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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7r22 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of protein Mab3862 from Mycobacterium abscessus | ||||||
![]() | ArsR family transcriptional regulator | ||||||
![]() | ANTITOXIN / toxin / Mycobacterium abscessus.putative ArsR family transcriptional regulator | ||||||
機能・相同性 | ArsR-type HTH domain profile. / helix_turn_helix, Arsenical Resistance Operon Repressor / HTH ArsR-type DNA-binding domain / ArsR-like helix-turn-helix domain / Winged helix DNA-binding domain superfamily / DNA-binding transcription factor activity / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / ArsR family transcriptional regulator![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Kim, S.Y. / Eun, H.J. / Lee, J.Y. / Lee, B.J. / Blundell, T.L. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of putative ArsR family regulator antitoxin from Mycobacterium abscessus (MAB_3862) 著者: Kim, S.Y. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 31.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 22.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16797.391 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: D2E76_02065 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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研究の焦点であるリガンドがあるか | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.47 Å3/Da / 溶媒含有率: 72.46 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: batch mode / 詳細: Sodium acetate pH 5.0 50mM Ammonium sulphate 2.0M |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS EIGER2 XE 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2021年12月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.9795 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.73→75.88 Å / Num. obs: 5863 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 20 % / CC1/2: 1 / Rmerge(I) obs: 0.125 / Net I/σ(I): 26.8 |
反射 シェル | 解像度: 2.73→2.78 Å / Num. unique obs: 296 / CC1/2: 0.5 / % possible all: 100 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.73→47.8 Å
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拘束条件 |
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