登録情報 | データベース: PDB / ID: 7f5j |
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タイトル | The crystal structure of VyPAL2-I244V, a more efficient mutant of VyPAL2 peptide asparaginyl ligase in its active enzyme form |
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要素 | Peptide Asparaginyl Ligases |
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キーワード | PLANT PROTEIN / AEP / Legumain / Peptide ligase / PAL |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
vacuolar protein processing / proteolysis involved in protein catabolic process / cysteine-type endopeptidase activity類似検索 - 分子機能 : / Legumain, prodomain / Legumain prodomain superfamily / Asparaginyl endopeptidase / Peptidase C13, legumain / Peptidase C13 family類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Viola philippica (タイワンスミレ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.593 Å |
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データ登録者 | Hu, S. / Sahili, A. / Lescar, J. |
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資金援助 | シンガポール, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Ministry of Education (MoE, Singapore) | MOE2016-T3-1-003 | シンガポール |
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引用 | ジャーナル: Plant Cell / 年: 2022 タイトル: Structural basis for proenzyme maturation, substrate recognition, and ligation by a hyperactive peptide asparaginyl ligase. 著者: Hu, S. / El Sahili, A. / Kishore, S. / Wong, Y.H. / Hemu, X. / Goh, B.C. / Zhipei, S. / Wang, Z. / Tam, J.P. / Liu, C.F. / Lescar, J. |
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履歴 | 登録 | 2021年6月22日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2022年6月29日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2022年11月30日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year |
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改定 1.2 | 2022年12月14日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.name |
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改定 2.0 | 2023年11月15日 | Group: Atomic model / Data collection カテゴリ: atom_site / atom_site_anisotrop ...atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_validate_main_chain_plane / pdbx_validate_peptide_omega / pdbx_validate_rmsd_angle Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_atom_id / _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation / _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation / _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value / _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value / _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 / _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 / _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 / _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 / _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 / _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 |
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改定 2.1 | 2023年11月29日 | Group: Refinement description / カテゴリ: pdbx_initial_refinement_model |
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改定 2.2 | 2024年5月1日 | Group: Structure summary / カテゴリ: struct / Item: _struct.title |
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