- PDB-8ai4: Crystal structure of radical SAM epimerase EpeE C223A mutant from... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 8ai4
タイトル
Crystal structure of radical SAM epimerase EpeE C223A mutant from Bacillus subtilis with [4Fe-4S] clusters, S-adenosyl-L-homocysteine and RiPP peptide 5 bound
要素
Putative exported peptide YydF
Radical SAM core domain-containing protein
キーワード
METAL BINDING PROTEIN / radical SAM / metalloenzyme / iron-sulfur / RiPP
機能・相同性
機能・相同性情報
iron-sulfur cluster binding / catalytic activity / metal ion binding 類似検索 - 分子機能
YydF/SAG 2028 / Peptide radical SAM maturase , YydG / : / Radical SAM superfamily / Radical SAM core domain profile. / Radical SAM / Aldolase-type TIM barrel 類似検索 - ドメイン・相同性
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: Fe-SAD experimental model 解像度: 1.75→43.56 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.967 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.96 / SU R Cruickshank DPI: 0.091 / 交差検証法: THROUGHOUT / SU R Blow DPI: 0.095 / SU Rfree Blow DPI: 0.089 / SU Rfree Cruickshank DPI: 0.086