温度: 283 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 詳細: 0.02 M phosphate buffer pH 7.5, 27% PEG 8000, 100 mM NaCl
-
データ収集
回折
平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源
由来: 回転陽極 / タイプ: RIGAKU MICROMAX-007 / 波長: 1.54187 Å
検出器
タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2010年1月29日
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.54187 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.793→70.801 Å / Num. obs: 31221 / % possible obs: 96.2 % / 冗長度: 2.8 % / Rpim(I) all: 0.045 / Rrim(I) all: 0.08 / Rsym value: 0.065 / Net I/av σ(I): 8.4 / Net I/σ(I): 9.7
反射 シェル
Diffraction-ID: 1
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Mean I/σ(I) obs
Num. unique obs
Rpim(I) all
Rrim(I) all
Rsym value
% possible all
1.793-1.89
2.5
0.315
2.4
4321
0.226
0.391
0.315
91.8
1.89-2
2.6
0.204
3.7
4476
0.143
0.251
0.204
100
2-2.14
2.7
0.146
5.2
4161
0.103
0.179
0.146
99.6
2.14-2.31
2.7
0.11
6.7
3867
0.078
0.136
0.11
98.6
2.31-2.54
2.8
0.089
8.2
3499
0.063
0.11
0.089
97.4
2.54-2.84
2.9
0.07
9.9
3154
0.049
0.086
0.07
96.1
2.84-3.27
2.9
0.059
11.3
2751
0.041
0.073
0.059
95.2
3.27-4.01
3
0.054
12.1
2287
0.037
0.066
0.054
93.7
4.01-5.67
3
0.041
15.8
1761
0.027
0.049
0.041
92.4
5.67-42.987
3.1
0.031
20.9
944
0.019
0.036
0.031
88.7
-
位相決定
位相決定
手法: 分子置換
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
MOSFLM
データ削減
SCALA
3.3.15
データスケーリング
PHASER
位相決定
REFMAC
5.8.0158
精密化
PDB_EXTRACT
3.25
データ抽出
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: inhouse 解像度: 1.793→70.8 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.93 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.915 / SU B: 5.725 / SU ML: 0.115 / SU R Cruickshank DPI: 0.1759 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.176 / ESU R Free: 0.158 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : WITH TLS ADDED
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2622
1467
5.2 %
RANDOM
Rwork
0.2265
-
-
-
obs
0.2284
26980
87.63 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK