登録情報 | データベース: PDB / ID: 6xi9 |
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タイトル | X-ray crystal structure of MqnE from Pedobacter heparinus in complex with aminofutalosine and methionine |
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要素 | Aminodeoxyfutalosine synthase |
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キーワード | BIOSYNTHETIC PROTEIN / Iron-Sulfur cluster / Radical SAM / menaquinone biosynthesis |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
aminodeoxyfutalosine synthase / aminodeoxyfutalosine synthase activity / menaquinone biosynthetic process / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / iron ion binding類似検索 - 分子機能 FO synthase, subunit 2 / Aminodeoxyfutalosine synthase / F420, menaquinone cofactor biosynthesis / CofH/MqnC-like, C-terminal domain / CofH/MqnC C-terminal region / Radical SAM superfamily / Radical SAM core domain profile. / Radical SAM / Aldolase-type TIM barrel類似検索 - ドメイン・相同性 METHIONINE / IRON/SULFUR CLUSTER / Chem-V47 / Aminodeoxyfutalosine synthase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Pedobacter heparinus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 2.14 Å |
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データ登録者 | Grove, T.L. / Bonanno, J.B. / Almo, S.C. |
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資金援助 | 米国, 4件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID) | R21-AI133329 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM118303-01 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | U54-GM093342 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | U54-GM094662 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2020 タイトル: Narrow-Spectrum Antibiotic Targeting of the Radical SAM Enzyme MqnE in Menaquinone Biosynthesis. 著者: Carl, A.G. / Harris, L.D. / Feng, M. / Nordstrom, L.U. / Gerfen, G.J. / Evans, G.B. / Silakov, A. / Almo, S.C. / Grove, T.L. |
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履歴 | 登録 | 2020年6月19日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2020年7月15日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2020年7月22日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.name |
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改定 1.2 | 2020年7月29日 | Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id |
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改定 1.3 | 2024年3月6日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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