登録情報 | データベース: PDB / ID: 7.0E+37 |
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タイトル | Crystal structure of deoxypodophyllotoxin synthase from Sinopodophyllum hexandrum in complex with 2-oxoglutarate |
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要素 | Deoxypodophyllotoxin synthase |
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キーワード | BIOSYNTHETIC PROTEIN / non-heme iron/2-oxoglutarate enzyme beta-helix fold deoxypodophyllotoxin biosynthesis carbon-carbon bond formation |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
(-)-deoxypodophyllotoxin synthase / phenylpropanoid biosynthetic process / : / 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity / response to wounding / metal ion binding類似検索 - 分子機能 : / Non-haem dioxygenase N-terminal domain / non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal / Isopenicillin N synthase-like, Fe(2+) 2OG dioxygenase domain / 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily / Isopenicillin N synthase-like superfamily / Oxoglutarate/iron-dependent dioxygenase / Fe(2+) 2-oxoglutarate dioxygenase domain profile.類似検索 - ドメイン・相同性 2-OXOGLUTARIC ACID / : / Deoxypodophyllotoxin synthase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Sinopodophyllum hexandrum (植物) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.09 Å |
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データ登録者 | Wu, M.-H. / Lin, H.-Y. / Chang, W.-c. / Chien, T.-C. / Chan, N.-L. |
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資金援助 | 台湾, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Ministry of Science and Technology (MoST, Taiwan) | 109-2811-M-002 -649 - | 台湾 | Ministry of Science and Technology (MoST, Taiwan) | 109-2326-B-002 -008 - | 台湾 |
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引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2022 タイトル: Mechanistic analysis of carbon-carbon bond formation by deoxypodophyllotoxin synthase. 著者: Tang, H. / Wu, M.H. / Lin, H.Y. / Han, M.R. / Tu, Y.H. / Yang, Z.J. / Chien, T.C. / Chan, N.L. / Chang, W.C. |
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履歴 | 登録 | 2021年2月8日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2021年12月15日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2022年1月12日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year |
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改定 1.2 | 2023年11月29日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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