+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8ajr | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | The Solution Structure of the Triple Mutant Methyl-CpG-Binding Domain from MeCP2 | ||||||
![]() | Methyl-CpG-binding protein 2 | ||||||
![]() | GENE REGULATION / Epigenetic modifications / Reader protein / Domain of MeCP2 | ||||||
機能・相同性 | ![]() double-stranded methylated DNA binding / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / nucleus 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Singh, H. | ||||||
資金援助 | ![]()
| ||||||
![]() | ![]() タイトル: Epigenetic CpG duplex marks probed by an evolved DNA reader via a well-tempered conformational plasticity. 著者: Singh, H. / Das, C.K. / Buchmuller, B.C. / Schafer, L.V. / Summerer, D. / Linser, R. #1: ![]() タイトル: Epigenetic CpG Duplex Marks Probed by an Evolved DNA Reader via a Well-Tempered Conformational Plasticity 著者: Singh, H. / Das, C.K. / Buchmuller, B.C. / Eppmann, S. / Schafer, L.V. / Summerer, D. / Linser, R. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 367.7 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 308.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 404.9 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 454.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 17.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 29.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8alqC C: 同じ文献を引用 ( |
---|---|
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
その他のデータベース |
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11905.288 Da / 分子数: 1 / 変異: T, A, N / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
|
-
試料調製
詳細 |
| |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
試料 |
| |||||||||||||||
試料状態 | イオン強度: 100 mM / Label: 13C and 15N / pH: 6 Not defined / 圧: 1 atm / 温度: 283 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE III HD / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE III HD / 磁場強度: 800 MHz |
---|
-
解析
NMR software |
| |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 / 詳細: total restraints 658 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |