PDB-7tud: Crystal structure of HLA-B*44:05 (T73C) with 6mer EEFGRC and dipe...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7tud

タイトル

Crystal structure of HLA-B*44:05 (T73C) with 6mer EEFGRC and dipeptide GL

要素

Beta-2-microglobulin
EEFGRC peptide
GL dipeptide
HLA class I histocompatibility antigen, B alpha chain

キーワード

IMMUNE SYSTEM / tapasin / histocompatibility complex class I / MHC-I / HLA / peptide editing / peptide loading complex / PLC / antigen presentation / immune response

機能・相同性

機能・相同性情報

: / : / positive regulation of receptor binding / early endosome lumen / Nef mediated downregulation of MHC class I complex cell surface expression / negative regulation of receptor binding / DAP12 interactions / cellular response to iron ion / Endosomal/Vacuolar pathway / Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC ...: / : / positive regulation of receptor binding / early endosome lumen / Nef mediated downregulation of MHC class I complex cell surface expression / negative regulation of receptor binding / DAP12 interactions / cellular response to iron ion / Endosomal/Vacuolar pathway / Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC / peptide antigen assembly with MHC class II protein complex / cellular response to iron(III) ion / antigen processing and presentation of exogenous protein antigen via MHC class Ib, TAP-dependent / MHC class II protein complex / negative regulation of forebrain neuron differentiation / ER to Golgi transport vesicle membrane / peptide antigen assembly with MHC class I protein complex / regulation of erythrocyte differentiation / regulation of iron ion transport / MHC class I peptide loading complex / response to molecule of bacterial origin / HFE-transferrin receptor complex / T cell mediated cytotoxicity / antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I / positive regulation of T cell cytokine production / antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II / MHC class I protein complex / positive regulation of immune response / peptide antigen binding / negative regulation of neurogenesis / positive regulation of receptor-mediated endocytosis / positive regulation of T cell mediated cytotoxicity / positive regulation of T cell activation / multicellular organismal-level iron ion homeostasis / cellular response to nicotine / specific granule lumen / recycling endosome membrane / phagocytic vesicle membrane / positive regulation of cellular senescence / Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell / Interferon gamma signaling / negative regulation of epithelial cell proliferation / MHC class II protein complex binding / Modulation by Mtb of host immune system / late endosome membrane / sensory perception of smell / tertiary granule lumen / DAP12 signaling / positive regulation of protein binding / iron ion transport / negative regulation of neuron projection development / T cell differentiation in thymus / ER-Phagosome pathway / early endosome membrane / protein refolding / protein homotetramerization / amyloid fibril formation / intracellular iron ion homeostasis / learning or memory / Amyloid fiber formation / endoplasmic reticulum lumen / Golgi membrane / lysosomal membrane / external side of plasma membrane / focal adhesion / Neutrophil degranulation / SARS-CoV-2 activates/modulates innate and adaptive immune responses / structural molecule activity / Golgi apparatus / endoplasmic reticulum / protein homodimerization activity / extracellular space / extracellular exosome / extracellular region / identical protein binding / membrane / plasma membrane / cytosol
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)
Synthetic construct (人工物)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.45 Å

データ登録者

Jiang, J. / Natarajan, K. / Kim, E. / Boyd, L.F. / Margulies, D.H.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Nat Commun / 年: 2022
タイトル: Structural mechanism of tapasin-mediated MHC-I peptide loading in antigen presentation.
著者: Jiang, J. / Taylor, D.K. / Kim, E.J. / Boyd, L.F. / Ahmad, J. / Mage, M.G. / Truong, H.V. / Woodward, C.H. / Sgourakis, N.G. / Cresswell, P. / Margulies, D.H. / Natarajan, K.

履歴

登録	2022年2月2日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2022年9月7日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2022年9月28日	Group: Database references カテゴリ: citation / citation_author / pdbx_database_related Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year
改定 1.2	2023年10月18日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
改定 1.3	2024年10月30日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _pdbx_entry_details.has_protein_modification

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7tud.cif.gz	222.2 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7tud.ent.gz	145.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7tud.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	7tud_validation.pdf.gz	464.4 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	7tud_full_validation.pdf.gz	468.1 KB	表示
XML形式データ	7tud_validation.xml.gz	22.6 KB	表示
CIF形式データ	7tud_validation.cif.gz	34.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tu/7tud ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tu/7tud	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	7tucC 7tueC 7tufC 7tugC 7tuhC 1m6oS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#62 - 2005年2月主要組織適合性複合体 (Major Histocompatibility Complex) 類似性 (1) #63 - 2005年3月 T細胞受容体 (T-Cell Receptor) 類似性 (1)

登録構造単位

A: HLA class I histocompatibility antigen, B alpha chain

B: Beta-2-microglobulin

P: EEFGRC peptide

Q: GL dipeptide

ヘテロ分子

44.8 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	49.165, 79.757, 107.207
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁
Space group name Hall	P2ac2ab
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: x+1/2,-y+1/2,-z #3: -x,y+1/2,-z+1/2 #4: -x+1/2,-y,z+1/2

-
タンパク質 , 2種, 2分子 AB

#1: タンパク質	HLA class I histocompatibility antigen, B alpha chain 分子量: 31804.158 Da / 分子数: 1 / 変異: T73C / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: HLA-B44:05 / プラスミド: pET21b / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌)
#2: タンパク質	Beta-2-microglobulin 分子量: 11879.356 Da / 分子数: 1 / Fragment: UNP residues 21-119 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: B2M, CDABP0092, HDCMA22P / プラスミド: pET3a / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P61769

-
タンパク質・ペプチド , 2種, 2分子 PQ

#3: タンパク質・ペプチド	EEFGRC peptide 分子量: 740.805 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: Truncated synthetic peptide: 6mer / 由来: (組換発現) Synthetic construct (人工物) / 発現宿主: Synthetic construct (人工物)
#4: タンパク質・ペプチド	GL dipeptide 分子量: 188.225 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: Synthetic dipeptide: GL / 由来: (組換発現) Synthetic construct (人工物) / 発現宿主: Synthetic construct (人工物)

-
非ポリマー , 3種, 586分子

#5: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#6: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#7: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 583 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	N
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.36 Å³/Da / 溶媒含有率: 47.79 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 25% PEG 1500, 0.1M SPG (Succinic acid, Sodium phosphate monobasic monohydrate and Glycine) PH範囲: 6.5-9.0

-
データ収集

回折	平均測定温度: 273 K / Ambient temp details: LN blow / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 22-ID / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER2 X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2019年6月4日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.45→39.88 Å / Num. obs: 74712 / % possible obs: 98.96 % / 冗長度: 4.8 % / B_iso Wilson estimate: 18.31 Å² / CC_1/2: 0.998 / CC star: 0.999 / R_merge(I) obs: 0.0713 / R_pim(I) all: 0.0362 / R_rim(I) all: 0.0803 / Net I/σ(I): 11.6
反射シェル	解像度: 1.45→1.502 Å / 冗長度: 4.1 % / R_merge(I) obs: 0.9425 / Mean I/σ(I) obs: 1.11 / Num. unique obs: 7199 / CC_1/2: 0.553 / CC star: 0.844 / R_pim(I) all: 0.5093 / % possible all: 97.01

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.19.2_4158	精密化
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 1M6O

1m6o

解像度: 1.45→39.88 Å / SU ML: 0.1885 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.37 / 位相誤差: 22.1211
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.213	3735	5 %
R_work	0.1911	70977	-
obs	0.1923	74712	98.94 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 24.48 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.45→39.88 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3122	0	14	583	3719

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0087	3254
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.9266	4419
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0711	453
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.0068	584
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.1061	1219

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.45-1.47	0.3261	131	0.3056	2494	X-RAY DIFFRACTION	95.49
1.47-1.49	0.3304	134	0.2805	2544	X-RAY DIFFRACTION	96.5
1.49-1.51	0.2835	135	0.2795	2571	X-RAY DIFFRACTION	98.98
1.51-1.53	0.2833	137	0.2548	2601	X-RAY DIFFRACTION	98.45
1.53-1.55	0.249	135	0.2586	2558	X-RAY DIFFRACTION	98.28
1.55-1.58	0.3263	137	0.2762	2613	X-RAY DIFFRACTION	98.99
1.58-1.6	0.313	135	0.2863	2560	X-RAY DIFFRACTION	98.14
1.6-1.63	0.3209	138	0.2735	2626	X-RAY DIFFRACTION	99.46
1.63-1.66	0.2719	138	0.2719	2623	X-RAY DIFFRACTION	99.39
1.66-1.69	0.2722	137	0.2604	2593	X-RAY DIFFRACTION	98.52
1.69-1.73	0.307	136	0.2481	2596	X-RAY DIFFRACTION	99.35
1.73-1.76	0.265	139	0.2273	2628	X-RAY DIFFRACTION	98.75
1.76-1.8	0.2098	137	0.2238	2618	X-RAY DIFFRACTION	99.35
1.8-1.85	0.2584	138	0.2261	2606	X-RAY DIFFRACTION	99.46
1.85-1.9	0.249	138	0.222	2639	X-RAY DIFFRACTION	99.36
1.9-1.96	0.2522	139	0.2261	2624	X-RAY DIFFRACTION	99.46
1.96-2.02	0.2486	138	0.212	2628	X-RAY DIFFRACTION	99.57
2.02-2.09	0.2279	139	0.192	2642	X-RAY DIFFRACTION	99.36
2.09-2.17	0.2278	138	0.1969	2631	X-RAY DIFFRACTION	99.57
2.17-2.27	0.2104	139	0.1955	2642	X-RAY DIFFRACTION	99.25
2.27-2.39	0.2161	140	0.1917	2652	X-RAY DIFFRACTION	99.32
2.39-2.54	0.1951	140	0.1897	2660	X-RAY DIFFRACTION	98.9
2.54-2.74	0.2086	141	0.1852	2678	X-RAY DIFFRACTION	99.72
2.74-3.02	0.1666	141	0.1749	2670	X-RAY DIFFRACTION	99.61
3.02-3.45	0.1998	141	0.1601	2694	X-RAY DIFFRACTION	99.33
3.45-4.35	0.1603	143	0.1429	2720	X-RAY DIFFRACTION	99.55
4.35-39.88	0.172	151	0.1554	2866	X-RAY DIFFRACTION	99.21

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	5.16830887393	-3.72513148988	0.708085271784	3.98888387213	-0.437962208607	0.528023745465	0.0546957647628	0.0939841819459	-0.158011088386	-0.0754624904542	-0.0235096171229	0.14624145309	0.00617226160772	-0.0332156469021	-0.031191450911	0.161541900075	-0.0180186130528	0.00475890774741	0.154085461581	-0.0050729804915	0.147720675491	14.653	5.734	24.048
2	1.73208887731	0.147375418957	0.182911221376	0.794350779033	0.167982401603	0.328380332026	-0.0260156770571	0.148009477886	0.0940997157748	-0.0902280522091	0.0302167826219	-0.0252856731077	-0.0271875284699	0.0165164662165	-0.0054722005935	0.182410587892	0.00356422388477	0.00651256440838	0.172763578399	0.00653336733881	0.156475398668	24.481	15.87	23.644
3	0.213413495314	0.0955557541495	-0.651126425378	0.121379975756	0.245498126791	7.41244448744	0.0374876177446	-0.0655976575539	-0.0128864961344	0.0455691717189	0.0214988379556	0.0279128938228	-0.21315519304	-0.0538366975296	-0.0540756980171	0.180979974265	0.00170572143191	0.00383560057881	0.191656720526	-0.00094261441032	0.184155021124	0.147	15.178	49.871
4	2.07493870259	-1.7057012882	-3.15160127666	2.61255247411	1.1733836375	6.44681860677	-0.232579165544	-0.729154070796	-0.466564922351	-0.430078646776	-0.188011587941	-1.44810163506	-0.0461509836428	0.894992194825	0.435834735401	0.270763756419	0.0225737005333	0.0409026354711	0.293763561658	0.0806316685485	0.386907548835	26.226	4.857	43.339
5	4.23251157906	-0.621822495978	5.25733130816	1.19868690773	-0.318334330412	6.86205652686	-0.00866651546165	0.0500169504159	-0.323678313015	0.0206686831318	-0.0123412870194	0.0788001508355	-0.0116310399423	-0.0670921152724	-0.000288045582	0.202903334034	0.0159845571538	0.0304111751199	0.160447037604	0.0137642054073	0.199532920148	8.23	2.414	45.656
6	4.35990694785	5.34945067445	-2.45580979304	7.23976447887	-2.24973401561	4.12497819186	0.0795209134109	0.338029918949	0.16461975806	0.328121612524	0.160457112955	1.25430742705	0.172769343724	-0.829346200848	-0.202604829904	0.195741713706	-0.0438019841704	0.0410775227815	0.322386153244	0.0663398979382	0.469997238687	-6.326	-1.528	44.049
7	9.19121744481	5.831459287	-2.68866582239	5.25971097586	-1.10508421533	1.699367386	-0.243983385402	0.0688985782444	-0.205238958163	-0.144991802759	0.081706211236	-0.00773519189585	0.186771255541	-0.0407998967582	0.166259100025	0.22366803764	0.0130133419468	0.0111712020003	0.180723481752	0.026217534466	0.157820382103	11.901	-2.146	40.692
8	5.02547329417	2.63842347259	-3.29793735609	7.52588482287	1.17620089421	3.54146470112	-0.427302579529	0.0149019651758	-0.593573274848	-0.847718963709	0.0548264047232	-0.226236360431	1.36906886556	0.308966652781	0.33927542032	0.361678848496	0.0252974286751	0.0627666998174	0.199506563462	-0.0148653269472	0.373265777952	8.103	-11.362	39.393
9	6.53429651923	3.60814664912	2.51281635311	4.38030095694	-2.62178780592	7.69830212333	0.122457597048	-0.0124315650796	0.194587671501	-0.029413494664	-0.162475411613	0.237901117468	0.267608937168	-0.215353507258	0.0793369056164	0.183600661834	0.034470651361	0.0269370324812	0.156457382655	-0.0243881640576	0.159627349653	17.815	9.161	34.555
10	6.00894237522	5.13835032561	-4.33174931854	4.62566165407	-3.94932396569	4.14701818533	-0.298769376636	0.217145130457	-0.106691243359	-0.46070669982	0.26387524715	0.313885493839	0.328828323572	-0.192551076347	0.0239812349663	0.225276218066	-0.00454296693488	-0.00527878868583	0.15286386485	-0.0179348910946	0.264815176396	7.402	-1.682	37.723
11	4.59945253392	5.17445718947	-5.29124102774	5.82586714613	-5.96375691675	6.11466960877	-0.108302416253	-1.25939093	-1.04150227049	0.29402344465	0.487672538057	0.407446401222	0.476638951149	-0.760584193798	-0.482676271023	0.382798611267	-0.0353408538474	0.0420626128697	0.399007915491	0.0871044165765	0.472891027887	-2.6	-10.744	51.376
12	6.15002314601	3.74832695995	-2.8136992357	4.30016424487	-1.37220600592	1.40631905443	-0.138550660895	-0.438166864473	-0.577185329754	0.127356678318	-0.0987455311959	-0.190459152578	0.187405598235	0.187770999569	0.214819457139	0.268963649531	0.0484333368057	0.0339313463735	0.25793198281	0.102628716985	0.320369273664	17.862	-5.548	46.548
13	2.81537154161	-3.96214341067	-1.72024713551	6.51000501505	0.297096046017	6.12250291494	-0.316982483344	-0.54290157551	-0.470495921353	0.791468593136	0.00937960277124	0.254776223512	0.194498922966	-0.110508867215	0.264271409385	0.328299608978	-0.0292833103024	0.0651531165261	0.282586891175	0.0576264204796	0.251764330087	5.37	-2.016	51.398
14	6.57347079039	1.41374068785	0.955082769703	6.84500897566	0.979057268295	4.00987532679	-0.0152821335435	0.287437069132	0.15856226747	-0.214819089143	-0.0352418246443	-0.879937374105	0.0599542757851	0.135478876923	0.0264237123471	0.245623762814	-0.00645222618051	0.0206870079779	0.201358197558	0.0171759659019	0.264769640263	21.636	14.327	16.926

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN A AND RESID 1:56 )	A	1 - 56
2	X-RAY DIFFRACTION	2	( CHAIN A AND RESID 57:174 )	A	57 - 174
3	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN A AND RESID 175:274 )	A	175 - 274
4	X-RAY DIFFRACTION	4	( CHAIN B AND RESID 0:5 )	B	0 - 5
5	X-RAY DIFFRACTION	5	( CHAIN B AND RESID 6:11 )	B	6 - 11
6	X-RAY DIFFRACTION	6	( CHAIN B AND RESID 12:19 )	B	12 - 19
7	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN B AND RESID 20:41 )	B	20 - 41
8	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN B AND RESID 42:51 )	B	42 - 51
9	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN B AND RESID 52:61 )	B	52 - 61
10	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN B AND RESID 62:71 )	B	62 - 71
11	X-RAY DIFFRACTION	11	( CHAIN B AND RESID 72:77 )	B	72 - 77
12	X-RAY DIFFRACTION	12	( CHAIN B AND RESID 78:90 )	B	78 - 90
13	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN B AND RESID 91:99 )	B	91 - 99
14	X-RAY DIFFRACTION	14	( CHAIN P AND RESID 1:6 )	P	1 - 6

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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