#241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (1)
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集合体
登録構造単位
A: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*GP*CP*CP*GP*GP*GP*GP*CP*C)-3') B: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*GP*CP*CP*GP*GP*GP*GP*CP*C)-3') C: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*GP*CP*CP*GP*GP*GP*GP*CP*C)-3') D: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*GP*CP*CP*GP*GP*GP*GP*CP*C)-3') E: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*GP*CP*CP*GP*GP*GP*GP*CP*C)-3') F: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*GP*CP*CP*GP*GP*GP*GP*CP*C)-3') ヘテロ分子
マシュー密度: 2.11 Å3/Da / 溶媒含有率: 41.74 % 解説: THE ENTRY CONTAINS FRIEDEL PAIRS IN I/F_PLUS/MINUS COLUMNS. Mosaicity: 0.465 °
結晶化
温度: 289 K / 手法: 蒸発脱水法 / pH: 7 詳細: 40 mM Sodium Cacodylate trihydrate pH 7.0, 10% MPD, 12 mM spermine tetrahydrochloride, 80 mM NaCl and 20 mM BaCl2 with the reservoir buffer of 17.5% MPD
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.6→38.84 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.98 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.977 / SU B: 3.067 / SU ML: 0.045 / SU R Cruickshank DPI: 0.0919 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.092 / ESU R Free: 0.072 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : REFINED INDIVIDUALLY
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.1713
1288
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.1409
-
-
-
obs
0.1426
24134
99.05 %
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溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK