登録情報 データベース : PDB / ID : 6x7u 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal Structure of the Human Nudix Hydrolase Nudt16 in complex with FAD 要素U8 snoRNA-decapping enzyme 詳細 キーワード Hydrolase / RNA BINDING PROTEIN / Nudix / FAD / Decapping機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
inosine diphosphate phosphatase / sno(s)RNA catabolic process / dIDP phosphatase activity / dITP catabolic process / IDP phosphatase activity / positive regulation of cell cycle process / RNA NAD-cap (NMN-forming) hydrolase activity / dITP diphosphatase activity / phosphodiesterase decapping endonuclease activity / negative regulation of rRNA processing ... inosine diphosphate phosphatase / sno(s)RNA catabolic process / dIDP phosphatase activity / dITP catabolic process / IDP phosphatase activity / positive regulation of cell cycle process / RNA NAD-cap (NMN-forming) hydrolase activity / dITP diphosphatase activity / phosphodiesterase decapping endonuclease activity / negative regulation of rRNA processing / NAD-cap decapping / 5'-(N7-methylguanosine 5'-triphospho)-[mRNA] hydrolase / 5'-(N(7)-methylguanosine 5'-triphospho)-[mRNA] hydrolase activity / Phosphate bond hydrolysis by NUDT proteins / metalloexopeptidase activity / chloride ion binding / snoRNA binding / cobalt ion binding / mRNA catabolic process / manganese ion binding / nucleotide binding / mRNA binding / nucleolus / magnesium ion binding / protein homodimerization activity / nucleoplasm / identical protein binding / nucleus / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 : / Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase / Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase / NUDIX domain / Nudix hydrolase domain profile. / NUDIX hydrolase domain / NUDIX hydrolase-like domain superfamily / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE MONOPHOSPHATE / FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE / : / U8 snoRNA-decapping enzyme 類似検索 - 構成要素生物種 Homo sapiens (ヒト)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.7 Å 詳細データ登録者 Hamilton, K. / Tong, L. 資金援助 米国, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 National Institutes of Health/National Center for Complementary and Integrative Health (NIH/NCCIH) R35GM118093 米国
引用ジャーナル : Nucleic Acids Res. / 年 : 2020タイトル : Mammalian Nudix proteins cleave nucleotide metabolite caps on RNAs.著者 : Sharma, S. / Grudzien-Nogalska, E. / Hamilton, K. / Jiao, X. / Yang, J. / Tong, L. / Kiledjian, M. 履歴 登録 2020年5月30日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2020年7月1日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2020年7月22日 Group : Database references / カテゴリ : citationItem : _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last改定 1.2 2023年10月18日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr1_symmetry / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry
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