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Yorodumi- PDB-7w7i: Crystal Structure of shaft pilin PitB from pilus islet-2 of Strep... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 7w7i | ||||||
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Title | Crystal Structure of shaft pilin PitB from pilus islet-2 of Streptococcus oralis | ||||||
Components | FctA domain-containing protein | ||||||
Keywords | CELL ADHESION / Shaft pilin / adhesin / PitB / PI-2 pilus / Streptococcus oralis / isopeptide / omega loop / dental plaque / biofilm | ||||||
Function / homology | Streptococcal pilin isopeptide linker / Streptococcal pilin isopeptide linker superfamily / Spy0128-like isopeptide containing domain / membrane => GO:0016020 / FctA domain-containing protein Function and homology information | ||||||
Biological species | Streptococcus oralis ATCC 35037 (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 3.59 Å | ||||||
Authors | Yadav, R.K. / Krishnan, V. | ||||||
Funding support | India, 1items
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Citation | Journal: Febs J. / Year: 2022 Title: New structural insights into the PI-2 pilus from Streptococcus oralis, an early dental plaque colonizer. Authors: Yadav, R.K. / Krishnan, V. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 7w7i.cif.gz | 841.4 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb7w7i.ent.gz | 698.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 7w7i.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 7w7i_validation.pdf.gz | 492.2 KB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 7w7i_full_validation.pdf.gz | 529.7 KB | Display | |
Data in XML | 7w7i_validation.xml.gz | 78.5 KB | Display | |
Data in CIF | 7w7i_validation.cif.gz | 106.5 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w7/7w7i ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w7/7w7i | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 7f7ySC 7vcnC 7vcrC 7w6bC S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data | Similarity search - Function & homologyF&H Search |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Refine code: _
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