PDB-7c8o: Crystal structure of IscU D40A/H106A variant

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7c8o

タイトル

Crystal structure of IscU D40A/H106A variant

要素

Nitrogen-fixing NifU domain protein

キーワード

BIOSYNTHETIC PROTEIN / Iron-sulfur cluster biogenesis

機能・相同性

NIF system FeS cluster assembly, NifU-like / NIF system FeS cluster assembly, NifU, N-terminal / NifU-like N terminal domain / iron-sulfur cluster assembly / ferrous iron binding / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / intracellular iron ion homeostasis / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / Nitrogen-fixing NifU domain protein

機能・相同性情報

生物種

Methanothrix thermoacetophila (古細菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.84 Å

データ登録者

Kunichika, K. / Takahashi, Y. / Fujishiro, T.

資金援助

日本, 1件

引用

ジャーナル: to be published
タイトル: [2Fe-2S] clusters-assembled dimeric structures of IscU iron-sulfur scaffold
著者: Kunichika, K. / Fujishiro, T. / Takahashi, Y.

履歴

登録	2020年6月3日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2021年6月9日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年11月29日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / refine_hist / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _refine_hist.d_res_low / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7c8o.cif.gz	193.3 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7c8o.ent.gz	154.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7c8o.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	7c8o_validation.pdf.gz	472.4 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	7c8o_full_validation.pdf.gz	475.9 KB	表示
XML形式データ	7c8o_validation.xml.gz	20.3 KB	表示
CIF形式データ	7c8o_validation.cif.gz	28.5 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/c8/7c8o ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/c8/7c8o	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	7cnvC 2z7eS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	1tqp-d 7c8o-2 6h3z-1 1vrs-3 3zg1-1 2guk-d 1ynm-d 3on2-4 2j43-2 6jb2-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#117 - 2009年9月キサンチン酸化還元酵素 (Xanthine Oxidoreductase) 類似性 (1) #137 - 2011年5月シトクロムbc1 (Cytochrome bc1) 類似性 (1) #144 - 2011年12月複合体I (Complex I) 類似性 (1) #111 - 2009年3月ヒドロゲナーゼ (Hydrogenase) 類似性 (1) #154 - 2012年10月クエン酸回路 (Citric Acid Cycle) 類似性 (1) #36 - 2002年12月シトクロムc (Cytochrome c) 類似性 (1) #82 - 2006年10月シトクロムp450 (Cytochrome p450) 類似性 (1) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#117 - 2009年9月
キサンチン酸化還元酵素 (Xanthine Oxidoreductase)
類似性 (1)
#137 - 2011年5月
シトクロムbc1 (Cytochrome bc1)
類似性 (1)
#144 - 2011年12月
複合体I (Complex I)
類似性 (1)
#111 - 2009年3月
ヒドロゲナーゼ (Hydrogenase)
類似性 (1)
#154 - 2012年10月
クエン酸回路 (Citric Acid Cycle)
類似性 (1)
#36 - 2002年12月
シトクロムc (Cytochrome c)
類似性 (1)
#82 - 2006年10月
シトクロムp450 (Cytochrome p450)
類似性 (1)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Nitrogen-fixing NifU domain protein

B: Nitrogen-fixing NifU domain protein

C: Nitrogen-fixing NifU domain protein

D: Nitrogen-fixing NifU domain protein

ヘテロ分子

61 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Nitrogen-fixing NifU domain protein

D: Nitrogen-fixing NifU domain protein

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration
30.5 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

B: Nitrogen-fixing NifU domain protein

C: Nitrogen-fixing NifU domain protein

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
30.5 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	120.678, 60.376, 64.562
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 95.780, 90.000
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
1	2	A
2	2	C
1	3	A
2	3	D
1	4	B
2	4	C
1	5	B
2	5	D
1	6	C
2	6	D

NCSドメイン領域:

Component-ID: _ / Refine code: _

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	LYS	LYS	SER	SER	A	A	10 - 124	10 - 124
2	1	LYS	LYS	SER	SER	B	B	10 - 124	10 - 124
1	2	SER	SER	SER	SER	A	A	8 - 124	8 - 124
2	2	SER	SER	SER	SER	C	C	8 - 124	8 - 124
1	3	PHE	PHE	SER	SER	A	A	15 - 124	15 - 124
2	3	PHE	PHE	SER	SER	D	D	15 - 124	15 - 124
1	4	LYS	LYS	SER	SER	B	B	10 - 124	10 - 124
2	4	LYS	LYS	SER	SER	C	C	10 - 124	10 - 124
1	5	PHE	PHE	LYS	LYS	B	B	15 - 125	15 - 125
2	5	PHE	PHE	LYS	LYS	D	D	15 - 125	15 - 125
1	6	PHE	PHE	SER	SER	C	C	15 - 124	15 - 124
2	6	PHE	PHE	SER	SER	D	D	15 - 124	15 - 124

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3
4
5
6

#1: タンパク質	Nitrogen-fixing NifU domain protein / IscU 分子量: 15153.384 Da / 分子数: 4 / 変異: D40A, H106A / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Methanothrix thermoacetophila (古細菌) 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / Variant (発現宿主): C41 / 参照: UniProt: A0B757
#2: 化合物	ChemComp-FES / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER 分子量: 175.820 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe₂S₂
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 187 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 1.93 Å³/Da / 溶媒含有率: 36.28 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.3 / 詳細: 0.2 M Potassium iodide, 20 % (w/v) PEG 3350

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Photon Factory / ビームライン: BL-17A / 波長: 0.98 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2020年2月7日
放射	モノクロメーター: Numerical link type Si(111) double crystal monochromator, liquid nitrogen cooling プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.98 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.84→42.26 Å / Num. obs: 40163 / % possible obs: 99.81 % / 冗長度: 3.469 % / B_iso Wilson estimate: 36.288 Å² / CC_1/2: 0.998 / CC star: 0.999 / R_merge(I) obs: 0.09137 / R_pim(I) all: 0.03835 / R_rim(I) all: 0.09928 / Χ²: 0.982 / Net I/σ(I): 13.08 / Num. measured all: 271483 / Scaling rejects: 65
反射シェル	解像度: 1.84→1.86 Å / 冗長度: 3.602 % / R_merge(I) obs: 0.9103 / Mean I/σ(I) obs: 3.53 / Num. possible: 2428 / Num. unique obs: 3984 / CC_1/2: 0.866 / CC star: 0.963 / R_pim(I) all: 0.368 / R_rim(I) all: 0.9831 / % possible all: 99.95

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XSCALE		データスケーリング
REFMAC	5.8.0258	精密化
PDB_EXTRACT	3.25	データ抽出
XDS		データ削減
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 2Z7E

2z7e

解像度: 1.84→42.26 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.958 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.952 / SU B: 5.978 / SU ML: 0.102 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.148 / ESU R Free: 0.133 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: U VALUES : WITH TLS ADDED

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2225	2008	5 %	RANDOM
R_work	0.1937	-	-	-
obs	0.2008	40156	99.82 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso max: 103.98 Å² / B_iso mean: 39.939 Å² / B_iso min: 9.43 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.01 Å²	0 Å²	0.01 Å²
2-	-	0 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.01 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.84→42.26 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3497	0	8	187	3692
B_iso mean	-	-	22.78	39.89	-
残基数	-	-	-	-	467

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.012	0.012	3563
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	2.135	1.634	4777
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.757	5	463
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	36.185	23.293	167
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	16.913	15	644
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	20.817	15	20
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.129	0.2	478
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.011	0.02	2658

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: interatomic distance / Weight position: 0.05

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	2914	0.22
1	2	B	2914	0.22
2	1	A	3358	0.15
2	2	C	3358	0.15
3	1	A	2865	0.2
3	2	D	2865	0.2
4	1	B	2939	0.21
4	2	C	2939	0.21
5	1	B	3046	0.15
5	2	D	3046	0.15
6	1	C	2868	0.2
6	2	D	2868	0.2

LS精密化シェル

解像度: 1.84→1.906 Å / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2836	200	-
R_work	0.2499	2790	-
all	-	3983	-
obs	-	-	99.97 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.4779	-1.1962	-2.9781	2.8947	-1.9375	8.5236	-0.0281	-0.0207	-0.4472	0.0598	0.2298	0.7355	-0.0479	-0.2366	-0.2017	0.0628	0.0215	-0.0467	0.1804	0.0404	0.2601	-28.107	-13.3412	8.8323
2	1.4853	-0.9844	3.2126	1.4437	-1.9143	7.0668	0.059	0.0756	0.0652	-0.1815	-0.1517	-0.0253	0.0177	0.0955	0.0927	0.1837	0.0688	-0.0225	0.2061	0.0542	0.1495	-15.1973	-9.8794	-0.0265
3	1.0073	-1.3303	0.6571	2.1495	-1.4047	2.4675	-0.0508	0.1098	0.003	-0.0968	-0.1489	0.2357	0.1446	-0.0478	0.1997	0.0764	0.0205	-0.1157	0.1704	-0.0212	0.3641	-22.5329	-9.5855	3.3355
4	0.2563	-1.2488	-1.2728	6.935	5.2936	9.0915	0.0895	0.0481	-0.0033	-0.1035	-0.165	0.4254	-0.7675	-0.0989	0.0756	0.2487	0.0387	-0.0298	0.0373	0.0605	0.4387	-23.1777	2.0896	2.1499
5	3.794	2.2886	-0.9738	12.9293	-2.2118	0.481	-0.2851	-0.6124	0.0851	-0.4518	0.2785	-0.0025	0.1066	0.0634	0.0066	0.1528	0.0821	-0.0222	0.1751	-0.0256	0.1792	-25.7768	-0.868	14.9594
6	0.3212	-0.2726	1.1333	0.5698	-1.2023	7.1937	-0.001	0.1242	0.1849	0.0023	-0.1398	0.069	-0.0252	0.3701	0.1408	0.1705	0.0217	-0.0405	0.1092	0.061	0.3098	-14.6608	-3.5579	4.7772
7	0.9595	-1.018	-1.6871	3.0647	4.7996	7.5313	-0.1664	0.3081	0.2404	0.1493	-0.2829	0.3252	0.2477	-0.4654	0.4494	0.1875	-0.0207	-0.0316	0.2315	0.0439	0.2857	-22.0066	-26.5314	8.7243
8	1.3653	-0.5717	2.3483	0.3709	-1.2028	4.4123	0.0948	0.0161	-0.0962	-0.0645	0.0222	0.0163	0.2306	-0.0191	-0.1169	0.1596	0.0014	-0.0454	0.2222	-0.0071	0.1416	-10.7462	-38.9506	1.5066
9	0.0353	-0.0504	0.1704	0.9692	-0.4703	3.3829	0.0523	0.0063	-0.0238	-0.0105	0.0853	-0.0126	-0.1798	-0.1916	-0.1375	0.1503	0.0285	-0.0238	0.2172	0.0137	0.1339	-14.0057	-29.2298	-0.9763
10	0.4164	0.6176	-0.6782	3.0037	2.6556	7.5402	0.0161	0.0031	-0.0923	-0.0418	0.2295	-0.364	-0.1229	0.3393	-0.2456	0.0792	0.0064	-0.0007	0.2371	-0.0287	0.1924	-5.3976	-21.3038	0.8977
11	3.0838	-2.0284	0.4807	1.3811	-0.314	0.0756	-0.0829	-0.0763	0.1948	-0.0043	0.0644	-0.2076	-0.0074	-0.0116	0.0185	0.184	-0.0085	0.0126	0.2061	-0.0037	0.2093	-1.1928	-27.9348	11.883
12	0.1898	-0.0015	-0.5802	1.4439	1.945	7.3318	0.0895	0.0338	-0.1252	0.0017	0.163	-0.0361	-0.1714	0.0877	-0.2525	0.1177	0.0199	-0.05	0.2263	-0.0216	0.2108	-7.154	-35.1562	-8.3256
13	5.3673	-0.0569	-0.1049	2.311	-0.5281	1.2302	-0.0032	0.1802	-0.0535	-0.0154	0.0509	0.0866	0.1474	0.0352	-0.0476	0.1935	-0.0234	-0.0371	0.1399	-0.0198	0.1465	-11.1697	-49.892	8.5412
14	0.3989	0.3971	-0.2834	1.5201	-1.1649	1.123	0.0816	-0.054	-0.1325	0.0984	-0.0548	0.0236	-0.0981	-0.067	-0.0268	0.1372	-0.0164	-0.0303	0.202	0.0061	0.1542	-14.6077	-45.6863	27.2796
15	2.1776	0.8179	3.5744	9.201	-4.2142	9.3732	0.1615	-0.1486	0.0557	-0.2302	-0.045	0.3287	0.5268	-0.2608	-0.1165	0.2313	-0.0185	0.0117	0.1562	0.0283	0.1431	-18.7842	-61.1148	33.4876
16	0.1998	0.4868	-0.0377	2.1086	-0.9096	1.1732	0.0679	-0.0298	-0.0078	-0.1263	-0.0454	0.0498	0.0818	-0.1418	-0.0225	0.1838	-0.0196	-0.0506	0.1846	-0.0051	0.1752	-14.275	-48.787	21.8827
17	5.6131	0.4799	0.1753	1.3612	-3.1011	7.426	-0.0246	-0.0511	0.2443	-0.2147	-0.1712	-0.0679	0.6623	0.4197	0.1958	0.4379	0.0824	-0.0629	0.0339	0.0162	0.0992	-7.7206	-60.2114	27.6858
18	0.8994	0.7716	-0.0612	0.7838	-0.2557	0.3579	0.1264	-0.1034	-0.277	0.0499	-0.1536	-0.2301	0.0368	0.1305	0.0273	0.1827	0.0196	-0.0646	0.1553	0.0467	0.2105	-5.6972	-51.4364	24.2185
19	9.0175	-3.4185	-1.6648	1.3047	0.5114	2.4692	0.0459	0.106	-0.3972	-0.006	-0.0211	0.1572	-0.0836	0.0559	-0.0247	0.1648	0.0216	-0.0221	0.1516	0.0019	0.1943	-18.6946	-34.4918	15.8459
20	0.6776	1.3739	-1.1616	3.311	-2.9002	2.5693	-0.129	0.0593	0.2723	0.0147	0.4739	0.4431	-0.0962	-0.4373	-0.345	0.2911	0.1641	-0.0463	0.3162	0.0229	0.2615	-24.9357	-20.1596	26.1917
21	0.3204	0.0854	-0.6469	1.8211	-0.8851	1.6019	-0.0883	0.0512	0.0178	0.0528	0.1631	0.1173	0.1051	-0.1594	-0.0749	0.1398	0.0182	0.0028	0.2189	0.0359	0.1841	-22.9623	-28.8769	27.1842
22	6.3989	-1.8608	-2.7171	1.3414	0.047	1.8527	-0.3108	-0.3556	-0.0673	0.3333	0.1824	-0.0975	-0.1015	0.1224	0.1284	0.1872	0.0413	0.0071	0.2739	-0.0369	0.0396	-15.7884	-31.8544	34.7475
23	0.2909	-0.639	0.3735	1.4477	-0.8361	0.4853	-0.1714	0.0005	0.0505	0.4121	0.0843	-0.1495	-0.2309	-0.0274	0.0871	0.2227	0.0395	0.01	0.1792	-0.0301	0.1528	-16.437	-22.5086	30.8741

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	8 - 25
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	26 - 50
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	51 - 75
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	76 - 91
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	92 - 100
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	101 - 125
7	X-RAY DIFFRACTION	7	B	10 - 21
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	22 - 46
9	X-RAY DIFFRACTION	9	B	47 - 83
10	X-RAY DIFFRACTION	10	B	84 - 97
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	98 - 111
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	112 - 126
13	X-RAY DIFFRACTION	13	C	6 - 15
14	X-RAY DIFFRACTION	14	C	16 - 49
15	X-RAY DIFFRACTION	15	C	50 - 54
16	X-RAY DIFFRACTION	16	C	55 - 79
17	X-RAY DIFFRACTION	17	C	80 - 90
18	X-RAY DIFFRACTION	18	C	91 - 125
19	X-RAY DIFFRACTION	19	D	15 - 19
20	X-RAY DIFFRACTION	20	D	20 - 45
21	X-RAY DIFFRACTION	21	D	46 - 77
22	X-RAY DIFFRACTION	22	D	78 - 95
23	X-RAY DIFFRACTION	23	D	96 - 126

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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