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- PDB-8any: Human mitochondrial ribosome in complex with LRPPRC, SLIRP, A-sit... -

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基本情報

登録情報

データベース: PDB / ID: 8any

タイトル

Human mitochondrial ribosome in complex with LRPPRC, SLIRP, A-site, P-site, E-site tRNAs and mRNA

要素

(28S ribosomal protein ...) x 27
(39S ribosomal protein ...) x 48
12S mitochondrial rRNA
16S mitochondrial rRNA
A/A-tRNA
Aurora kinase A-interacting protein
Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1
E/E-tRNA
Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1
Large ribosomal subunit protein mL43
Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
P/P-tRNA
Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial
Peptidyl-tRNA hydrolase ICT1, mitochondrial
Ribosomal protein 63, mitochondrial
SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial
mRNA
mitochondrial tRNAVal

キーワード

RIBOSOME / mitochondrial translation / mRNA delivery

機能・相同性

機能・相同性情報

negative regulation of mitochondrial RNA catabolic process / mitochondrial RNA catabolic process / : / regulation of mitochondrial translation / flagellated sperm motility / mitochondrial ribosome binding / rRNA import into mitochondrion / Respiratory electron transport / mitochondrial transcription / mitochondrial translational elongation ...negative regulation of mitochondrial RNA catabolic process / mitochondrial RNA catabolic process / : / regulation of mitochondrial translation / flagellated sperm motility / mitochondrial ribosome binding / rRNA import into mitochondrion / Respiratory electron transport / mitochondrial transcription / mitochondrial translational elongation / mitochondrial translational termination / mitochondrial ribosome assembly / translation release factor activity, codon nonspecific / microprocessor complex / Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / Mitochondrial translation initiation / positive regulation of mitochondrial translation / negative regulation of mitotic nuclear division / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 5'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ / mitochondrial large ribosomal subunit / peptidyl-tRNA hydrolase / nuclear outer membrane / mitochondrial small ribosomal subunit / aminoacyl-tRNA hydrolase activity / mitochondrion transport along microtubule / nuclear inner membrane / mitochondrial ribosome / mitochondrial translation / beta-tubulin binding / mitochondrial nucleoid / positive regulation of proteolysis / ribosomal small subunit binding / spermatid development / single fertilization / sperm flagellum / anatomical structure morphogenesis / mRNA transport / RNA processing / Mitochondrial protein degradation / rescue of stalled ribosome / acrosomal vesicle / condensed nuclear chromosome / cellular response to leukemia inhibitory factor / mRNA 3'-UTR binding / TP53 Regulates Metabolic Genes / apoptotic signaling pathway / Cytoprotection by HMOX1 / fibrillar center / double-stranded RNA binding / cell junction / regulation of translation / ribosomal small subunit assembly / single-stranded DNA binding / small ribosomal subunit / small ribosomal subunit rRNA binding / 5S rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / microtubule binding / endonuclease activity / nuclear membrane / cytosolic small ribosomal subunit / microtubule / cell population proliferation / cytosolic large ribosomal subunit / mitochondrial inner membrane / tRNA binding / cytoplasmic translation / cytoskeleton / nuclear body / rRNA binding / negative regulation of translation / ribosome / structural constituent of ribosome / mitochondrial matrix / ribonucleoprotein complex / translation / cell cycle / protein domain specific binding / intracellular membrane-bounded organelle / nucleotide binding / mRNA binding / apoptotic process / synapse / ubiquitin protein ligase binding / nucleolus / GTP binding / positive regulation of DNA-templated transcription / perinuclear region of cytoplasm / mitochondrion / RNA binding / extracellular space / nucleoplasm / membrane / nucleus / plasma membrane / cytoplasm / cytosol
類似検索 - 分子機能

Leucine-rich PPR motif-containing protein / SLIRP, RNA recognition motif / PPR repeat / Ribosomal protein L1, mitochondrial / Pentacotripeptide-repeat region of PRORP / Pentacotripeptide-repeat region of PRORP / Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1 / 28S ribosomal protein S26 / Mitochondrial ribosome subunit S26 / Cysteine alpha-hairpin motif superfamily ...Leucine-rich PPR motif-containing protein / SLIRP, RNA recognition motif / PPR repeat / Ribosomal protein L1, mitochondrial / Pentacotripeptide-repeat region of PRORP / Pentacotripeptide-repeat region of PRORP / Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1 / 28S ribosomal protein S26 / Mitochondrial ribosome subunit S26 / Cysteine alpha-hairpin motif superfamily / PPR repeat family / 28S ribosomal protein S27, mitochondrial / MRPS27/PTCD2 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S27 / Ribosomal protein S22, mitochondrial / Ribosomal protein S23, mitochondrial / Ribosomal protein S23/S25, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S31 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S22 / Mitochondrial ribosomal protein S23 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S31 / Ribosomal protein S29, mitochondrial / Ribosomal protein S28, mitochondrial / 28S ribosomal protein S10, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein MRP-S35 / 28S ribosomal protein S24, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S34 / Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3 / 28S ribosomal protein S17, mitochondrial / 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial / : / Mitochondrial ribosome subunit S24 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S34 / Small ribosomal subunit protein uS5m, N-terminal / 28S ribosomal protein S25, mitochondrial / Ribosomal protein L37, mitochondrial / Ribosomal protein L55, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L48 / 39S ribosomal protein L40, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L55 superfamily / Mitochondrial ribosomal protein L37 / Mitochondrial ribosomal protein L55 / Pentatricopeptide repeat domain / Mitochondrial ribosomal protein L46 NUDIX / Ribosomal protein S30, mitochondrial / Ribosomal protein L53, mitochondrial / 39S ribosomal protein L53/MRP-L53 / 39S ribosomal protein L42, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S32 / Ribosomal protein L28/L40, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L28 / Ribosomal protein S27/S33, mitochondrial / Ribosomal protein 63, mitochondrial / Growth arrest/ DNA-damage-inducible protein-interacting protein 1 / Ribosomal protein L51, mitochondrial / Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal subunit S27 / Growth arrest and DNA-damage-inducible proteins-interacting protein 1 / Mitochondrial ribosomal subunit / Mitochondrial ribosome protein 63 / Ribosomal protein L37/S30 / Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial, conserved domain / Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1 domain superfamily / Mitochondrial 28S ribosomal protein S30 (PDCD9) / Mitochondrial ribosomal subunit protein / 39S ribosomal protein L52, mitochondrial / Mitoribosomal protein mL52 / Ribosomal protein L35, mitochondrial / MRPL44, double-stranded RNA binding domain / Tim44-like domain / Tim44-like domain / Tim44 / Pentatricopeptide (PPR) repeat profile. / Ribosomal protein S23/S29, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal death-associated protein 3 / Ribosomal protein L49/IMG2 / Mitochondrial large subunit ribosomal protein (Img2) / Ribosomal protein L46, N-terminal / 39S mitochondrial ribosomal protein L46 / Ribosomal protein L50, mitochondria / Ribosomal protein L27/L41, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L27 / Ribosomal subunit 39S / 39S ribosomal protein L46, mitochondrial / Pentatricopeptide repeat / Mitochondrial mRNA-processing protein COX24, C-terminal / Mitochondrial mRNA-processing protein COX24, C-terminal / Mitochondrial domain of unknown function (DUF1713) / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation domain superfamily / Ribosomal protein L7/L12 dimerisation domain / Ribosomal protein L7/L12 / Ribosomal protein L7/L12, C-terminal / Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain / 39S ribosomal protein L43/54S ribosomal protein L51 / Ribosomal protein L47, mitochondrial / MRP-L47 superfamily, mitochondrial / Mitochondrial 39-S ribosomal protein L47 (MRP-L47) / Phosphatidylethanolamine-binding protein / Phosphatidylethanolamine-binding protein
類似検索 - ドメイン・相同性

ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / : / NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE / 1,4-DIAMINOBUTANE / SPERMIDINE / SPERMINE / VALINE / : ...ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / : / NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE / 1,4-DIAMINOBUTANE / SPERMIDINE / SPERMINE / VALINE / : / RNA / RNA (> 10) / RNA (> 100) / RNA (> 1000) / Small ribosomal subunit protein uS12m / Small ribosomal subunit protein uS14m / Large ribosomal subunit protein bL33m / Large ribosomal subunit protein uL3m / Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein bL19m / Small ribosomal subunit protein mS29 / Large ribosomal subunit protein bL12m / Small ribosomal subunit protein mS22 / Small ribosomal subunit protein mS25 / Small ribosomal subunit protein uS10m / Small ribosomal subunit protein mS35 / Small ribosomal subunit protein uS5m / Small ribosomal subunit protein uS11m / Small ribosomal subunit protein uS15m / Small ribosomal subunit protein bS21m / Small ribosomal subunit protein mS34 / Small ribosomal subunit protein bS6m / Small ribosomal subunit protein uS9m / Large ribosomal subunit protein bL28m / Large ribosomal subunit protein mL49 / Large ribosomal subunit protein mL62 / Large ribosomal subunit protein uL23m / Large ribosomal subunit protein mL51 / Large ribosomal subunit protein uL2m / Large ribosomal subunit protein mL54 / Large ribosomal subunit protein uL14m / Large ribosomal subunit protein bL21m / Large ribosomal subunit protein mL55 / Large ribosomal subunit protein uL10m / Large ribosomal subunit protein mL52 / Large ribosomal subunit protein mL41 / Large ribosomal subunit protein mL50 / Large ribosomal subunit protein mL43 / Large ribosomal subunit protein mL64 / Large ribosomal subunit protein uL30m / Small ribosomal subunit protein mS27 / Small ribosomal subunit protein mS31 / Large ribosomal subunit protein uL24m / Small ribosomal subunit protein mS37 / Large ribosomal subunit protein mL38 / Small ribosomal subunit protein uS3m / Large ribosomal subunit protein mL53 / Small ribosomal subunit protein mS39 / Large ribosomal subunit protein mL48 / Large ribosomal subunit protein bL34m / Large ribosomal subunit protein mL63 / Large ribosomal subunit protein mL45 / Large ribosomal subunit protein bL32m / Large ribosomal subunit protein bL20m / Large ribosomal subunit protein uL13m / Large ribosomal subunit protein bL9m / Large ribosomal subunit protein uL4m / Large ribosomal subunit protein uL1m / Small ribosomal subunit protein mS26 / Large ribosomal subunit protein mL37 / SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein uL18m / Large ribosomal subunit protein mL46 / Large ribosomal subunit protein mL44 / Large ribosomal subunit protein uL29m / Large ribosomal subunit protein mL65 / Large ribosomal subunit protein mL40 / Large ribosomal subunit protein bL17m / Large ribosomal subunit protein mL66 / Small ribosomal subunit protein mS38 / Large ribosomal subunit protein uL22m / Large ribosomal subunit protein uL16m / Large ribosomal subunit protein mL39 / Large ribosomal subunit protein bL35m / Large ribosomal subunit protein uL15m / Large ribosomal subunit protein bL36m / Large ribosomal subunit protein bL27m / Small ribosomal subunit protein mS33 / Small ribosomal subunit protein bS1m / Small ribosomal subunit protein uS17m / Small ribosomal subunit protein uS7m / Small ribosomal subunit protein uS2m / Large ribosomal subunit protein uL11m / Small ribosomal subunit protein bS16m / Small ribosomal subunit protein bS18m / Small ribosomal subunit protein mS23 / Small ribosomal subunit protein mS40 / Large ribosomal subunit protein mL42
類似検索 - 構成要素

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.85 Å

データ登録者

Singh, V. / Itoh, Y. / Amunts, A.

資金援助

スウェーデン, European Union, 5件

組織	認可番号	国
Swedish Research Council		スウェーデン
Knut and Alice Wallenberg Foundation		スウェーデン
European Research Council (ERC)		European Union
European Molecular Biology Organization (EMBO)		European Union
H2020 Marie Curie Actions of the European Commission		European Union

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: Structural basis of LRPPRC-SLIRP-dependent translation by the mitoribosome
著者: Singh, V. / Conor, J. / Itoh, Y. / Soto, T. / Fontanesi, F. / Couvillian, M. / Huynen, M. / Churchman, S. / Barrientos, A. / Amunts, A.

履歴

登録	2022年8月6日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2023年8月16日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 2.0	2023年11月15日	Group: Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ: atom_site / chem_comp_atom ...atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_validate_rmsd_angle / pdbx_validate_torsion / struct_conn Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id
改定 2.1	2024年1月17日	Group: Structure summary / カテゴリ: chem_comp / Item: _chem_comp.pdbx_synonyms
改定 2.2	2024年4月24日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 ..._chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag / _chem_comp_bond.value_order
改定 3.0	2024年6月26日	Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Non-polymer description / Polymer sequence / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / em_admin / em_entity_assembly / entity / entity_name_com / entity_poly / entity_poly_seq / pdbx_poly_seq_scheme / pdbx_struct_mod_residue / pdbx_unobs_or_zero_occ_residues / struct_conn / struct_ref / struct_ref_seq / struct_ref_seq_dif Item: _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y ..._atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.group_PDB / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_seq_id / _atom_site.pdbx_PDB_ins_code / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _chem_comp.type / _em_admin.last_update / _em_entity_assembly.entity_id_list / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity_name_com.name / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can / _entity_poly_seq.mon_id / _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id / _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num / _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id / _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code / _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id / _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref.db_code / _struct_ref.db_name / _struct_ref.pdbx_align_begin / _struct_ref.pdbx_db_accession / _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code / _struct_ref_seq.db_align_beg / _struct_ref_seq.db_align_end / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg / _struct_ref_seq.pdbx_db_accession / _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code / _struct_ref_seq.seq_align_beg

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構造の表示

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロードとリンク

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	8any.cif.gz	7.4 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb8any.ent.gz		表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	8any.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	8any_validation.pdf.gz	1.6 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	8any_full_validation.pdf.gz	1.7 MB	表示
XML形式データ	8any_validation.xml.gz	356.6 KB	表示
CIF形式データ	8any_validation.cif.gz	658.5 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/an/8any ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/an/8any	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	15544MC 16407C 16408C 16409C 16410C 16411C 16412C 16413C 16414C M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 (文献)
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類似性 (1)

-
集合体

登録構造単位

AA: 12S mitochondrial rRNA

AB: 28S ribosomal protein S2, mitochondrial

AC: 28S ribosomal protein S24, mitochondrial

AD: 28S ribosomal protein S5, mitochondrial

AE: 28S ribosomal protein S6, mitochondrial

AF: 28S ribosomal protein S7, mitochondrial

AG: 28S ribosomal protein S9, mitochondrial

AH: 28S ribosomal protein S10, mitochondrial

AI: 28S ribosomal protein S11, mitochondrial

AJ: 28S ribosomal protein S12, mitochondrial

AK: 28S ribosomal protein S14, mitochondrial

AL: 28S ribosomal protein S15, mitochondrial

AM: 28S ribosomal protein S16, mitochondrial

AN: 28S ribosomal protein S17, mitochondrial

AO: 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial

AP: 28S ribosomal protein S18c, mitochondrial

AQ: 28S ribosomal protein S21, mitochondrial

AR: 28S ribosomal protein S22, mitochondrial

AS: 28S ribosomal protein S23, mitochondrial

AT: 28S ribosomal protein S25, mitochondrial

AU: 28S ribosomal protein S26, mitochondrial

AV: 28S ribosomal protein S27, mitochondrial

AW: 28S ribosomal protein S28, mitochondrial

AX: 28S ribosomal protein S29, mitochondrial

AZ: 28S ribosomal protein S33, mitochondrial

A0: 28S ribosomal protein S34, mitochondrial

A1: 28S ribosomal protein S35, mitochondrial

A2: Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1

A3: Aurora kinase A-interacting protein

Aw: A/A-tRNA

Ax: P/P-tRNA

Ay: E/E-tRNA

A: 16S mitochondrial rRNA

B: mitochondrial tRNAVal

D: 39S ribosomal protein L2, mitochondrial

E: 39S ribosomal protein L3, mitochondrial

F: 39S ribosomal protein L4, mitochondrial

I: 39S ribosomal protein L10, mitochondrial

J: 39S ribosomal protein L11, mitochondrial

K: 39S ribosomal protein L13, mitochondrial

L: 39S ribosomal protein L14, mitochondrial

M: 39S ribosomal protein L15, mitochondrial

N: 39S ribosomal protein L16, mitochondrial

O: 39S ribosomal protein L17, mitochondrial

P: 39S ribosomal protein L18, mitochondrial

Q: 39S ribosomal protein L19, mitochondrial

R: 39S ribosomal protein L20, mitochondrial

S: 39S ribosomal protein L21, mitochondrial

T: 39S ribosomal protein L22, mitochondrial

U: 39S ribosomal protein L23, mitochondrial

V: 39S ribosomal protein L24, mitochondrial

W: 39S ribosomal protein L27, mitochondrial

X: 39S ribosomal protein L28, mitochondrial

Y: 39S ribosomal protein L47, mitochondrial

Z: 39S ribosomal protein L30, mitochondrial

0: 39S ribosomal protein L32, mitochondrial

1: 39S ribosomal protein L33, mitochondrial

2: 39S ribosomal protein L34, mitochondrial

3: 39S ribosomal protein L35, mitochondrial

4: 39S ribosomal protein L36, mitochondrial

5: 39S ribosomal protein L37, mitochondrial

6: 39S ribosomal protein L38, mitochondrial

7: 39S ribosomal protein L39, mitochondrial

8: 39S ribosomal protein L40, mitochondrial

9: 39S ribosomal protein L41, mitochondrial

a: 39S ribosomal protein L42, mitochondrial

b: Large ribosomal subunit protein mL43

c: 39S ribosomal protein L44, mitochondrial

d: 39S ribosomal protein L45, mitochondrial

e: 39S ribosomal protein L46, mitochondrial

f: 39S ribosomal protein L48, mitochondrial

g: 39S ribosomal protein L49, mitochondrial

h: 39S ribosomal protein L50, mitochondrial

i: 39S ribosomal protein L51, mitochondrial

j: 39S ribosomal protein L52, mitochondrial

k: 39S ribosomal protein L53, mitochondrial

l: 39S ribosomal protein L54, mitochondrial

m: 39S ribosomal protein L55, mitochondrial

o: Ribosomal protein 63, mitochondrial

p: Peptidyl-tRNA hydrolase ICT1, mitochondrial

q: Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1

r: 39S ribosomal protein S18a, mitochondrial

s: 39S ribosomal protein S30, mitochondrial

t: 39S ribosomal protein L12, mitochondrial

u: 39S ribosomal protein L12, mitochondrial

v: 39S ribosomal protein L12, mitochondrial

w: 39S ribosomal protein L12, mitochondrial

x: 39S ribosomal protein L12, mitochondrial

y: 39S ribosomal protein L12, mitochondrial

H: 39S ribosomal protein L9, mitochondrial

z: 39S ribosomal protein L1, mitochondrial

AY: 28S ribosomal protein S31, mitochondrial

A5: Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial

A4: Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial

A6: SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial

Az: mRNA

ヘテロ分子

3.31 MDa, 96 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

登録構造と同一
登録者が定義した集合体
根拠: 電子顕微鏡法

-
要素

-
RNA鎖 , 7種, 7分子 AAAwAxAyABAz

#1: RNA鎖	12S mitochondrial rRNA 分子量: 306218.312 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: GenBank: 1858621102
#30: RNA鎖	A/A-tRNA 分子量: 21627.838 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
#31: RNA鎖	P/P-tRNA 分子量: 22354.291 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
#32: RNA鎖	E/E-tRNA 分子量: 22369.307 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
#33: RNA鎖	16S mitochondrial rRNA 分子量: 500727.125 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
#34: RNA鎖	mitochondrial tRNAVal 分子量: 22989.752 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
#91: RNA鎖	mRNA 分子量: 13286.822 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)

+
28S ribosomal protein ... , 27種, 27分子 ABACADAEAFAGAHAIAJAKALAMANAOAPAQARASATAUAVAWAXAZA0A1AY

#2: タンパク質	28S ribosomal protein S2, mitochondrial / MRP-S2 / S2mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS2m 分子量: 33298.238 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y399
#3: タンパク質	28S ribosomal protein S24, mitochondrial / MRP-S24 / S24mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS3m / bMRP-47 / bMRP47 分子量: 19046.164 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96EL2
#4: タンパク質	28S ribosomal protein S5, mitochondrial / MRP-S5 / S5mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS5m 分子量: 48094.594 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82675
#5: タンパク質	28S ribosomal protein S6, mitochondrial / MRP-S6 / S6mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS6m 分子量: 14250.588 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82932
#6: タンパク質	28S ribosomal protein S7, mitochondrial / MRP-S7 / S7mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS7m / bMRP-27a / bMRP27a 分子量: 28186.154 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y2R9
#7: タンパク質	28S ribosomal protein S9, mitochondrial / MRP-S9 / S9mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS9m 分子量: 45909.859 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82933
#8: タンパク質	28S ribosomal protein S10, mitochondrial / MRP-S10 / S10mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS10m 分子量: 23033.500 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82664
#9: タンパク質	28S ribosomal protein S11, mitochondrial / MRP-S11 / S11mt / Cervical cancer proto-oncogene 2 protein / HCC-2 / Mitochondrial small ribosomal ...MRP-S11 / S11mt / Cervical cancer proto-oncogene 2 protein / HCC-2 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS11m 分子量: 20663.805 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82912
#10: タンパク質	28S ribosomal protein S12, mitochondrial / MRP-S12 / S12mt / MT-RPS12 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS12m 分子量: 15200.947 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O15235
#11: タンパク質	28S ribosomal protein S14, mitochondrial / MRP-S14 / S14mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS14m 分子量: 15168.788 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O60783
#12: タンパク質	28S ribosomal protein S15, mitochondrial / MRP-S15 / S15mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS15m 分子量: 29903.293 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82914
#13: タンパク質	28S ribosomal protein S16, mitochondrial / MRP-S16 / S16mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS16m 分子量: 15371.899 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3D3
#14: タンパク質	28S ribosomal protein S17, mitochondrial / MRP-S17 / S17mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS17m 分子量: 14526.078 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y2R5
#15: タンパク質	28S ribosomal protein S18b, mitochondrial / MRP-S18-b / Mrps18-b / S18mt-b / 28S ribosomal protein S18-2 / mitochondrial / MRP-S18-2 / ...MRP-S18-b / Mrps18-b / S18mt-b / 28S ribosomal protein S18-2 / mitochondrial / MRP-S18-2 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS18b / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS40 分子量: 29440.629 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y676
#16: タンパク質	28S ribosomal protein S18c, mitochondrial / MRP-S18-c / Mrps18-c / S18mt-c / 28S ribosomal protein S18-1 / mitochondrial / MRP-S18-1 / ...MRP-S18-c / Mrps18-c / S18mt-c / 28S ribosomal protein S18-1 / mitochondrial / MRP-S18-1 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS18c / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS18m 分子量: 15876.786 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3D5
#17: タンパク質	28S ribosomal protein S21, mitochondrial / MRP-S21 / S21mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS21m 分子量: 10806.689 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82921
#18: タンパク質	28S ribosomal protein S22, mitochondrial / MRP-S22 / S22mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS22 分子量: 41337.316 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82650
#19: タンパク質	28S ribosomal protein S23, mitochondrial / MRP-S23 / S23mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS23 分子量: 21805.664 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3D9
#20: タンパク質	28S ribosomal protein S25, mitochondrial / MRP-S25 / S25mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS25 分子量: 20146.428 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82663
#21: タンパク質	28S ribosomal protein S26, mitochondrial / MRP-S26 / S26mt / 28S ribosomal protein S13 / mitochondrial / MRP-S13 / S13mt / Mitochondrial small ...MRP-S26 / S26mt / 28S ribosomal protein S13 / mitochondrial / MRP-S13 / S13mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS26 分子量: 24259.820 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYN8
#22: タンパク質	28S ribosomal protein S27, mitochondrial / MRP-S27 / S27mt / Mitochondrial ribosomal protein S27 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS27 分子量: 47669.262 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q92552
#23: タンパク質	28S ribosomal protein S28, mitochondrial / MRP-S28 / S28mt / 28S ribosomal protein S35 / mitochondrial / MRP-S35 / S35mt / Mitochondrial small ...MRP-S28 / S28mt / 28S ribosomal protein S35 / mitochondrial / MRP-S35 / S35mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS1m 分子量: 20878.846 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y2Q9
#24: タンパク質	28S ribosomal protein S29, mitochondrial / MRP-S29 / S29mt / Death-associated protein 3 / DAP-3 / Ionizing radiation resistance conferring ...MRP-S29 / S29mt / Death-associated protein 3 / DAP-3 / Ionizing radiation resistance conferring protein / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS29 分子量: 45634.406 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P51398
#25: タンパク質	28S ribosomal protein S33, mitochondrial / MRP-S33 / S33mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS33 分子量: 12657.776 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y291
#26: タンパク質	28S ribosomal protein S34, mitochondrial / MRP-S34 / S34mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS34 分子量: 25564.354 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82930
#27: タンパク質	28S ribosomal protein S35, mitochondrial / MRP-S35 / S35mt / 28S ribosomal protein S28 / mitochondrial / MRP-S28 / S28mt / Mitochondrial small ...MRP-S35 / S35mt / 28S ribosomal protein S28 / mitochondrial / MRP-S28 / S28mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS35 分子量: 36898.328 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82673
#87: タンパク質	28S ribosomal protein S31, mitochondrial / MRP-S31 / S31mt / Imogen 38 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS31 分子量: 45391.473 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q92665

-
タンパク質 , 9種, 9分子 A2A3bopqA5A4A6

#28: タンパク質	Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1 / 28S ribosomal protein S37 / mitochondrial / MRP-S37 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein ...28S ribosomal protein S37 / mitochondrial / MRP-S37 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS37 / Nuclear protein C2360 分子量: 13540.856 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96BP2
#29: タンパク質	Aurora kinase A-interacting protein / AURKA-interacting protein / 28S ribosomal protein S38 / mitochondrial / MRP-S38 / Mitochondrial ...AURKA-interacting protein / 28S ribosomal protein S38 / mitochondrial / MRP-S38 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS38 分子量: 22395.326 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NWT8
#67: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL43 / 39S ribosomal protein L43 / mitochondrial / L43mt / MRP-L43 / Mitochondrial ribosomal protein bMRP36a 分子量: 23352.633 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8N983
#79: タンパク質	Ribosomal protein 63, mitochondrial / hMRP63 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL63 / Mitochondrial ribosomal protein 63 / ...hMRP63 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL63 / Mitochondrial ribosomal protein 63 / Mitochondrial ribosomal protein L57 分子量: 12292.333 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BQC6
#80: タンパク質	Peptidyl-tRNA hydrolase ICT1, mitochondrial / 39S ribosomal protein L58 / mitochondrial / MRP-L58 / Digestion substraction 1 / DS-1 / Immature ...39S ribosomal protein L58 / mitochondrial / MRP-L58 / Digestion substraction 1 / DS-1 / Immature colon carcinoma transcript 1 protein / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL62 分子量: 23674.203 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q14197, peptidyl-tRNA hydrolase
#81: タンパク質	Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1 / 39S ribosomal protein L59 / mitochondrial / MRP-L59 / CKII beta-associating protein / CR6- ...39S ribosomal protein L59 / mitochondrial / MRP-L59 / CKII beta-associating protein / CR6-interacting factor 1 / CRIF1 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL64 / Papillomavirus L2-interacting nuclear protein 1 / PLINP / PLINP-1 / p53-responsive gene 6 protein 分子量: 25426.895 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8TAE8
#88: タンパク質	Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial / 130 kDa leucine-rich protein / LRP 130 / GP130 分子量: 158098.359 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P42704
#89: タンパク質	Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial / 28S ribosomal protein S39 / mitochondrial / MRP-S39 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein ...28S ribosomal protein S39 / mitochondrial / MRP-S39 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS39 / Transformation-related gene 15 protein / TRG-15 分子量: 78648.547 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96EY7
#90: タンパク質	SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial 分子量: 12371.032 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9GZT3

+
39S ribosomal protein ... , 48種, 53分子 DEFIJKLMNOPQRSTUVWXYZ012345678...

#35: タンパク質	39S ribosomal protein L2, mitochondrial / L2mt / MRP-L2 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL2m 分子量: 33355.941 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q5T653
#36: タンパク質	39S ribosomal protein L3, mitochondrial / L3mt / MRP-L3 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL3m 分子量: 38689.562 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P09001
#37: タンパク質	39S ribosomal protein L4, mitochondrial / L4mt / MRP-L4 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL4m 分子量: 34970.195 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYD3
#38: タンパク質	39S ribosomal protein L10, mitochondrial / L10mt / MRP-L10 / 39S ribosomal protein L8 / mitochondrial / L8mt / MRP-L8 / Mitochondrial large ...L10mt / MRP-L10 / 39S ribosomal protein L8 / mitochondrial / L8mt / MRP-L8 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL10m 分子量: 29322.529 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q7Z7H8
#39: タンパク質	39S ribosomal protein L11, mitochondrial / L11mt / MRP-L11 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL11m 分子量: 20716.227 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3B7
#40: タンパク質	39S ribosomal protein L13, mitochondrial / L13mt / MRP-L13 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL13m 分子量: 20765.023 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYD1
#41: タンパク質	39S ribosomal protein L14, mitochondrial / L14mt / MRP-L14 / 39S ribosomal protein L32 / mitochondrial / L32mt / MRP-L32 / Mitochondrial large ...L14mt / MRP-L14 / 39S ribosomal protein L32 / mitochondrial / L32mt / MRP-L32 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL14m 分子量: 15973.702 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q6P1L8
#42: タンパク質	39S ribosomal protein L15, mitochondrial / L15mt / MRP-L15 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL15m 分子量: 33473.820 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9P015
#43: タンパク質	39S ribosomal protein L16, mitochondrial / L16mt / MRP-L16 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL16m 分子量: 28496.285 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NX20
#44: タンパク質	39S ribosomal protein L17, mitochondrial / L17mt / MRP-L17 / LYST-interacting protein 2 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL17m 分子量: 20083.266 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NRX2
#45: タンパク質	39S ribosomal protein L18, mitochondrial / L18mt / MRP-L18 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL18m 分子量: 20607.570 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9H0U6
#46: タンパク質	39S ribosomal protein L19, mitochondrial / L19mt / MRP-L19 / 39S ribosomal protein L15 / mitochondrial / L15mt / MRP-L15 / Mitochondrial large ...L19mt / MRP-L19 / 39S ribosomal protein L15 / mitochondrial / L15mt / MRP-L15 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL19m 分子量: 33584.996 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P49406
#47: タンパク質	39S ribosomal protein L20, mitochondrial / L20mt / MRP-L20 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL20m 分子量: 17479.654 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYC9
#48: タンパク質	39S ribosomal protein L21, mitochondrial / L21mt / MRP-L21 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL21m 分子量: 22847.682 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q7Z2W9
#49: タンパク質	39S ribosomal protein L22, mitochondrial / L22mt / MRP-L22 / 39S ribosomal protein L25 / mitochondrial / L25mt / MRP-L25 / Mitochondrial large ...L22mt / MRP-L22 / 39S ribosomal protein L25 / mitochondrial / L25mt / MRP-L25 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL22m 分子量: 23683.732 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NWU5
#50: タンパク質	39S ribosomal protein L23, mitochondrial / L23mt / MRP-L23 / L23 mitochondrial-related protein / Mitochondrial large ribosomal subunit protein ...L23mt / MRP-L23 / L23 mitochondrial-related protein / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL23m / Ribosomal protein L23-like 分子量: 17849.227 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q16540
#51: タンパク質	39S ribosomal protein L24, mitochondrial / L24mt / MRP-L24 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL24m 分子量: 24953.875 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96A35
#52: タンパク質	39S ribosomal protein L27, mitochondrial / L27mt / MRP-L27 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL27m 分子量: 16102.859 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9P0M9
#53: タンパク質	39S ribosomal protein L28, mitochondrial / L28mt / MRP-L28 / Melanoma antigen p15 / Melanoma-associated antigen recognized by T-lymphocytes / ...L28mt / MRP-L28 / Melanoma antigen p15 / Melanoma-associated antigen recognized by T-lymphocytes / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL28m 分子量: 30202.867 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q13084
#54: タンパク質	39S ribosomal protein L47, mitochondrial / L47mt / MRP-L47 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL29m / Nasopharyngeal carcinoma ...L47mt / MRP-L47 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL29m / Nasopharyngeal carcinoma metastasis-related protein 1 分子量: 29508.535 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9HD33
#55: タンパク質	39S ribosomal protein L30, mitochondrial / L30mt / MRP-L30 / 39S ribosomal protein L28 / mitochondrial / L28mt / MRP-L28 / Mitochondrial large ...L30mt / MRP-L30 / 39S ribosomal protein L28 / mitochondrial / L28mt / MRP-L28 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL30m 分子量: 18582.812 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8TCC3
#56: タンパク質	39S ribosomal protein L32, mitochondrial / L32mt / MRP-L32 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL32m 分子量: 21437.799 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYC8
#57: タンパク質	39S ribosomal protein L33, mitochondrial / L33mt / MRP-L33 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL33m 分子量: 7635.204 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O75394
#58: タンパク質	39S ribosomal protein L34, mitochondrial / L34mt / MRP-L34 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL34m 分子量: 10183.913 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BQ48
#59: タンパク質	39S ribosomal protein L35, mitochondrial / L35mt / MRP-L35 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL35m 分子量: 21558.488 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NZE8
#60: タンパク質	39S ribosomal protein L36, mitochondrial / L36mt / MRP-L36 / BRCA1-interacting protein 1 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL36m 分子量: 11809.301 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9P0J6
#61: タンパク質	39S ribosomal protein L37, mitochondrial / L37mt / MRP-L37 / 39S ribosomal protein L2 / mitochondrial / L2mt / MRP-L2 / Mitochondrial large ...L37mt / MRP-L37 / 39S ribosomal protein L2 / mitochondrial / L2mt / MRP-L2 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL37 分子量: 48183.344 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BZE1
#62: タンパク質	39S ribosomal protein L38, mitochondrial / L38mt / MRP-L38 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL38 分子量: 44659.430 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96DV4
#63: タンパク質	39S ribosomal protein L39, mitochondrial / L39mt / MRP-L39 / 39S ribosomal protein L5 / mitochondrial / L5mt / MRP-L5 / Mitochondrial large ...L39mt / MRP-L39 / 39S ribosomal protein L5 / mitochondrial / L5mt / MRP-L5 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL39 分子量: 38764.785 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NYK5
#64: タンパク質	39S ribosomal protein L40, mitochondrial / L40mt / MRP-L40 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL40 / Nuclear localization signal- ...L40mt / MRP-L40 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL40 / Nuclear localization signal-containing protein deleted in velocardiofacial syndrome / Up-regulated in metastasis 分子量: 24534.422 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NQ50
#65: タンパク質	39S ribosomal protein L41, mitochondrial / L41mt / MRP-L41 / 39S ribosomal protein L27 homolog / Bcl-2-interacting mitochondrial ribosomal ...L41mt / MRP-L41 / 39S ribosomal protein L27 homolog / Bcl-2-interacting mitochondrial ribosomal protein L41 / Cell proliferation-inducing gene 3 protein / MRP-L27 homolog / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL41 分子量: 15404.708 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8IXM3
#66: タンパク質	39S ribosomal protein L42, mitochondrial / L42mt / MRP-L42 / 39S ribosomal protein L31 / mitochondrial / L31mt / MRP-L31 / Mitochondrial large ...L42mt / MRP-L42 / 39S ribosomal protein L31 / mitochondrial / L31mt / MRP-L31 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL42 分子量: 16691.176 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y6G3
#68: タンパク質	39S ribosomal protein L44, mitochondrial / L44mt / MRP-L44 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL44 分子量: 37583.312 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) 参照: UniProt: Q9H9J2, 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 5'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ
#69: タンパク質	39S ribosomal protein L45, mitochondrial / L45mt / MRP-L45 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL45 分子量: 35402.918 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BRJ2
#70: タンパク質	39S ribosomal protein L46, mitochondrial / L46mt / MRP-L46 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL46 / P2ECSL 分子量: 31748.107 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9H2W6
#71: タンパク質	39S ribosomal protein L48, mitochondrial / L48mt / MRP-L48 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL48 分子量: 23970.814 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96GC5
#72: タンパク質	39S ribosomal protein L49, mitochondrial / L49mt / MRP-L49 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL49 / Neighbor of FAU / NOF / Protein NOF1 分子量: 19225.043 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q13405
#73: タンパク質	39S ribosomal protein L50, mitochondrial / L50mt / MRP-L50 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL50 分子量: 18349.943 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8N5N7
#74: タンパク質	39S ribosomal protein L51, mitochondrial / L51mt / MRP-L51 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL51 / bMRP-64 / bMRP64 分子量: 15125.917 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q4U2R6
#75: タンパク質	39S ribosomal protein L52, mitochondrial / L52mt / MRP-L52 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL52 分子量: 13682.658 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q86TS9
#76: タンパク質	39S ribosomal protein L53, mitochondrial / L53mt / MRP-L53 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL53 分子量: 12167.896 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96EL3
#77: タンパク質	39S ribosomal protein L54, mitochondrial / L54mt / MRP-L54 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL54 分子量: 15844.178 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q6P161
#78: タンパク質	39S ribosomal protein L55, mitochondrial / L55mt / MRP-L55 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL31m / Mitochondrial large ...L55mt / MRP-L55 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL31m / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL55 分子量: 15160.433 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q7Z7F7
#82: タンパク質	39S ribosomal protein S18a, mitochondrial / MRP-S18-a / Mrps18a / S18mt-a / 39S ribosomal protein S18-3 / mitochondrial / MRP-S18-3 / ...MRP-S18-a / Mrps18a / S18mt-a / 39S ribosomal protein S18-3 / mitochondrial / MRP-S18-3 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bS18a / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL66 分子量: 22224.078 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NVS2
#83: タンパク質	39S ribosomal protein S30, mitochondrial / MRP-S30 / S30mt / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL65 / Mitochondrial large ...MRP-S30 / S30mt / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL65 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mS30 / Programmed cell death protein 9 分子量: 50429.578 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NP92
#84: タンパク質	39S ribosomal protein L12, mitochondrial / L12mt / MRP-L12 / 5c5-2 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL12m 分子量: 21378.164 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P52815
#85: タンパク質	39S ribosomal protein L9, mitochondrial / L9mt / MRP-L9 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL9m 分子量: 30296.355 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYD2
#86: タンパク質	39S ribosomal protein L1, mitochondrial / L1mt / MRP-L1 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL1m 分子量: 36967.746 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYD6

-
非ポリマー , 12種, 7197分子

#92: 化合物	ChemComp-NAD / NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE 分子量: 663.425 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₁H₂₇N₇O₁₄P₂ / コメント: NAD*YM
#93: 化合物	ChemComp-SPM / SPERMINE / スペルミン分子量: 202.340 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₂₆N₄
#94: 化合物	ChemComp-SPD / SPERMIDINE / N-(2-AMINO-PROPYL)-1,4-DIAMINOBUTANE / PA(34) / スペルミジン分子量: 145.246 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₇H₁₉N₃
#95: 化合物	... ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 206 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#96: 化合物	... ChemComp-K / POTASSIUM ION / カリウムカチオン分子量: 39.098 Da / 分子数: 49 / 由来タイプ: 天然 / 式: K / 詳細: cell / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
#97: 化合物	ChemComp-ZN / ZINC ION 分子量: 65.409 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn
#98: 化合物	ChemComp-FES / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER 分子量: 175.820 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe₂S₂
#99: 化合物	ChemComp-ATP / ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP 分子量: 507.181 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₆N₅O₁₃P₃ / コメント: ATP, エネルギー貯蔵分子*YM
#100: 化合物	ChemComp-GDP / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP タイプ: RNA linking / 分子量: 443.201 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₁P₂ / コメント: GDP, エネルギー貯蔵分子*YM
#101: 化合物	ChemComp-PUT / 1,4-DIAMINOBUTANE / PUTRESCINE / プトレシン分子量: 88.151 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₂N₂
#102: 化合物	ChemComp-VAL / VALINE / バリンタイプ: L-peptide linking / 分子量: 117.146 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₅H₁₁NO₂
#103: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 6926 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	N

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実験情報

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実験

実験	手法: 電子顕微鏡法
EM実験	試料の集合状態: PARTICLE / ３次元再構成法: 単粒子再構成法

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試料調製

構成要素	名称: Human mitochondrial ribosome bound to LRPPRC-SLIRP, mRNA and tRNAs in the A-site, P-site and E-site タイプ: RIBOSOME / Entity ID: #1-#33, #35-#66, #68-#91 / 由来: NATURAL
由来(天然)	生物種: Homo sapiens (ヒト)
緩衝液	pH: 7.5
試料	包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES
急速凍結	凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡撮影

実験機器	モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company
顕微鏡	モデル: FEI TITAN KRIOS
電子銃	電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: SPOT SCAN
電子レンズ	モード: BRIGHT FIELD / 最大デフォーカス（公称値）: 2800 nm / 最小デフォーカス（公称値）: 600 nm
撮影	電子線照射量: 30 e/Å² / 検出モード: COUNTING フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
電子光学装置	エネルギーフィルタースリット幅: 20 eV

-
解析

CTF補正	タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
3次元再構成	解像度: 2.85 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 82522 / 対称性のタイプ: POINT

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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