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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6weq | ||||||
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タイトル | DENV1 NS1 in complex with neutralizing 2B7 Fab fragment | ||||||
要素 |
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キーワード | VIRAL PROTEIN / Flavivirus NS1 / Antibody / Fab fragment | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 symbiont-mediated suppression of host JAK-STAT cascade via inhibition of host TYK2 activity / host cell mitochondrion / symbiont-mediated suppression of host JAK-STAT cascade via inhibition of STAT2 activity / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of MAVS activity / ribonucleoside triphosphate phosphatase activity / double-stranded RNA binding / viral capsid / protein complex oligomerization / monoatomic ion channel activity / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell ...symbiont-mediated suppression of host JAK-STAT cascade via inhibition of host TYK2 activity / host cell mitochondrion / symbiont-mediated suppression of host JAK-STAT cascade via inhibition of STAT2 activity / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of MAVS activity / ribonucleoside triphosphate phosphatase activity / double-stranded RNA binding / viral capsid / protein complex oligomerization / monoatomic ion channel activity / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase activity / mRNA 5'-cap (guanine-N7-)-methyltransferase activity / RNA helicase activity / host cell endoplasmic reticulum membrane / protein dimerization activity / symbiont-mediated suppression of host type I interferon-mediated signaling pathway / induction by virus of host autophagy / viral RNA genome replication / serine-type endopeptidase activity / RNA-dependent RNA polymerase activity / virus-mediated perturbation of host defense response / fusion of virus membrane with host endosome membrane / viral envelope / host cell nucleus / virion attachment to host cell / structural molecule activity / virion membrane / proteolysis / extracellular region / ATP binding / membrane / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Dengue virus 1 (デング熱ウイルス) Mus musculus (ハツカネズミ) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.2 Å | ||||||
データ登録者 | Akey, D.L. / Smith, J.L. | ||||||
資金援助 | 米国, 1件
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引用 | ジャーナル: Science / 年: 2021 タイトル: Structural basis for antibody inhibition of flavivirus NS1-triggered endothelial dysfunction. 著者: Biering, S.B. / Akey, D.L. / Wong, M.P. / Brown, W.C. / Lo, N.T.N. / Puerta-Guardo, H. / Tramontini Gomes de Sousa, F. / Wang, C. / Konwerski, J.R. / Espinosa, D.A. / Bockhaus, N.J. / ...著者: Biering, S.B. / Akey, D.L. / Wong, M.P. / Brown, W.C. / Lo, N.T.N. / Puerta-Guardo, H. / Tramontini Gomes de Sousa, F. / Wang, C. / Konwerski, J.R. / Espinosa, D.A. / Bockhaus, N.J. / Glasner, D.R. / Li, J. / Blanc, S.F. / Juan, E.Y. / Elledge, S.J. / Mina, M.J. / Beatty, P.R. / Smith, J.L. / Harris, E. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 6weq.cif.gz | 1.4 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb6weq.ent.gz | 1006.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 6weq.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 6weq_validation.pdf.gz | 578 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 6weq_full_validation.pdf.gz | 636.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | 6weq_validation.xml.gz | 105.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 6weq_validation.cif.gz | 143.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/we/6weq ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/we/6weq | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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