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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8ar2 | ||||||
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タイトル | Solution structure of TLR5 transmembrane and cytoplasmic juxtamembrane regions | ||||||
要素 | Toll-like receptor 5 | ||||||
キーワード | MEMBRANE PROTEIN (膜タンパク質) / PROTEIN (タンパク質) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Toll Like Receptor 5 (TLR5) Cascade / toll-like receptor 5 signaling pathway / MyD88 deficiency (TLR5) / IRAK4 deficiency (TLR5) / MyD88 cascade initiated on plasma membrane / interleukin-1 receptor binding / pattern recognition receptor activity / Toll様受容体 / positive regulation of interleukin-8 production / cellular response to mechanical stimulus ...Toll Like Receptor 5 (TLR5) Cascade / toll-like receptor 5 signaling pathway / MyD88 deficiency (TLR5) / IRAK4 deficiency (TLR5) / MyD88 cascade initiated on plasma membrane / interleukin-1 receptor binding / pattern recognition receptor activity / Toll様受容体 / positive regulation of interleukin-8 production / cellular response to mechanical stimulus / transmembrane signaling receptor activity / signaling receptor activity / 炎症 / 自然免疫系 / 細胞膜 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
データ登録者 | Shabalkina, A.V. / Kornilov, F.D. / Goncharuk, M.V. / Goncharuk, S.A. / Arseniev, A.S. / Mineev, K.S. | ||||||
資金援助 | ロシア, 1件
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引用 | ジャーナル: Nat Commun / 年: 2023 タイトル: The architecture of transmembrane and cytoplasmic juxtamembrane regions of Toll-like receptors. 著者: Kornilov, F.D. / Shabalkina, A.V. / Lin, C. / Volynsky, P.E. / Kot, E.F. / Kayushin, A.L. / Lushpa, V.A. / Goncharuk, M.V. / Arseniev, A.S. / Goncharuk, S.A. / Wang, X. / Mineev, K.S. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 8ar2.cif.gz | 173.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb8ar2.ent.gz | 145.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 8ar2.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ar/8ar2 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ar/8ar2 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | 8ar0C 8ar1C 8ar3C C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 5880.270 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TLR5, TIL3 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: O60602 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |