6-like domain superfamily / Cytochrome b/b6 N-terminal region profile. / Di-haem cytochrome, transmembrane / Rieske iron-sulphur protein / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase NDSU1/NuoG-like, 4Fe-4S domain / Zinc finger, CHCC-type / Zinc-finger domain / Peptidase M16, C-terminal / Peptidase M16 inactive domain / Peptidase M16, N-terminal / Insulinase (Peptidase family M16)

構成要素:

1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / Chem-8Q1 / ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / CARDIOLIPIN / COPPER (II) ION / DINUCLEAR COPPER ION / FE3-S4 CLUSTER / FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / FLAVIN MONONUCLEOTIDE / HEME-A / HEME C / PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / : / Chem-LPP / Chem-NDP / 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / IRON/SULFUR CLUSTER / URIDINE-5'-DIPHOSPHATE / Ubiquinone-8 / Transmembrane protein, putative / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / Oxoglutarate/malate translocator protein, putative / NADH-ubiquinone oxidoreductase complex I, 21 kDa subunit / Transmembrane protein, putative / Transmembrane protein / SURF1-like protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Diphthamide synthesis protein / Transmembrane protein / Transmembrane protein, putative / Uncharacterized protein / SURF1-like protein / Transmembrane protein / NADH dehydrogenase, putative / Transmembrane protein / succinate dehydrogenase / Transmembrane protein, putative / Gamma-carbonic anhydrase / Transmembrane protein / Iron-binding zinc finger CDGSH type protein / Transcription factor apfi protein, putative / Uncharacterized protein / Transmembrane protein, putative / Uncharacterized protein / Ribosomal protein L51/S25/CI-B8 domain protein / Transmembrane protein / Acyl carrier protein / Transmembrane protein / NADH-ubiquinone oxidoreductase 1, chain, putative / NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit / Uncharacterized protein / Transmembrane protein, putative / Transmembrane protein / Transmembrane protein / Transmembrane protein, putative / Peptidase M16 inactive domain protein / Transmembrane protein, putative / Rieske iron-sulfur protein, ubiquinol-cytochrome C reductase iron-sulfur subunit / Transmembrane protein / Uncharacterized protein / Transmembrane protein, putative / Uncharacterized protein / M16 family peptidase, putative / Zinc-finger protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / Transmembrane protein / NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein / Transmembrane protein, putative / Transmembrane protein / NADH dehydrogenase subunit 1 / Uncharacterized protein / Thioredoxin / CTF/NF-I domain-containing protein / Transmembrane protein, putative / Transmembrane protein, putative / DnaJ domain protein / lipid-A-disaccharide synthase / Transmembrane protein / Protein phosphatase 2C, putative / Transmembrane protein, putative / Transmembrane protein, putative / Uncharacterized protein / Transmembrane protein, putative / Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein / Transmembrane protein / Transmembrane protein, putative / 2 iron, 2 sulfur cluster-binding protein / Transmembrane protein, putative / Transmembrane protein / Acyl carrier protein / Gamma-carbonic anhydrase / Uncharacterized protein / Transmembrane protein, putative / Carrier protein / Uncharacterized protein / Tim10/DDP family zinc finger protein / Transmembrane protein

• 生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
• 手法: 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.9 Å
• データ登録者: Muhleip, A. / Kock Flygaard, R. / Baradaran, R. / Amunts, A.

資金援助

スウェーデン, European Union, 4件

組織	認可番号	国
The Swedish Foundation for Strategic Research	FFL15:0325	スウェーデン
Cancerfonden	2017/1041	スウェーデン
European Research Council (ERC)	ERC-2018-StG-805230	European Union
Knut and Alice Wallenberg Foundation	2018.0080	スウェーデン

• 引用: ジャーナル: Nature / 年: 2023; タイトル: Structural basis of mitochondrial membrane bending by the I-II-III-IV supercomplex.; 著者: Alexander Mühleip / Rasmus Kock Flygaard / Rozbeh Baradaran / Outi Haapanen / Thomas Gruhl / Victor Tobiasson / Amandine Maréchal / Vivek Sharma / Alexey Amunts / ; 要旨: Mitochondrial energy conversion requires an intricate architecture of the inner mitochondrial membrane. Here we show that a supercomplex containing all four respiratory chain components contributes to membrane curvature induction in ciliates. We report cryo-electron microscopy and cryo-tomography structures of the supercomplex that comprises 150 different proteins and 311 bound lipids, forming a stable 5.8-MDa assembly. Owing to subunit acquisition and extension, complex I associates with a complex IV dimer, generating a wedge-shaped gap that serves as a binding site for complex II. Together with a tilted complex III dimer association, it results in a curved membrane region. Using molecular dynamics simulations, we demonstrate that the divergent supercomplex actively contributes to the membrane curvature induction and tubulation of cristae. Our findings highlight how the evolution of protein subunits of respiratory complexes has led to the I-II-III-IV supercomplex that contributes to the shaping of the bioenergetic membrane, thereby enabling its functional specialization.

履歴

登録	2022年11月21日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2023年8月23日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 2.0	2025年2月19日	Group: Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Non-polymer description / Polymer sequence / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / citation / citation_author / em_admin / entity / entity_poly / entity_poly_seq / entity_src_nat / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / pdbx_poly_seq_scheme / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_mod_residue / pdbx_struct_sheet_hbond / pdbx_unobs_or_zero_occ_residues / pdbx_validate_chiral / pdbx_validate_close_contact / pdbx_validate_torsion / struct_conf / struct_conn / struct_ref / struct_ref_seq / struct_ref_seq_dif / struct_sheet_range Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.group_PDB / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_seq_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _chem_comp.type / _citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name / _em_admin.last_update / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can / _entity_src_nat.pdbx_end_seq_num / _pdbx_entry_details.has_protein_modification / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id / _struct_ref.db_code / _struct_ref.db_name / _struct_ref.pdbx_db_accession / _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code / _struct_ref_seq.pdbx_db_accession / _struct_ref_seq.seq_align_beg / _struct_ref_seq.seq_align_end / _struct_sheet_range.beg_label_seq_id / _struct_sheet_range.end_label_seq_id

集合体

登録構造単位

A0: Lipid-A-disaccharide synthase

A1: NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein

A2: DnaJ domain protein

A3: Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II

A4: RNase III domain-containing protein

A5: 37S ribosomal protein S25, mitochondrial

A6: Transmembrane protein, putative

A7: CX9C domain-containing protein

A8: ND5a

A9: Transmembrane protein, putative

AA: NADH dehydrogenase subunit 5

AB: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit

AC: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

AD: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

AE: NADH dehydrogenase subunit 7

AF: Ymf65

AG: Transcription factor apfi protein, putative

AH: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

AI: NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit

AJ: Ymf62

AK: Gamma-carbonic anhydrase

AL: NADH-ubiquinone oxidoreductase 1, chain, putative

AM: Gamma-carbonic anhydrase

AN: ETC complex I subunit motif protein

AO: NADH dehydrogenase subunit 9

AP: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

AQ: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial

AR: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

AS: NADH dehydrogenase, putative

AT: NADH dehydrogenase subunit 10

AU: NADH-ubiquinone oxidoreductase complex I, 21 kDa subunit

AV: Acyl carrier protein

AW: Acyl carrier protein

AX: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

AY: Ymf58

AZ: Ribosomal protein L51/S25/CI-B8 domain protein

B0: Transmembrane protein, putative

B1: ATP synthase subunit e, mitochondrial

B2: GRAM domain protein

B3: Transmembrane protein, putative

B4: Transmembrane protein, putative

B5: Transmembrane protein, putative

B6: NADH dehydrogenase subunit 1

BA: Transmembrane protein

BB: Transmembrane protein, putative

BC: NDUB8

BD: Transmembrane protein, putative

BE: NDUPH2

BF: NDUB10

BG: NDUA13

BH: NADH dehydrogenase subunit 2

BI: 2 iron, 2 sulfur cluster-binding protein

BJ: Thioredoxin

BK: COX assembly mitochondrial protein

BL: Transmembrane protein, putative

BM: Transmembrane protein, putative

BN: PH domain-containing protein

BO: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8

BP: NDUB6

BQ: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4

BR: Zinc-finger protein

BS: NDUB4

BT: NDUTT10

BU: NDUTT11

BV: NDUTT12

BW: CHCH domain-containing protein

BX: Transmembrane protein, putative

BY: Ymf57

BZ: Complex I-MNLL

CH: Diphthamide synthesis protein

CM: Transmembrane protein, putative

CL: Transposase

CA: Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial

CI: DUF4885 domain-containing protein

CB: succinate dehydrogenase

CF: Transmembrane protein, putative

CG: chain 77

CK: Transmembrane protein, putative

CE: NmrA domain-containing protein

CJ: Transmembrane protein, putative

CN: Transmembrane protein, putative

CC: Transmembrane protein

CO: SDHTT11

CD: succinate dehydrogenase complex iron-sulfur subunit D

A: Peptidase M16 inactive domain protein

B: M16 family peptidase, putative

C: Apocytochrome b

D: Cytochrome protein c1

E: Rieske iron-sulfur protein, ubiquinol-cytochrome C reductase iron-sulfur subunit

F: Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein

G: UQCRTT1

H: Transmembrane protein, putative

I: Transmembrane protein, putative

J: UQCRTT3

K: Transmembrane protein, putative

L: UQCRTT2

a: Peptidase M16 inactive domain protein

b: M16 family peptidase, putative

c: Apocytochrome b

d: Cytochrome protein c1

e: Rieske iron-sulfur protein, ubiquinol-cytochrome C reductase iron-sulfur subunit

f: Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein

g: UQCRTT1

h: Transmembrane protein, putative

i: Transmembrane protein, putative

k: Transmembrane protein, putative

l: UQCRTT2

j: UQCRTT3

DA: Cytochrome c oxidase subunit 1

DB: Cytochrome c oxidase subunit 2

DC: Ymf68

DD: Cytochrome C oxidase subunit Vb protein

DE: Transmembrane protein, putative

DF: Structural protein

DG: Transmembrane protein, putative

DH: Transmembrane protein, putative

DI: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial

DJ: Transmembrane protein, putative

DK: CTF/NF-I domain-containing protein

DM: Transmembrane protein, putative

DN: Ymf67

DO: Protein phosphatase 2C, putative

DP: SURF1-like protein

DQ: TraB family protein

DR: Transmembrane protein, putative

DS: Oxoglutarate/malate translocator protein, putative

DT: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mitochondrial

DU: Carrier protein

DV: 2-oxoglutarate/malate carrier protein

DW: SURF1-like protein

DX: COXTT9

DY: COXTT10

DZ: 39S ribosomal protein L9, mitochondrial

EA: COXTT12,Transmembrane protein,Transmembrane protein,Transmembrane protein

EB: Transmembrane protein, putative

EC: COXTT27

ED: Ymf75

EE: Mobilization protein

EF: Iron-binding zinc finger CDGSH type protein

EG: COXTT28

EH: Transmembrane protein, putative

EI: Transmembrane protein

EV: Decapping nuclease

EK: Complex III subunit VII

EL: Transmembrane protein, putative

EM: Transmembrane protein, putative

EN: COXTT22

EO: Transmembrane protein, putative

EP: Phage protein

EQ: Transmembrane protein, putative

ER: Lysozyme

ES: Ymf70

ET: Zf-Tim10_DDP domain-containing protein

EU: ABC transporter

EJ: YflT domain-containing protein

EW: Cullin domain-containing protein

EX: Zf-Tim10_DDP domain-containing protein

EY: Annexin

EZ: Transposase

FA: Tim10/DDP family zinc finger protein

Da: Cytochrome c oxidase subunit 1

Db: Cytochrome c oxidase subunit 2

Dc: Ymf68

Dd: Cytochrome C oxidase subunit Vb protein

De: Transmembrane protein, putative

Df: Structural protein

Dg: Transmembrane protein, putative

Dh: Transmembrane protein, putative

Di: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial

Dj: Transmembrane protein, putative

Dk: CTF/NF-I domain-containing protein

Dm: Transmembrane protein, putative

Dn: Ymf67

Do: Protein phosphatase 2C, putative

Dp: SURF1-like protein

Dq: TraB family protein

Dr: Transmembrane protein, putative

Ds: Oxoglutarate/malate translocator protein, putative

Dt: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mitochondrial

Du: Carrier protein

Dv: 2-oxoglutarate/malate carrier protein

Dw: SURF1-like protein

Dx: COXTT9

Dy: COXTT10

Dz: 39S ribosomal protein L9, mitochondrial

Ea: COXTT12,Transmembrane protein,Transmembrane protein,Transmembrane protein

Eb: Transmembrane protein, putative

Ec: COXTT27

Ed: Ymf75

Ee: Mobilization protein

Ef: Iron-binding zinc finger CDGSH type protein

Eg: COXTT28

Eh: Transmembrane protein, putative

Ei: Transmembrane protein

Ev: Decapping nuclease

Ek: Complex III subunit VII

El: Transmembrane protein, putative

Em: Transmembrane protein, putative

En: COXTT22

Eo: Transmembrane protein, putative

Ep: Phage protein

Eq: Transmembrane protein, putative

Er: Lysozyme

Es: Ymf70

Et: Zf-Tim10_DDP domain-containing protein

Eu: ABC transporter

Ej: YflT domain-containing protein

Ew: Cullin domain-containing protein

Ex: Zf-Tim10_DDP domain-containing protein

Ey: Annexin

Ez: Transposase

Fa: Tim10/DDP family zinc finger protein

Dl: Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,chain 150

DL: Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,chain 150

ヘテロ分子

概要:

• 6.25 MDa, 214 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	6,250,466	598
ポリマ－	5,867,316	214
非ポリマー	383,150	384
水	0	0

1

概要:

• 登録構造と同一
• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555		1

要素

タンパク質 , 82種, 123分子 A0 A1 A2 A3 A4 A5 A7 A8 AF AG AJ AN AS AY AZ B1 B2 BC BE BF BG BI BJ BK BN BP BR BS BT BU ...

#1: タンパク質

A0 Lipid-A-disaccharide synthase

詳細:

分子量: 59307.289 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22E24, lipid-A-disaccharide synthase

#2: タンパク質

A1 NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein

詳細:

分子量: 41375.090 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MLH2

#3: タンパク質

A2 DnaJ domain protein

詳細:

分子量: 36878.367 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22DR7

#4: タンパク質

A3 Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II

詳細:

分子量: 36709.441 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q24HK5

#5: タンパク質

A4 RNase III domain-containing protein

詳細:

分子量: 35409.246 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7LUQ4

#6: タンパク質

A5 37S ribosomal protein S25, mitochondrial

詳細:

分子量: 33201.797 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MIJ7

#8: タンパク質

A7 CX9C domain-containing protein

詳細:

分子量: 28412.805 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MMF4

#9: タンパク質

A8 ND5a

詳細:

分子量: 25493.336 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210

#16: タンパク質

AF Ymf65

詳細:

分子量: 43146.160 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q951A3

#17: タンパク質

AG Transcription factor apfi protein, putative

詳細:

分子量: 39793.414 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M8Q7

#20: タンパク質

AJ Ymf62

詳細:

分子量: 30448.471 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q950Y2

#24: タンパク質

AN ETC complex I subunit motif protein

詳細:

分子量: 24277.859 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23ND5

#29: タンパク質

AS NADH dehydrogenase, putative

詳細:

分子量: 20167.854 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M2Y3

#35: タンパク質

AY Ymf58

詳細:

分子量: 13509.949 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q950Z5

#36: タンパク質

AZ Ribosomal protein L51/S25/CI-B8 domain protein

詳細:

分子量: 12157.782 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MA77

#38: タンパク質

B1 ATP synthase subunit e, mitochondrial

詳細:

分子量: 11283.534 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22E95

#39: タンパク質

B2 GRAM domain protein

詳細:

分子量: 10920.431 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: W7X4R4

#46: タンパク質

BC NDUB8

詳細:

分子量: 24150.469 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M855

#48: タンパク質

BE NDUPH2

詳細:

分子量: 22446.637 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23KE0

#49: タンパク質

BF NDUB10

詳細:

分子量: 22167.137 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23KG0

#50: タンパク質

BG NDUA13

詳細:

分子量: 21045.617 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M2U4

#52: タンパク質

BI 2 iron, 2 sulfur cluster-binding protein

詳細:

分子量: 19564.221 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22W11

#53: タンパク質

BJ Thioredoxin

詳細:

分子量: 19540.191 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22AI5

#54: タンパク質

BK COX assembly mitochondrial protein

詳細:

分子量: 17078.342 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M1N8

#57: タンパク質

BN PH domain-containing protein

詳細:

分子量: 15785.234 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22SC4

#59: タンパク質

BP NDUB6

詳細:

分子量: 15444.344 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q231G0

#61: タンパク質

BR Zinc-finger protein

詳細:

分子量: 15141.296 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MK02

#62: タンパク質

BS NDUB4

詳細:

分子量: 14410.395 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MG29

#63: タンパク質

BT NDUTT10

詳細:

分子量: 14963.529 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210

#64: タンパク質

BU NDUTT11

詳細:

分子量: 15334.371 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210

#65: タンパク質

BV NDUTT12

詳細:

分子量: 13983.049 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210

#66: タンパク質

BW CHCH domain-containing protein

詳細:

分子量: 13747.362 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MIM0

#68: タンパク質

BY Ymf57

詳細:

分子量: 12473.938 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q951C2

#69: タンパク質

BZ Complex I-MNLL

詳細:

分子量: 12103.036 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22W63

#70: タンパク質

CH Diphthamide synthesis protein

詳細:

分子量: 22894.336 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7LX66

#72: タンパク質

CL Transposase

詳細:

分子量: 11027.419 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: W7XBF5

#73: タンパク質

CA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial

詳細:

分子量: 70082.758 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23DI3, succinate dehydrogenase

#74: タンパク質

CI DUF4885 domain-containing protein

詳細:

分子量: 12979.428 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22YL0

#75: タンパク質

CB succinate dehydrogenase

詳細:

分子量: 36002.402 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M403

#77: タンパク質

CG chain 77

詳細:

分子量: 23627.730 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MEX7

#79: タンパク質

CE NmrA domain-containing protein

詳細:

分子量: 36376.008 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q24I09

#85: タンパク質

A a Peptidase M16 inactive domain protein

詳細:

分子量: 58023.914 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MGU2

#86: タンパク質

B b M16 family peptidase, putative

詳細:

分子量: 53030.543 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MJ25

#87: タンパク質

C c Apocytochrome b

詳細:

分子量: 50635.547 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q950Z1

#88: タンパク質

D d Cytochrome protein c1

詳細:

分子量: 37616.629 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q24IM5

#89: タンパク質

E e Rieske iron-sulfur protein, ubiquinol-cytochrome C reductase iron-sulfur subunit

詳細:

分子量: 30696.961 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MIC7

#90: タンパク質

F f Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein

詳細:

分子量: 9885.511 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23K66

#91: タンパク質

G g UQCRTT1

詳細:

分子量: 39193.523 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23F81

#94: タンパク質

J j UQCRTT3

詳細:

分子量: 5634.938 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210

#99: タンパク質

DC Dc Ymf68

詳細:

分子量: 72782.539 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q950Y6

#102: タンパク質

DF Df Structural protein

詳細:

分子量: 27946.445 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q24I72

#107: タンパク質

DK Dk CTF/NF-I domain-containing protein

詳細:

分子量: 116812.750 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22CI1

#109: タンパク質

DN Dn Ymf67

詳細:

分子量: 54538.531 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q950Y7

#110: タンパク質

DO Do Protein phosphatase 2C, putative

詳細:

分子量: 53011.297 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22FX8

#111: タンパク質

DP Dp SURF1-like protein

詳細:

分子量: 47087.973 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M1Q4

#112: タンパク質

DQ Dq TraB family protein

詳細:

分子量: 45048.949 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23DP7

#114: タンパク質

DS Ds Oxoglutarate/malate translocator protein, putative

詳細:

分子量: 40418.273 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: A4VDV3

#116: タンパク質

DU Du Carrier protein

詳細:

分子量: 37095.141 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22ZA6

#117: タンパク質

DV Dv 2-oxoglutarate/malate carrier protein

詳細:

分子量: 36116.316 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23M99

#118: タンパク質

DW Dw SURF1-like protein

詳細:

分子量: 35794.367 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7LTZ4

#119: タンパク質

DX Dx COXTT9

詳細:

分子量: 29865.686 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7LY65

#120: タンパク質

DY Dy COXTT10

詳細:

分子量: 28101.486 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MD70

#121: タンパク質

DZ Dz 39S ribosomal protein L9, mitochondrial

詳細:

分子量: 27034.711 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: W7X4J9

#122: タンパク質

EA Ea COXTT12,Transmembrane protein,Transmembrane protein,Transmembrane protein

詳細:

分子量: 25953.754 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M3P9

#124: タンパク質

EC Ec COXTT27

詳細:

分子量: 23368.416 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210

#125: タンパク質

ED Ed Ymf75

詳細:

分子量: 23325.801 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q951A7

#126: タンパク質

EE Ee Mobilization protein

詳細:

分子量: 23257.660 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23F08

#127: タンパク質

EF Ef Iron-binding zinc finger CDGSH type protein

詳細:

分子量: 21476.887 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M8P0

#128: タンパク質

EG Eg COXTT28

詳細:

分子量: 11121.555 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210

#131: タンパク質

EV Ev Decapping nuclease

詳細:

分子量: 10226.719 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7LVX0

#132: タンパク質

EK Ek Complex III subunit VII

詳細:

分子量: 19882.758 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q230X6

#135: タンパク質

EN En COXTT22

詳細:

分子量: 17701.115 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MFV5

#137: タンパク質

EP Ep Phage protein

詳細:

分子量: 14740.897 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q24C97

#139: タンパク質

ER Er Lysozyme

詳細:

分子量: 12273.913 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M9E7

#140: タンパク質

ES Es Ymf70

詳細:

分子量: 10891.920 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q950Y0

#142: タンパク質

EU Eu ABC transporter

詳細:

分子量: 10418.697 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7LTF1

#143: タンパク質

EJ Ej YflT domain-containing protein

詳細:

分子量: 19979.320 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M8Y9

#144: タンパク質

EW Ew Cullin domain-containing protein

詳細:

分子量: 8965.917 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22N23

#146: タンパク質

EY Ey Annexin

詳細:

分子量: 8155.360 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q233U0

#147: タンパク質

EZ Ez Transposase

詳細:

分子量: 8081.111 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22A35

#148: タンパク質

FA Fa Tim10/DDP family zinc finger protein

詳細:

分子量: 8008.990 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: W7X3D6

#149: タンパク質

Dl DL Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,chain 150

詳細:

分子量: 50912.336 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22RF2

Transmembrane ... , 34種, 50分子 A6 A9 B0 B3 B4 B5 BA BB BD BL BM BX CM CF CK CJ CN CC H h I i K k DE De DG Dg DH Dh ...

#7: タンパク質

A6 Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 29389.660 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q24C39

#10: タンパク質

A9 Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 26545.146 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q24F24

#37: タンパク質

B0 Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 11451.183 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MI60

#40: タンパク質

B3 Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 9942.366 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: A4VD20

#41: タンパク質

B4 Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 8787.116 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22DC2

#42: タンパク質

B5 Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 8445.937 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MIK1

#44: タンパク質

BA Transmembrane protein

詳細:

分子量: 24823.297 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MIE0

#45: タンパク質

BB Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 24419.150 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22Z32

#47: タンパク質

BD Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 23971.033 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7LT77

#55: タンパク質

BL Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 16909.242 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22HE4

#56: タンパク質

BM Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 15831.701 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M9B3

#67: タンパク質

BX Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 13340.979 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22T55

#71: タンパク質

CM Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 9168.366 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22HD6

#76: タンパク質

CF Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 35124.293 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q248F8

#78: タンパク質

CK Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 11188.824 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q24CW6

#80: タンパク質

CJ Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 11957.518 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23S01

#81: タンパク質

CN Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 7244.434 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: W7XF00

#82: タンパク質

CC Transmembrane protein

詳細:

分子量: 7036.020 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23RH8

#92: タンパク質

H h Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 15677.771 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M484

#93: タンパク質

I i Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 14262.554 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MM45

#95: タンパク質

K k Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 7455.741 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MFL6

#101: タンパク質

DE De Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 15618.258 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: W7XCY5

#103: タンパク質

DG Dg Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 12786.321 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23DS4

#104: タンパク質

DH Dh Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 16411.672 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MGF9

#106: タンパク質

DJ Dj Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 26601.174 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: W7WZP1

#108: タンパク質

DM Dm Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 57814.465 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22PJ5

#113: タンパク質

DR Dr Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 41307.387 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23DG8

#123: タンパク質

EB Eb Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 24701.131 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7LZX8

#129: タンパク質

EH Eh Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 20372.266 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23D87

#130: タンパク質

EI Ei Transmembrane protein

詳細:

分子量: 20025.109 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MKT6

#133: タンパク質

EL El Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 18801.604 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23VY4

#134: タンパク質

EM Em Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 18600.445 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22DP8

#136: タンパク質

EO Eo Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 15588.598 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23TE5

#138: タンパク質

EQ Eq Transmembrane protein, putative

詳細:

分子量: 14328.524 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22W32

NADH dehydrogenase subunit ... , 6種, 6分子 AA AE AO AT B6 BH

#11: タンパク質

AA NADH dehydrogenase subunit 5

詳細:

分子量: 88179.844 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210
参照: UniProt: Q950Z0, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)

#15: タンパク質

AE NADH dehydrogenase subunit 7

詳細:

分子量: 51227.477 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210
参照: UniProt: Q951B1, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)

#25: タンパク質

AO NADH dehydrogenase subunit 9

詳細:

分子量: 23830.291 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210
参照: UniProt: Q950Z3, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)

#30: タンパク質

AT NADH dehydrogenase subunit 10

詳細:

分子量: 18324.260 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210
参照: UniProt: Q951B4, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)

#43: タンパク質

B6 NADH dehydrogenase subunit 1

詳細:

分子量: 7238.754 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q09FB0

#51: タンパク質

BH NADH dehydrogenase subunit 2

詳細:

分子量: 20899.889 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210
参照: UniProt: Q951B2, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)

NADH-ubiquinone oxidoreductase ... , 7種, 7分子 AB AC AH AI AL AU AX

#12: タンパク質

AB NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit

詳細:

分子量: 80580.789 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23KA9

#13: タンパク質

AC NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

詳細:

分子量: 58690.043 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210
参照: UniProt: Q950X9, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)

#18: タンパク質

AH NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

詳細:

分子量: 32636.770 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210
参照: UniProt: Q950Y3, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)

#19: タンパク質

AI NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit

詳細:

分子量: 31216.697 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MEP0

#22: タンパク質

AL NADH-ubiquinone oxidoreductase 1, chain, putative

詳細:

分子量: 28053.535 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MDW5

#31: タンパク質

AU NADH-ubiquinone oxidoreductase complex I, 21 kDa subunit

詳細:

分子量: 17381.809 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7LT42

#34: タンパク質

AX NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

詳細:

分子量: 14416.898 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210
参照: UniProt: Q950Z7, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)

NADH dehydrogenase [ubiquinone] ... , 8種, 10分子 AD AP AQ AR BO BQ DI Di DT Dt

#14: タンパク質

AD NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

詳細:

分子量: 52313.699 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210
参照: UniProt: Q23KE4, NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)

#26: タンパク質

AP NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

詳細:

分子量: 22890.570 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: A4VDQ6

#27: タンパク質

AQ NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial

詳細:

分子量: 22698.301 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q233X7

#28: タンパク質

AR NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

詳細:

分子量: 21642.377 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MK61

#58: タンパク質

BO NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8

詳細:

分子量: 15689.792 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23B10

#60: タンパク質

BQ NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4

詳細:

分子量: 15193.583 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MAF0

#105: タンパク質

DI Di NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial

詳細:

分子量: 28666.662 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: W7X287

#115: タンパク質

DT Dt NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mitochondrial

詳細:

分子量: 37552.980 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23DZ5

Gamma-carbonic ... , 2種, 2分子 AK AM

#21: タンパク質

AK Gamma-carbonic anhydrase

詳細:

分子量: 28216.734 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22XU5

#23: タンパク質

AM Gamma-carbonic anhydrase

詳細:

分子量: 25395.969 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7M6S0

Acyl carrier ... , 2種, 2分子 AV AW

#32: タンパク質

AV Acyl carrier protein

詳細:

分子量: 16249.438 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q22XT6

#33: タンパク質

AW Acyl carrier protein

詳細:

分子量: 15428.433 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: I7MD12

タンパク質・ペプチド , 3種, 4分子 CO CD L l

#83: タンパク質・ペプチド

CO SDHTT11

詳細:

分子量: 5459.540 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
詳細: succinate dehydrogenase Tetrahymena thermophila subunit 11 GenBank: DY684362.1
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210

#84: タンパク質・ペプチド

CD succinate dehydrogenase complex iron-sulfur subunit D

詳細:

分子量: 5566.625 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210

#96: タンパク質・ペプチド

L l UQCRTT2

詳細:

分子量: 4850.612 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210

Cytochrome c oxidase subunit ... , 3種, 6分子 DA Da DB Db DD Dd

#97: タンパク質

DA Da Cytochrome c oxidase subunit 1

詳細:

分子量: 80578.977 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q950Y4

#98: タンパク質

DB Db Cytochrome c oxidase subunit 2

詳細:

分子量: 72388.883 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q950Y9

#100: タンパク質

DD Dd Cytochrome C oxidase subunit Vb protein

詳細:

分子量: 75431.312 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q23FF5

Zf-Tim10 DDP domain-containing ... , 2種, 4分子 ET Et EX Ex

#141: タンパク質

ET Et Zf-Tim10_DDP domain-containing protein

詳細:

分子量: 10435.701 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: Q231A8

#145: タンパク質

EX Ex Zf-Tim10_DDP domain-containing protein

詳細:

分子量: 8354.574 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
由来: (天然) Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
株: SB210 / 参照: UniProt: W7XDM6

非ポリマー , 24種, 384分子

#150: 化合物

A0-601 A0-602 A1-402 AA-901 AA-908 AC-801 AC-802 AF-401 AF-402 AM-301 AP-301 B0-101 B0-102 B1-402 BC-301 BC-302 BE-201 BG-201 BL-301 BT-202 ...
ChemComp-CDL / CARDIOLIPIN / DIPHOSPHATIDYL GLYCEROL / BIS-(1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHO)-1',3'-SN-GLYCEROL

詳細:

分子量: 1464.043 Da / 分子数: 162 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈₁H₁₅₆O₁₇P₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: リン脂質*YM

#151: 化合物

A0-603 ChemComp-UDP / URIDINE-5'-DIPHOSPHATE / UDP

詳細:

タイプ: RNA linking / 分子量: 404.161 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₉H₁₄N₂O₁₂P₂ / コメント: UDP*YM

#152: 化合物

A0-604 A8-402 DA-705 Da-705
ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン

詳細:

分子量: 24.305 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg

#153: 化合物

A0-605 A1-403 A2-402 A6-302 A6-303 A9-601 A9-603 AA-903 AA-904 AA-905 AA-906 AA-907 AC-804 AH-301 AJ-501 AL-303 AM-302 AQ-202 AU-201 AU-202 ...
ChemComp-PC1 / 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / 3-SN-PHOSPHATIDYLCHOLINE

詳細:

分子量: 790.145 Da / 分子数: 97 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄₄H₈₈NO₈P / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: リン脂質*YM

#154: 化合物

A1-401 ChemComp-NDP / NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / NADPH

詳細:

分子量: 745.421 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₁H₃₀N₇O₁₇P₃

#155: 化合物

A2-401 A9-602 AJ-502 BA-301 BP-201 BT-201 CK-101 CC-301 CD-303 C-513 G-401 DC-606 DC-607 DG-204 DG-205 DI-301 DJ-301 DN-501 DR-401 DS-402 ...
ChemComp-3PE / 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / 3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE / 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE / DSPE

詳細:

分子量: 748.065 Da / 分子数: 45 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄₁H₈₂NO₈P / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: リン脂質*YM

#156: 化合物

A6-301 AA-902 AC-803 AL-304 DA-710 DN-504 DN-505 EI-402 Dn-504 Dn-505 Ed-203 Dl-1101
ChemComp-LPP / 2-(HEXADECANOYLOXY)-1-[(PHOSPHONOOXY)METHYL]ETHYL HEXADECANOATE / 1,2-DIPALMITOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHATE / L-B,G-DIPALMITOYL-A-PHOSPHATIDIC ACID DISODIUM SALT / 3-SN-PHOSPHATIDIC ACID / 1,2-DIPALMITOYLDISODIUM SALT / ジパルミトイルホスファチジン酸

詳細:

分子量: 648.891 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃₅H₆₉O₈P / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: リン脂質*YM

#157: 化合物

A8-401 AQ-201 ChemComp-ADP / ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP

詳細:

分子量: 427.201 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₀P₂ / コメント: ADP, エネルギー貯蔵分子*YM

#158: 化合物

AB-801 AI-301 BI-201 CB-1000 E-302 e-1102 EF-201 EF-202 Ef-502 Ef-503
ChemComp-FES / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

詳細:

分子量: 175.820 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe₂S₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION

#159: 化合物

AB-802 AB-803 AD-501 AL-301 AL-302 AT-201 CB-1001
ChemComp-SF4 / IRON/SULFUR CLUSTER

詳細:

分子量: 351.640 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe₄S₄ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION

#160: 化合物

AD-502 ChemComp-FMN / FLAVIN MONONUCLEOTIDE / RIBOFLAVIN MONOPHOSPHATE / FMN

詳細:

分子量: 456.344 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₇H₂₁N₄O₉P / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION

#161: 化合物

AS-200 ChemComp-8Q1 / S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate / S-dodecanoyl-4'-phosphopantetheine

詳細:

分子量: 540.651 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₃H₄₅N₂O₈PS

#162: 化合物

BR-200 DD-702 Dd-701 ChemComp-ZN / ZINC ION

詳細:

分子量: 65.409 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn

#163: 化合物

CA-701 CB-1003 DA-701 Da-701
ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン

詳細:

分子量: 40.078 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca

#164: 化合物

CA-702 ChemComp-FAD / FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE / FAD

詳細:

分子量: 785.550 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₇H₃₃N₉O₁₅P₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: FAD*YM

#165: 化合物

CB-1002 ChemComp-F3S / FE3-S4 CLUSTER

詳細:

分子量: 295.795 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe₃S₄ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION

#166: 化合物

CE-401 D-401 d-802 ChemComp-HEC / HEME C

詳細:

分子量: 618.503 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃₄H₃₄FeN₄O₄ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION

#167: 化合物

CC-303 C-511 C-512 c-510 DS-403 ED-603 EL-905 EN-1205 Ds-404 Ed-202 El-906 En-1202
ChemComp-UQ8 / Ubiquinone-8 / 2,3-dimethoxy-5-methyl-6-[(6E,10E,14E,18E,22E,26E)-3,7,11,15,19,23,27,31-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26,30-oc taen-1-yl]cyclohexa-2,5-diene-1,4-dione / ユビキノン8

詳細:

分子量: 727.109 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄₉H₇₄O₄ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION

#168: 化合物

C-501 C-502 c-504 c-505 ED-602 Ed-201
ChemComp-HEM / PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / HEME

詳細:

分子量: 616.487 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃₄H₃₂FeN₄O₄ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION

#169: 化合物

DA-702 DA-703 Da-702 Da-703
ChemComp-HEA / HEME-A

詳細:

分子量: 852.837 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄₉H₅₆FeN₄O₆ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION

#170: 化合物

DA-704 Da-704 ChemComp-CU / COPPER (II) ION

詳細:

分子量: 63.546 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cu / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION

#171: 化合物

DB-701 Db-701 ChemComp-CUA / DINUCLEAR COPPER ION

詳細:

分子量: 127.092 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cu₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION

#172: 化合物

DD-701 ChemComp-K / POTASSIUM ION / カリウムカチオン

詳細:

分子量: 39.098 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: K

#173: 化合物

ER-201 Er-201 ChemComp-ATP / ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP

詳細:

分子量: 507.181 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₆N₅O₁₃P₃ / コメント: ATP, エネルギー貯蔵分子*YM

詳細

• 研究の焦点であるリガンドがあるか: Y
• Has protein modification: Y

実験情報

実験

• 実験: 手法: 電子顕微鏡法
• EM実験: 試料の集合状態: PARTICLE / ３次元再構成法: 単粒子再構成法

試料調製

• 構成要素: 名称: respiratory chain supercomplex from the ciliate Tetrahymena thermophila; タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1-#149 / 由来: NATURAL
• 分子量: 実験値: NO
• 由来(天然): 生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
• 緩衝液: pH: 7.4
• 試料: 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES
• 急速凍結: 凍結剤: ETHANE

電子顕微鏡撮影

• 実験機器: モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company
• 顕微鏡: モデル: FEI TITAN KRIOS
• 電子銃: 電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM
• 電子レンズ: モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2200 nm / 最小 デフォーカス（公称値）: 600 nm
• 撮影: 電子線照射量: 31 e/Ų / 検出モード: COUNTING; フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k)

解析

• EMソフトウェア: 名称: PHENIX / バージョン: 1.20.1_4487 / カテゴリ: モデル精密化
• CTF補正: タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
• 3次元再構成: 解像度: 2.9 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 138746 / 対称性のタイプ: POINT
• 精密化: 交差検証法: NONE

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
ELECTRON MICROSCOPY	f_bond_d	0.002	409457
ELECTRON MICROSCOPY	f_angle_d	0.535	549429
ELECTRON MICROSCOPY	f_dihedral_angle_d	12.965	158588
ELECTRON MICROSCOPY	f_chiral_restr	0.055	55792
ELECTRON MICROSCOPY	f_plane_restr	0.003	67826