PDB-7k14: Ternary soak structure of alkanesulfonate monooxygenase MsuD from...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7k14

タイトル

Ternary soak structure of alkanesulfonate monooxygenase MsuD from Pseudomonas fluorescens with FMN and methanesulfonate

要素

Alkanesulfonate monooxygenase

キーワード

FLAVOPROTEIN / OXIDOREDUCTASE / TIM barrel / flavin monooxygenase

機能・相同性

機能・相同性情報

alkanesulfonate monooxygenase / alkanesulfonate monooxygenase activity / nucleotide binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Pseudomonas fluorescens (蛍光菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.75 Å

データ登録者

Liew, J.J.M. / Dowling, D.P. / El Saudi, I.M.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2021
タイトル: Structures of the alkanesulfonate monooxygenase MsuD provide insight into C-S bond cleavage, substrate scope, and an unexpected role for the tetramer.
著者: Liew, J.J.M. / El Saudi, I.M. / Nguyen, S.V. / Wicht, D.K. / Dowling, D.P.

履歴

登録	2020年9月7日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2021年5月26日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2021年6月9日	Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.page_first / _citation.page_last ..._citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title
改定 1.2	2021年7月7日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author / Item: _citation.journal_volume / _citation_author.name
改定 1.3	2023年10月18日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	7k14_validation.pdf.gz	2.3 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	7k14_full_validation.pdf.gz	2.4 MB	表示
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アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k1/7k14 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k1/7k14	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	7jv3SC 7jw9C 7jybC 7k64C C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	7jyb-1 7jyb-2 7jw9-d 7k14-2 7k64-1 7k64-2 3c6c-1 4tsk-1 7jv3-2 3mv4-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#78 - 2006年6月ルシフェラーゼ (Luciferase) 類似性 (3)

登録構造単位

A: Alkanesulfonate monooxygenase

B: Alkanesulfonate monooxygenase

C: Alkanesulfonate monooxygenase

D: Alkanesulfonate monooxygenase

E: Alkanesulfonate monooxygenase

F: Alkanesulfonate monooxygenase

G: Alkanesulfonate monooxygenase

H: Alkanesulfonate monooxygenase

ヘテロ分子

358 kDa, 8 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Alkanesulfonate monooxygenase

B: Alkanesulfonate monooxygenase

C: Alkanesulfonate monooxygenase

D: Alkanesulfonate monooxygenase

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration, Size exclusion chromatography
179 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

E: Alkanesulfonate monooxygenase

F: Alkanesulfonate monooxygenase

G: Alkanesulfonate monooxygenase

H: Alkanesulfonate monooxygenase

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
179 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	94.000, 211.930, 94.350
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 119.049, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1
Space group name Hall	P2yb
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: -x,y+1/2,-z

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
d_1	ens_1	(chain "A" and (resid 0 through 68 or (resid 69...
d_2	ens_1	(chain "B" and (resid 0 through 68 or (resid 69...
d_3	ens_1	(chain "C" and (resid 0 through 68 or (resid 69...
d_4	ens_1	(chain "D" and (resid 0 through 76 or resid 78...
d_5	ens_1	(chain "E" and (resid 0 through 68 or (resid 69...
d_6	ens_1	(chain "F" and (resid 0 through 68 or (resid 69...
d_7	ens_1	(chain "G" and (resid 0 through 68 or (resid 69...
d_8	ens_1	(chain "H" and (resid 0 through 68 or (resid 69...

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Beg label comp-ID	End label comp-ID	Label asym-ID	Label seq-ID
d_1	1	ens_1	SER	ILE	A	1 - 77
d_1	2	ens_1	PRO	VAL	A	79 - 210
d_1	3	ens_1	GLU	LEU	A	212 - 227
d_1	4	ens_1	VAL	HIS	A	229 - 248
d_1	5	ens_1	ASN	ARG	A	282 - 297
d_1	6	ens_1	THR	ALA	A	302 - 356
d_2	1	ens_1	SER	ILE	D	1 - 77
d_2	2	ens_1	PRO	VAL	D	79 - 210
d_2	3	ens_1	GLU	LEU	D	212 - 227
d_2	4	ens_1	VAL	HIS	D	231 - 250
d_2	5	ens_1	ASN	ARG	D	282 - 297
d_2	6	ens_1	THR	ALA	D	302 - 356
d_3	1	ens_1	SER	ILE	G	1 - 77
d_3	2	ens_1	PRO	VAL	G	79 - 210
d_3	3	ens_1	GLU	LEU	G	212 - 227
d_3	4	ens_1	VAL	HIS	G	229 - 248
d_3	5	ens_1	ASN	ARG	G	282 - 297
d_3	6	ens_1	THR	ALA	G	302 - 356
d_4	1	ens_1	SER	ILE	J	1 - 77
d_4	2	ens_1	PRO	VAL	J	79 - 210
d_4	3	ens_1	GLU	LEU	J	212 - 227
d_4	4	ens_1	VAL	HIS	J	229 - 248
d_4	5	ens_1	ASN	ARG	J	282 - 297
d_4	6	ens_1	THR	ALA	J	302 - 356
d_5	1	ens_1	SER	ILE	M	1 - 77
d_5	2	ens_1	PRO	VAL	M	79 - 210
d_5	3	ens_1	GLU	LEU	M	214 - 229
d_5	4	ens_1	VAL	HIS	M	231 - 250
d_5	5	ens_1	ASN	ARG	M	284 - 299
d_5	6	ens_1	THR	ALA	M	304 - 358
d_6	1	ens_1	SER	ILE	P	1 - 77
d_6	2	ens_1	PRO	VAL	P	79 - 210
d_6	3	ens_1	GLU	LEU	P	212 - 227
d_6	4	ens_1	VAL	HIS	P	229 - 248
d_6	5	ens_1	ASN	ARG	P	250 - 265
d_6	6	ens_1	THR	ALA	P	267 - 321
d_7	1	ens_1	SER	ILE	R	1 - 77
d_7	2	ens_1	PRO	VAL	R	79 - 210
d_7	3	ens_1	GLU	LEU	R	212 - 227
d_7	4	ens_1	VAL	HIS	R	229 - 248
d_7	5	ens_1	ASN	ARG	R	272 - 287
d_7	6	ens_1	THR	ALA	R	292 - 346
d_8	1	ens_1	SER	ILE	U	1 - 77
d_8	2	ens_1	PRO	VAL	U	79 - 210
d_8	3	ens_1	GLU	LEU	U	212 - 227
d_8	4	ens_1	VAL	HIS	U	229 - 248
d_8	5	ens_1	ASN	ARG	U	260 - 275
d_8	6	ens_1	THR	ALA	U	280 - 334

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(0.278812456974, -0.166111599817, 0.945870260788), (-0.175807348319, -0.977110835639, -0.119775586636), (0.944116195239, -0.132896016807, -0.301634312709)	-84.726298116, -10.9892337571, 112.548462097
2	given	(-0.965818742186, 0.259196109048, -0.00339621787935), (0.259149863783, 0.965781832891, 0.0103343775516), (0.00595863597921, 0.00910100612732, -0.999940831422)	-174.696422091, 22.745888813, 44.5787219671
3	given	(-0.316660862118, -0.0867507548693, -0.944563499682), (-0.0955078787116, -0.987832141791, 0.122743247262), (-0.943718254304, 0.12908123866, 0.304522397073)	-95.9475070793, -9.2971507818, -68.5950413238
4	given	(-0.903523579269, 0.327403577184, -0.276499619082), (-0.333923805513, -0.942279412936, -0.0245845493912), (-0.268588968159, 0.0701170849661, 0.960699516279)	-121.059275573, -77.6495749845, -65.6552462407
5	given	(-0.565524761802, -0.128687982671, -0.814629453742), (0.0742308478648, 0.975799907358, -0.205680144949), (0.821383908421, -0.176787850027, -0.542286392111)	-78.6902281022, -39.0595756196, 64.79228839
6	given	(0.956312785147, 0.0765380038146, 0.282148526376), (0.0748449359038, -0.997053821803, 0.0167902351612), (0.282602357622, 0.00506067182167, -0.95922379926)	31.8250028028, -42.259737987, 26.0702928916
7	given	(0.507943674867, -0.27347006175, 0.816827612467), (0.215103243558, 0.958493706615, 0.18713740671), (-0.834100604108, 0.0806470068001, 0.545685112973)	-19.5670534139, -35.4767446698, -106.681365666

-
タンパク質 , 1種, 8分子 ABCDEFGH

#1: タンパク質	Alkanesulfonate monooxygenase / FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase / flavin-dependent methanesulfonate monooxygenase 分子量: 44278.887 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Pseudomonas fluorescens (蛍光菌) / 株: Pf0-1 / 遺伝子: msuD, ssuD, Pfl01_3916 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q3K9A1, alkanesulfonate monooxygenase

#1: タンパク質

Alkanesulfonate monooxygenase / FMNH2-dependent aliphatic sulfonate monooxygenase / flavin-dependent methanesulfonate monooxygenase

分子量: 44278.887 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Pseudomonas fluorescens (蛍光菌) / 株: Pf0-1 / 遺伝子: msuD, ssuD, Pfl01_3916 / 発現宿主:

Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q3K9A1, alkanesulfonate monooxygenase

-
非ポリマー , 5種, 31分子

#2: 化合物	ChemComp-FMN / FLAVIN MONONUCLEOTIDE / RIBOFLAVIN MONOPHOSPHATE / FMN 分子量: 456.344 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₇H₂₁N₄O₉P / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#3: 化合物	ChemComp-03S / methanesulfonic acid / メタンスルホン酸分子量: 96.106 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: CH₄O₃S
#4: 化合物	ChemComp-PO4 / PHOSPHATE ION / ホスファ-ト分子量: 94.971 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: PO₄
#5: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 16 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.32 Å³/Da / 溶媒含有率: 47 %
結晶化	温度: 291.15 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7 / 詳細: PEG 3350, sodium succinate

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 24-ID-C / 波長: 0.97949 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS 6M-F / 検出器: PIXEL / 日付: 2020年2月28日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.97949 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.75→82.21 Å / Num. obs: 82800 / % possible obs: 99.1 % / 冗長度: 5.8 % / B_iso Wilson estimate: 81.98 Å² / CC_1/2: 0.998 / R_merge(I) obs: 0.083 / R_pim(I) all: 0.037 / R_rim(I) all: 0.091 / Net I/σ(I): 11.7

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	Num. unique obs	CC_1/2	Diffraction-ID	% possible all
2.75-2.82	5.9	5987	0.7	1	97
2.82-2.9	5.82	5989	0.788	1	99.1
2.9-2.98	5.88	5788	0.862	1
2.98-3.07	5.44	5533	0.901	1
3.07-3.18	6.21	5489	0.951	1
3.18-3.29	6.19	5293	0.967	1
3.29-3.41	6.31	5109	0.981	1
3.41-3.55	6.15	4937	0.985	1
3.55-3.71	5.81	4732	0.989	1
3.71-3.89	5.96	4515	0.993	1
3.89-4.1	5.71	4318	0.993	1
4.1-4.35	5.31	4054	0.994	1
4.35-4.65	5.21	3759	0.995	1
4.65-5.02	5.94	3572	0.995	1
5.02-5.5	5.8	3277	0.996	1
5.5-6.15	5.96	2962	0.996	1
6.15-7.1	5.63	2618	0.996	1
7.1-8.7	5.2	2199	0.998	1
8.7-12.3	5.58	1706	0.998	1
12.3-82.21		962	0.997	1	98.2

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.18.2	精密化
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 7JV3

7jv3

解像度: 2.75→81.16 Å / SU ML: 0.4162 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.37 / 位相誤差: 23.0733
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
詳細: Rfree test set was transferred from 7JV3 (unliganded MsuD) due to similar unit cell values

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2144	4123	4.98 %
R_work	0.1715	78662	-
obs	0.1736	82785	99.11 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 91.63 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.75→81.16 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	21497	0	249	16	21762

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0057	22302
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.7618	30416
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0691	3320
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.0057	4138
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	15.5094	7912

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
ens_1	d_2	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.322438970378
ens_1	d_3	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.310806008188
ens_1	d_4	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.344502341863
ens_1	d_5	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.270331764649
ens_1	d_6	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.431809611925
ens_1	d_7	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.327846889046
ens_1	d_8	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.366501060535

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.75-2.78	0.3434	130	0.316	2571	X-RAY DIFFRACTION	94.54
2.78-2.82	0.3296	149	0.2969	2686	X-RAY DIFFRACTION	99.58
2.82-2.85	0.3719	133	0.3007	2776	X-RAY DIFFRACTION	99.66
2.85-2.89	0.3465	152	0.2744	2686	X-RAY DIFFRACTION	99.3
2.89-2.93	0.2899	143	0.261	2685	X-RAY DIFFRACTION	99.3
2.93-2.97	0.2538	138	0.2445	2726	X-RAY DIFFRACTION	99.03
2.97-3.02	0.2846	141	0.2411	2702	X-RAY DIFFRACTION	98.68
3.02-3.06	0.3073	135	0.2426	2624	X-RAY DIFFRACTION	96.5
3.06-3.11	0.2942	149	0.2245	2698	X-RAY DIFFRACTION	99.55
3.11-3.17	0.2857	145	0.221	2736	X-RAY DIFFRACTION	99.62
3.17-3.22	0.2469	135	0.2148	2744	X-RAY DIFFRACTION	99.58
3.22-3.29	0.258	135	0.2181	2710	X-RAY DIFFRACTION	99.51
3.29-3.35	0.2413	156	0.2046	2724	X-RAY DIFFRACTION	99.55
3.35-3.43	0.2543	131	0.2006	2707	X-RAY DIFFRACTION	99.51
3.43-3.51	0.2332	148	0.1995	2729	X-RAY DIFFRACTION	99.76
3.51-3.59	0.2426	140	0.1948	2722	X-RAY DIFFRACTION	99.9
3.59-3.69	0.2133	151	0.1766	2739	X-RAY DIFFRACTION	99.9
3.69-3.8	0.2236	134	0.1684	2742	X-RAY DIFFRACTION	99.65
3.8-3.92	0.1992	154	0.1604	2725	X-RAY DIFFRACTION	99.72
3.92-4.06	0.2074	134	0.1587	2727	X-RAY DIFFRACTION	99.76
4.06-4.22	0.1815	140	0.1543	2692	X-RAY DIFFRACTION	98.95
4.22-4.42	0.1768	149	0.1406	2686	X-RAY DIFFRACTION	98.68
4.42-4.65	0.1858	145	0.1364	2708	X-RAY DIFFRACTION	98.18
4.65-4.94	0.1825	139	0.1384	2755	X-RAY DIFFRACTION	99.9
4.94-5.32	0.1868	148	0.1379	2704	X-RAY DIFFRACTION	99.62
5.32-5.86	0.2001	142	0.1522	2757	X-RAY DIFFRACTION	99.62
5.86-6.7	0.1939	143	0.1626	2730	X-RAY DIFFRACTION	99.52
6.7-8.45	0.1923	143	0.1569	2713	X-RAY DIFFRACTION	98.65
8.45-81.16	0.208	141	0.1606	2758	X-RAY DIFFRACTION	98.54

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.48853984345	-0.567993578836	0.833014195497	1.528429083	-0.102613207069	2.25078635773	0.0163649442002	0.614043895539	0.162436832207	-0.0721748427104	-0.336674408158	-0.453997913697	-0.0933593094068	1.04944681775	0.182885497315	0.561795638379	-0.0484952956973	0.107406369997	0.949822293225	0.179445133338	0.745172376666	30.0692574376	-11.0089395635	20.4788710696
2	3.50382071335	0.0739434156007	0.70069063557	1.68987646176	0.579097778864	2.34583139643	0.10467673062	-0.538689425116	0.140594806151	0.452010913492	-0.295325313481	-0.0745722524513	-0.293091752336	-0.0406779577718	0.194581656887	1.03075917553	-0.173720846207	-0.0213709823457	0.530739747076	0.00395269221595	0.628761256739	13.0434499263	8.79394156622	47.1725468458
3	1.61541611092	0.470112459659	0.072655849589	0.956541426555	0.0966436234797	3.2274954349	-0.0250323367435	-0.298039729458	0.295342713222	0.102611267003	-0.130207938865	0.331970921731	-0.261250008438	-0.829006772033	0.14373042984	0.659496115931	0.0511314696774	0.101789001899	0.681741018385	-0.11957040566	0.734364500989	-21.8617223188	-4.16544019723	23.3888865604
4	3.34569749684	-0.927770463258	1.01340903979	1.87894550916	-0.843404972854	2.8571802926	-0.108528003846	0.701951449389	0.271675830907	-0.298727289279	-0.330522712269	-0.123933835414	-0.484511516432	0.385484223982	0.314689104417	0.841265418979	-0.0469150853831	-0.0168801291902	0.531213052794	0.0979558432142	0.557622592333	-0.273238027145	10.5809320427	-3.24732873364
5	1.16585610758	0.349843473353	-0.0801752331945	1.18109952035	0.10501425849	2.56773298573	0.126817082748	-0.177267131999	-0.0684029916491	0.160400876756	-0.160968414343	-0.248737733636	0.0197046045861	0.333734905567	0.0383936627828	0.581629804266	-0.0330163690156	-0.0493227429621	0.486353205948	0.0367007039312	0.629137213256	-24.1924417261	-35.5448084532	-12.3617792906
6	4.02493646772	0.0969042747167	-0.0776963126831	1.80485380263	0.587732773172	2.87574290419	0.094883565637	0.404358701523	-0.208167065449	-0.251812012983	-0.15078731032	-0.0577656137024	0.222867656082	0.00894706102496	0.0507449636488	0.728175912316	0.103166254008	-0.00816984295891	0.441274545766	0.00405088716102	0.661920181793	-31.8786666542	-57.3667850478	-40.5437449318
7	2.2157380538	-0.138876872161	-0.639359063276	1.55748722728	-0.307677728578	2.96438234272	0.241180963754	0.552522491762	0.0119251540927	-0.0751746313667	0.108317147874	0.75810531965	0.0287924609855	-1.20028326914	-0.254367691981	0.560582693765	0.0464625795579	-0.051978002854	1.07663181747	0.150118037831	1.09186804681	-72.3511735944	-46.0838361047	-28.8323648771
8	2.46297863173	0.602011002325	-0.0497368908143	2.31758070577	-0.725908520148	2.83590237218	0.239428980201	-0.31639284875	0.108289564848	0.393652552347	-0.164367721671	0.195539883148	0.0510940391737	-0.214966042332	-0.0840962552309	0.770297878389	-0.166894784351	0.0255012596963	0.524229124725	0.0573201684235	0.591671508186	-56.3785441542	-60.3116291336	1.08209428429

精密化 TLSグループ

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Label seq-ID: 1

ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID
1	1	chain 'A'	A	A - C	0 - 501
2	2	chain 'B'	B	D - F	0 - 501
3	3	chain 'C'	C	G - I	0 - 501
4	4	chain 'D'	D	J - L	0 - 501
5	5	chain 'E'	E	M - O	0 - 501
6	6	chain 'F'	F	P - Q	0 - 401
7	7	chain 'G'	G	R - T	0 - 501
8	8	chain 'H'	H	U - W	0 - 501

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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