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- PDB-7a5y: Crystal structure of tetrameric human H215A-SAMHD1 (residues 109-... -
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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 7a5y | |||||||||||||||
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Title | Crystal structure of tetrameric human H215A-SAMHD1 (residues 109-626) with Rp-dGTP-alphaS (T8T) and Mg | |||||||||||||||
![]() | Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 | |||||||||||||||
![]() | HYDROLASE / triphosphohydrolase / metallo-enzyme / binuclear / HD | |||||||||||||||
Function / homology | ![]() Nucleotide catabolism / Hydrolases; Acting on ester bonds; Triphosphoric-monoester hydrolases / deoxynucleoside triphosphate hydrolase activity / triphosphoric monoester hydrolase activity / dGTP binding / dATP catabolic process / dGTPase activity / tetraspanin-enriched microdomain / DNA strand resection involved in replication fork processing / deoxyribonucleotide catabolic process ...Nucleotide catabolism / Hydrolases; Acting on ester bonds; Triphosphoric-monoester hydrolases / deoxynucleoside triphosphate hydrolase activity / triphosphoric monoester hydrolase activity / dGTP binding / dATP catabolic process / dGTPase activity / tetraspanin-enriched microdomain / DNA strand resection involved in replication fork processing / deoxyribonucleotide catabolic process / dGTP catabolic process / negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway / regulation of innate immune response / somatic hypermutation of immunoglobulin genes / RNA nuclease activity / double-strand break repair via homologous recombination / Interferon alpha/beta signaling / site of double-strand break / single-stranded DNA binding / protein homotetramerization / defense response to virus / nucleic acid binding / immune response / innate immune response / DNA damage response / GTP binding / RNA binding / zinc ion binding / nucleoplasm / identical protein binding / nucleus / plasma membrane Similarity search - Function | |||||||||||||||
Biological species | ![]() | |||||||||||||||
Method | ![]() ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||
![]() | Morris, E.R. / Kunzelmann, S. / Caswell, S.J. / Purkiss, A. / Taylor, I.A. | |||||||||||||||
Funding support | ![]()
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![]() | ![]() Title: Probing the Catalytic Mechanism and Inhibition of SAMHD1 Using the Differential Properties of R p - and S p -dNTP alpha S Diastereomers. Authors: Morris, E.R. / Kunzelmann, S. / Caswell, S.J. / Purkiss, A.G. / Kelly, G. / Taylor, I.A. | |||||||||||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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Download
PDBx/mmCIF format | ![]() | 1.5 MB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 1.2 MB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 8.6 MB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 8.7 MB | Display | |
Data in XML | ![]() | 130.5 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 174.8 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | ![]() 6tx0S S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Refine code: _
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